Suunnielun ja peräsuolen mikrobiotan kehitys vakavan traumaattisen aivovaurion jälkeen (BBAX)
Aivoista bugeihin: teho-osastolle otettujen potilaiden suunnielun ja peräsuolen mikrobiotan kehitys, jos potilaalla on vakava traumaattinen aivovamma
Ihmisen suoliston mikrobiotan muutokset on yhdistetty erilaisiin patologisiin tiloihin, kuten liikalihavuuteen, tulehduksellisiin suolistosairauksiin ja hermostoa rappeutuviin sairauksiin. Äskettäin on kuvattu "Brain-Gut Axis", joka on kaksisuuntainen viestintäakseli aivojen ja suoliston välillä. Viimeaikaisissa eläinkokeissa akuutti aivovamma on yhdistetty suolen mikrobiotan nopeisiin muutoksiin.
Traumaattinen aivovaurio (TBI) on ihmisillä yleisin kuolinsyy ja vamma. Suolen ja suun ja nielun mikrobiston kuvioita TBI:n jälkeen ei tunneta. Tämän tutkimuksen ensisijainen tarkoitus on karakterisoida suoliston ja suun ja nielun mikrobiota potilailla, joilla on vaikea TBI.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Tutkimuspöytäkirja:
Havainnollinen prospektiivinen kohorttitutkimus.
Potilaat
Mukaan otetaan potilaat, jotka on otettu teho-osastolle vakavien traumojen vuoksi. Tutkitaan kahta potilasryhmää, joilla on vakava trauma:
- Potilaat, joilla on yksittäinen vakava traumaattinen aivovamma (TBI): TBI, jonka alkuperäinen Glasgow'n koomaasteikko (GCS) ≤ 8 ja AISextrahead pisteet ≤ 3
- Potilaat, joilla on vakava trauma ilman TBI:tä (AISextrahead-pisteet > 3)
Ryhmä terveitä yksilöitä toimii kontrollipopulaationa.
Odotettu yhteensä 20 potilasta jokaisessa ryhmässä ja 10 tervettä kontrollia.
Potilastietojen kerääminen
Jokaisesta potilaasta kerätään seuraavat tiedot:
- Demografiset tiedot: ikä, sukupuoli, pituus, paino, teho-osastolle tulopäivä, yksinkertaistettu akuutin fysiologian pistemäärä II (SAPS II), vamman vakavuuspisteet (ISS), lyhennetty vamma-asteikko (AIS) teho-osastolle saapuessa.
- Traumaan liittyvät tiedot: traumaan liittyvien elinvammojen lukumäärä ja tyyppi, ensimmäinen GCS, mydriaasin esiintyminen alkuhoidon yhteydessä.
- Mikrobiotaan mahdollisesti vaikuttavat tekijät: antimikrobinen hoito, ravitsemustyyppi, lääkkeet (protonipumpun estäjät, opioidit, sedaatiot, katekoliamiinit, steroidit), kirurginen toimenpide teho-osaston aikana.
- Evoluutio: useille lääkkeille resistenttien bakteerien hankkiminen teho-osaston aikana, teho-osastolla hankitut infektiot. Mekaanisen ventilaation kesto, munuaisten ulkopuolinen epuraatio, tehoosaston oleskelun kesto, neurologinen tulos arvioituna vammaisuusasteikkoasteikolla (DRS-F) tehoosaston kotiuttamisen yhteydessä ja 90 päivää trauman jälkeen, kuolema teho-osaston kotiutuksen yhteydessä ja 90 päivää.
Näytekokoelma
Suunielun ja peräsuolen pyyhkäisynäytteet otetaan kullekin potilaalle ensimmäisten 24 tunnin aikana teho-osastolle saapumisen jälkeen (päivä 0), sitten 48 tuntia (päivä 2) ja 7 päivää (päivä 7) teho-osastolle saapumisen jälkeen ja sen jälkeen viikoittain teho-osastolle pääsyn jälkeen. Peräsuolen ja suunnielun pyyhkäisynäytteet tekee koulutettu ensihoitajahenkilöstö käyttäen steriilejä vanupuikkoja ESwab®-kuljetusväliaineella (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA). Vanupuikkoja säilytetään -80 °C:ssa DNA-uuttoon asti.
DNA:n uuttaminen
DNA-uutto suoritetaan käyttämällä QIAamp PowerFecal Pro DNA® -pakkausta (Qiagen®, Courtaboeuf, Ranska) peräsuolen vanupuikkoja varten ja Extracta DNA Prep® -pakkausta (Quanta Biosciences®, Beverly, USA) suunielun vanupuikkoja varten. DNA kvantifioidaan Quantit® dsDNA HighSensitivity Assay Kitillä (Fisher Scientific).
16S rRNA:n monistus ja sekvensointi
Bakteerien 16S-rRNA-geenisekvenssien V3- ja V4-alueet monistetaan polymeraasiketjureaktiolla (PCR) universaaleilla alukkeilla (TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGGCWGCAG ja GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTGTATAAGAGACAGGACTATCGGAGATGTGTGTATAAGAGACAGGACTATCGGAGATGTGTGTATAAGAGACAGGACTATCGGAGATGTGTGTATAAGACAGGACTATCGGAGATGTGTGTATAAGACAGGACTATCGGAGATGTGGGGGGGCWGACAGCCTACGGGGCWGCAGCAGCTACGGGNGGCWGGCAG ja GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTGTATAAGAGACAGGACTATC). Amplikonit puhdistetaan ja sekvensoidaan käyttämällä MiSeq®-sekvensointijärjestelmää ((Illumina®).
Sekvenssien käsittely
Sekvenssien käsittely ja operatiivisen taksonomisen yksikön (OTU) klusterointi suoritetaan SHAMAN-ohjelmistolla (SHiny Application for Metagenomic ANalysis), joka perustuu R®-ohjelmistoon (paketti DESeq2), jonka toimittaa Pasteur Institute. Taksonominen luokittelu suoritetaan käyttämällä SILVA-tietokantaviittausta.
Tilastollinen analyysi
Tilastollinen analyysi suoritetaan SHAMAN-ohjelmistolla (SHiny Application for Metagenomic ANalysis). Bakteerien fyla, perheet ja sukujen jakautuminen analysoidaan ja bakteerisukujen suhteellista runsautta verrataan eri populaatioiden välillä. Alfa-diversiteettiä analysoidaan eri parametreillä (Shannon-indeksi, Simpsonin diversiteettiindeksi) sekä beeta-diversiteetti (pääkomponenttianalyysi).
Potilaiden ja terveiden vapaaehtoisten eri populaatioita verrataan ja mikrobiotan kehitystä ajan mittaan tutkitaan.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
-
Le Kremlin-Bicetre, Ranska, 94270
- APHP Bicêtre Hospital
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Pääsy Bicêtren sairaalan traumakeskukseen vakavan trauman vuoksi:
joko eristetty vakava traumaattinen aivovaurio (TBI): TBI, jonka alkuperäinen Glasgow Coma Scale (GCS) ≤ 8 ja AISextrahead-pistemäärä ≤ 3; joko vakava trauma ilman TBI:tä (AISextrahead pisteet > 3)
- ICU-hoidon arvioitu kesto 48 tuntia tai enemmän
Poissulkemiskriteerit:
- Antimikrobinen hoito viimeisten 3 kuukauden aikana
- Pitkäaikainen kortikosteroidien käyttö
- Aktiivinen syöpä
- Laitospotilas
- Ruoansulatuskanavan perforaatio tai kiireellinen maha-suolikanavan leikkaus trauman jälkeen
- Suostumuksen peruuttaminen
- Potilas edunvalvojana
- Raskaana olevat tai imettävät naiset
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Case-Control
- Aikanäkymät: Tulevaisuuden
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Potilaat, joilla on yksittäinen vakava traumaattinen aivovaurio (TBI)
TBI, jonka alkuperäinen Glasgow Coma Scale (GCS) -asteikko on ≤ 8 ja AISextrahead -pistemäärä ≤3.
Suunielun ja peräsuolen pyyhkäisynäytteet otetaan kullekin potilaalle ensimmäisten 24 tunnin aikana teho-osastolle saapumisen jälkeen (päivä 0), sitten 48 tuntia (päivä 2) ja 7 päivää (päivä 7) teho-osastolle saapumisen jälkeen ja sen jälkeen viikoittain teho-osastolle pääsyn jälkeen.
|
Sen suorittaa koulutettu ensihoitohenkilöstö käyttämällä steriilejä vanupuikkoja ESwab®-kuljetusväliaineella (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA).
Vanupuikkoja säilytetään -80 °C:ssa DNA-uuttoon asti.
Sen suorittaa koulutettu ensihoitohenkilöstö käyttämällä steriilejä vanupuikkoja ESwab®-kuljetusväliaineella (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA).
Vanupuikkoja säilytetään -80 °C:ssa DNA-uuttoon asti.
Arvioidaan päivänä 90 +/- 7 päivää.
|
|
Potilaat, joilla on vakava trauma ilman TBI:tä
Potilaat, joilla on vakava trauma ilman TBI:tä (AISextrahead-pistemäärä > 3).
Suunielun ja peräsuolen pyyhkäisynäytteet otetaan kullekin potilaalle ensimmäisten 24 tunnin aikana teho-osastolle saapumisen jälkeen (päivä 0), sitten 48 tuntia (päivä 2) ja 7 päivää (päivä 7) teho-osastolle saapumisen jälkeen ja sen jälkeen viikoittain teho-osastolle pääsyn jälkeen.
|
Sen suorittaa koulutettu ensihoitohenkilöstö käyttämällä steriilejä vanupuikkoja ESwab®-kuljetusväliaineella (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA).
Vanupuikkoja säilytetään -80 °C:ssa DNA-uuttoon asti.
Sen suorittaa koulutettu ensihoitohenkilöstö käyttämällä steriilejä vanupuikkoja ESwab®-kuljetusväliaineella (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA).
Vanupuikkoja säilytetään -80 °C:ssa DNA-uuttoon asti.
Arvioidaan päivänä 90 +/- 7 päivää.
|
|
Terveelliset kontrollit
Henkilöt, joilla ei ole ollut kelpoisuusvaatimuksen mukaisia tutkittavia tai muuten niihin liittyviä tiloja tai oireita. Suunielun ja peräsuolen pyyhkäisynäytteet otetaan vain kerran, mukaan ottamisen yhteydessä, jonka jälkeen kontrollihenkilön osallistuminen tutkimukseen päättyy. |
Sen suorittaa koulutettu ensihoitohenkilöstö käyttämällä steriilejä vanupuikkoja ESwab®-kuljetusväliaineella (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA).
Vanupuikkoja säilytetään -80 °C:ssa DNA-uuttoon asti.
Sen suorittaa koulutettu ensihoitohenkilöstö käyttämällä steriilejä vanupuikkoja ESwab®-kuljetusväliaineella (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA).
Vanupuikkoja säilytetään -80 °C:ssa DNA-uuttoon asti.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Muutos mikrobiotan alfa-monimuotoisuudessa Shannon-indeksillä mitattuna
Aikaikkuna: Päivästä 0 päivään 90
|
Suunielun ja peräsuolen pyyhkäisynäytteitä, jotka on otettu päivänä 0, päivänä 2, päivänä 7 tehoosastolle saapumisen jälkeen ja sen jälkeen viikoittain tehoosaston kotiuttamiseen saakka tai viimeistään päivään 90, käytetään DNA:n erottamiseen ja bakteerien 16S rRNA:n monistamiseen ja sekvensointiin tunnistamiseksi. suolistossa kolonisoivat bakteerilajit.
|
Päivästä 0 päivään 90
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Suunielun ja peräsuolen mikrobiotan alfa- ja beeta-monimuotoisuus eri aikoina trauman jälkeen.
Aikaikkuna: Päivästä 0 päivään 90
|
Suunielun ja peräsuolen pyyhkäisynäytteitä, jotka on otettu päivänä 0, päivänä 2, päivänä 7 tehoosastolle saapumisen jälkeen ja sen jälkeen viikoittain tehoosaston kotiuttamiseen saakka tai viimeistään päivään 90, käytetään DNA:n erottamiseen ja bakteerien 16S rRNA:n monistamiseen ja sekvensointiin tunnistamiseksi. bakteerilajeja.
|
Päivästä 0 päivään 90
|
|
ICU:ssa saadut infektiot
Aikaikkuna: Päivästä 0 päivään 90
|
Tehoosastolla hankittujen infektioiden määrä teho-osaston aikana
|
Päivästä 0 päivään 90
|
|
Potilaiden lukumäärä, jotka ovat saaneet kolonisaation tai infektion monilääkeresistenttien bakteerien kanssa teho-osaston aikana
Aikaikkuna: Päivästä 0 päivään 90
|
Monilääkkeille resistenttien bakteerien kolonisaatio tai infektio, joka on saatu teho-osaston aikana
|
Päivästä 0 päivään 90
|
|
Kuolema teho-osastolla ja 90 päivää trauman jälkeen.
Aikaikkuna: Päivästä 0 päivään 90
|
Kuolemien määrä teho-osaston kotiutuksessa ja 90 päivää trauman jälkeen
|
Päivästä 0 päivään 90
|
|
Vammaisluokitusasteikon (DRS-F) pisteet 90 päivää trauman jälkeen
Aikaikkuna: Päivästä 0 päivään 90
|
Neurologinen tulos 90 päivää trauman jälkeen arvioituna Disability Rating Scale -asteikolla, ranskankielinen käännös (DRS-F) lainattu 0:sta (ei vammaisuutta) 29:ään (äärimmäinen vegetatiivinen tila)
|
Päivästä 0 päivään 90
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Samy Figueiredo, MD, PhD, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- APHP180537
- 2018-A02973-52 (Muu tunniste: IDRCB)
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .