Evolução da microbiota orofaríngea e retal após lesão cerebral traumática grave (BBAX)
Do cérebro aos insetos: evolução da microbiota orofaríngea e retal de pacientes com traumatismo cranioencefálico grave internados em UTI
Modificações da microbiota intestinal humana têm sido associadas a diferentes condições patológicas, como obesidade, doenças inflamatórias intestinais e doenças neurodegenerativas. Recentemente, foi descrito o "Brain-Gut Axis", um eixo de comunicação bidirecional entre o cérebro e o intestino. Em estudos recentes com animais, uma lesão cerebral aguda foi associada a modificações rápidas da microbiota intestinal.
Em humanos, a lesão cerebral traumática (TCE) é uma das principais causas de morte e incapacidade. Os padrões da microbiota intestinal e orofaríngea após TCE são desconhecidos. O objetivo principal deste estudo é caracterizar a microbiota intestinal e orofaríngea de pacientes com TCE grave.
Visão geral do estudo
Status
Condições
Descrição detalhada
Protocolo de estudo :
Estudo de coorte prospectivo observacional.
Pacientes
Serão incluídos pacientes internados na UTI por trauma grave. Serão estudados dois grupos de pacientes com trauma grave:
- Pacientes com traumatismo cranioencefálico (TCE) grave isolado: TCE com Escala de Coma de Glasgow (GCS) inicial ≤ 8 e escore AISextrahead ≤3
- Pacientes com trauma grave sem TCE (escore AISextrahead > 3)
Um grupo de indivíduos saudáveis servirá como população de controle.
Inscrição total esperada de 20 pacientes em cada grupo e 10 controles saudáveis.
Coleta de dados do paciente
Para cada paciente, os seguintes dados serão coletados:
- Dados demográficos: idade, sexo, altura, peso, data de admissão na UTI, escore simplificado de fisiologia aguda II (SAPS II), escore de gravidade da lesão (ISS), escala abreviada de lesões (AIS) na admissão na UTI.
- Dados relacionados ao trauma: número e tipo de lesões de órgãos relacionadas ao trauma, GCS inicial, presença de midríase no manejo inicial.
- Fatores com potencial impacto na microbiota: terapia antimicrobiana, tipo de nutrição, medicamentos (inibidores da bomba de prótons, opioides, sedações, catecolaminas, corticosteróides), procedimento cirúrgico durante a internação na UTI.
- Evolução: aquisição de bactérias multirresistentes durante a internação na UTI, infecções adquiridas na UTI. Duração da ventilação mecânica, epuração extrarrenal, tempo de internação na UTI, desfecho neurológico avaliado pela escala de classificação de incapacidade (DRS-F) na alta da UTI e 90 dias após o trauma, óbito na alta da UTI e 90 dias.
Coleta de amostras
Swabs orofaríngeos e retais serão realizados para cada paciente nas primeiras 24 horas após a admissão na UTI (dia 0), 48 horas (dia 2) e 7 dias (dia 7) após a admissão na UTI e semanalmente até a alta da UTI. Swabs retais e orofaríngeos serão realizados por equipe paramédica treinada usando swabs estéreis com meio de transporte ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, EUA). Os swabs serão armazenados a -80°C até a extração do DNA.
extração de DNA
A extração de DNA será realizada usando o kit QIAamp PowerFecal Pro DNA® (Qiagen®, Courtaboeuf, França) para swabs retais e o kit Extracta DNA Prep® (Quanta Biosciences®, Beverly, EUA) para swabs orofaríngeos. O DNA será quantificado pelo Quantit® dsDNA HighSensitivity Assay Kit (Fisher Scientific).
Amplificação e sequenciamento do rRNA 16S
As regiões V3 e V4 das sequências do gene 16S rRNA bacteriano serão amplificadas por reação em cadeia da polimerase (PCR) com primers universais (TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG e GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGTATCTAATCC), seguindo o protocolo Illumina MiSeq® System (Illumina®). Os amplicons serão purificados e então sequenciados usando o sistema de sequenciamento MiSeq® ((Illumina®).
Processamento de sequências
O processamento das sequências e agrupamento de unidades taxonômicas operacionais (OTU) serão realizados utilizando o software SHAMAN (SHiny Application for Metagenômica ANalysis) baseado no software R® (pacote DESeq2), fornecido pelo Instituto Pasteur. A classificação taxonômica será realizada usando a referência do banco de dados SILVA.
Análise estatística
A análise estatística será realizada por meio do software SHAMAN (SHiny Application for Metagenômica ANalysis). A repartição de filos, famílias e gêneros bacterianos será analisada, e a abundância relativa de gêneros bacterianos será comparada entre as diferentes populações. A diversidade alfa será analisada usando diferentes parâmetros (índice de Shannon, índice de diversidade de Simpson), bem como a diversidade beta (análise de componentes principais).
As diferentes populações de pacientes e voluntários saudáveis serão comparadas, e a evolução da microbiota ao longo do tempo será estudada.
Tipo de estudo
Inscrição (Real)
Contactos e Locais
Locais de estudo
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-
-
Le Kremlin-Bicetre, França, 94270
- APHP Bicêtre Hospital
-
-
Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
Aceita Voluntários Saudáveis
Método de amostragem
População do estudo
Descrição
Critério de inclusão:
- Admissão no Centro de Trauma do Hospital Bicêtre por trauma grave com:
traumatismo cranioencefálico (TCE) grave isolado: TCE com Escala de Coma de Glasgow (GCS) inicial ≤ 8 e escore AISextrahead ≤3; ou trauma grave sem TCE (escore AISextrahead > 3)
- Tempo estimado de permanência na UTI 48 horas ou mais
Critério de exclusão:
- Terapia antimicrobiana nos últimos 3 meses
- Uso prolongado de corticosteroides
- câncer ativo
- paciente institucionalizado
- Perfuração gastrointestinal ou cirurgia gastrointestinal de emergência após trauma
- Retirada de consentimento
- Paciente sob tutela
- Mulheres grávidas ou amamentando
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
- Modelos de observação: Controle de caso
- Perspectivas de Tempo: Prospectivo
Coortes e Intervenções
Grupo / Coorte |
Intervenção / Tratamento |
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Pacientes com traumatismo cranioencefálico (TCE) grave isolado
TCE com Escala de Coma de Glasgow (GCS) inicial ≤ 8 e escore AISextrahead ≤3.
Swabs orofaríngeos e retais serão realizados para cada paciente nas primeiras 24 horas após a admissão na UTI (dia 0), 48 horas (dia 2) e 7 dias (dia 7) após a admissão na UTI e semanalmente até a alta da UTI.
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Será realizada por equipe paramédica treinada utilizando swabs estéreis com meio de transporte ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, EUA).
Os swabs serão armazenados a -80°C até a extração do DNA.
Será realizada por equipe paramédica treinada utilizando swabs estéreis com meio de transporte ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, EUA).
Os swabs serão armazenados a -80°C até a extração do DNA.
Será avaliado no dia 90 +/- 7 dias.
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Pacientes com trauma grave sem TCE
Pacientes com trauma grave sem TCE (escore AISextrahead > 3).
Swabs orofaríngeos e retais serão realizados para cada paciente nas primeiras 24 horas após a admissão na UTI (dia 0), 48 horas (dia 2) e 7 dias (dia 7) após a admissão na UTI e semanalmente até a alta da UTI.
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Será realizada por equipe paramédica treinada utilizando swabs estéreis com meio de transporte ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, EUA).
Os swabs serão armazenados a -80°C até a extração do DNA.
Será realizada por equipe paramédica treinada utilizando swabs estéreis com meio de transporte ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, EUA).
Os swabs serão armazenados a -80°C até a extração do DNA.
Será avaliado no dia 90 +/- 7 dias.
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Controles Saudáveis
Pessoas que não tiveram as condições que estão sendo estudadas ou outras condições ou sintomas relacionados, conforme especificado nos requisitos de elegibilidade. Os swabs orofaríngeos e retais serão colhidos apenas uma vez, no momento da inclusão, após o que será encerrada a participação do indivíduo controle no ensaio. |
Será realizada por equipe paramédica treinada utilizando swabs estéreis com meio de transporte ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, EUA).
Os swabs serão armazenados a -80°C até a extração do DNA.
Será realizada por equipe paramédica treinada utilizando swabs estéreis com meio de transporte ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, EUA).
Os swabs serão armazenados a -80°C até a extração do DNA.
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O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
|---|---|---|
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Mudança na diversidade alfa da microbiota medida pelo índice de Shannon
Prazo: Do dia 0 ao dia 90
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Os swabs orofaríngeos e retais, realizados no dia 0, dia 2, dia 7 após a admissão na UTI e semanalmente até a alta da UTI ou até o dia 90, serão utilizados para extração de DNA e amplificação e sequenciamento do 16S rRNA bacteriano para identificar as espécies bacterianas que colonizam o intestino.
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Do dia 0 ao dia 90
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Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
|---|---|---|
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Diversidades alfa e beta da microbiota orofaríngea e retal em diferentes momentos pós-trauma.
Prazo: Do dia 0 ao dia 90
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Os swabs orofaríngeos e retais, realizados no dia 0, dia 2, dia 7 após a admissão na UTI e semanalmente até a alta da UTI ou até o dia 90, serão utilizados para extração de DNA e amplificação e sequenciamento do 16S rRNA bacteriano para identificar as espécies bacterianas.
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Do dia 0 ao dia 90
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Infecções Adquiridas na UTI
Prazo: Do dia 0 ao dia 90
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As taxas de infecção adquirida na UTI durante a internação na UTI
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Do dia 0 ao dia 90
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Número de pacientes que adquiriram colonização ou infecção por bactérias multirresistentes durante a internação na UTI
Prazo: Do dia 0 ao dia 90
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Colonização ou infecção por bactérias multirresistentes adquirida durante a internação na UTI
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Do dia 0 ao dia 90
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Óbito na alta da UTI e 90 dias pós-trauma.
Prazo: Do dia 0 ao dia 90
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As taxas de óbitos na alta da UTI e 90 dias após o trauma
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Do dia 0 ao dia 90
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Pontuação da Escala de Classificação de Incapacidade (DRS-F) 90 dias após o trauma
Prazo: Do dia 0 ao dia 90
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Resultado neurológico 90 dias após o trauma avaliado pela Disability Rating Scale, a tradução francesa (DRS-F) cotada de 0 (sem incapacidade) a 29 (estado vegetativo extremo)
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Do dia 0 ao dia 90
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Colaboradores
Investigadores
- Investigador principal: Samy Figueiredo, MD, PhD, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
Conclusão Primária (Real)
Conclusão do estudo (Estimado)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- APHP180537
- 2018-A02973-52 (Outro identificador: IDRCB)
Plano para dados de participantes individuais (IPD)
Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
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