Эволюция ротоглоточной и ректальной микробиоты после тяжелой черепно-мозговой травмы (BBAX)
От мозга к жукам: эволюция ротоглоточной и ректальной микробиоты у пациентов с тяжелой черепно-мозговой травмой, поступивших в отделение интенсивной терапии
Модификации микробиоты кишечника человека связаны с различными патологическими состояниями, такими как ожирение, воспалительные заболевания кишечника и нейродегенеративные заболевания. Недавно была описана «ось мозг-кишка», двунаправленная ось связи между мозгом и кишечником. В недавних исследованиях на животных острая травма головного мозга была связана с быстрыми изменениями микробиоты кишечника.
У людей черепно-мозговая травма (ЧМТ) является основной причиной смерти и инвалидности. Паттерны микробиоты кишечника и ротоглотки после ЧМТ неизвестны. Основная цель этого исследования — охарактеризовать кишечную и ротоглоточную микробиоту пациентов с тяжелой ЧМТ.
Обзор исследования
Статус
Подробное описание
Протокол исследования:
Обсервационное проспективное когортное исследование.
Пациенты
Будут включены пациенты, поступившие в отделение интенсивной терапии с тяжелой травмой. Будут изучены две группы пациентов с тяжелой травмой:
- Пациенты с изолированной тяжелой черепно-мозговой травмой (ЧМТ): ЧМТ с исходным баллом по шкале комы Глазго (ШКГ) ≤ 8 и баллом по шкале AISextrahead ≤3
- Пациенты с тяжелой травмой без ЧМТ (оценка AISextrahead > 3)
Группа здоровых людей будет служить контрольной популяцией.
Ожидается, что общее число пациентов в каждой группе составит 20, а в контрольной группе — 10 здоровых.
Сбор данных пациента
Для каждого пациента будут собраны следующие данные:
- Демографические данные: возраст, пол, рост, вес, дата поступления в отделение интенсивной терапии, упрощенная оценка острого физиологического состояния II (SAPS II), оценка тяжести травмы (ISS), сокращенная шкала травм (AIS) при поступлении в отделение интенсивной терапии.
- Данные, связанные с травмой: количество и тип связанных с травмой повреждений органов, начальная ГКС, наличие мидриаза при первоначальном лечении.
- Факторы с потенциальным влиянием на микробиоту: антимикробная терапия, тип питания, лекарственные препараты (ингибиторы протонной помпы, опиоиды, седативные средства, катехоламины, стероиды), хирургическое вмешательство в период пребывания в отделении интенсивной терапии.
- Эволюция: приобретение бактерий с множественной лекарственной устойчивостью во время пребывания в отделении интенсивной терапии, приобретенные инфекции в отделении интенсивной терапии. Продолжительность ИВЛ, внепочечная эпурация, продолжительность пребывания в ОРИТ, неврологический исход, оцененный по шкале оценки инвалидности (DRS-F) при выписке из ОРИТ и через 90 дней после травмы, смерть при выписке из ОРИТ и через 90 дней.
Сбор образцов
Мазки из ротоглотки и прямой кишки будут выполняться для каждого пациента в течение первых 24 часов после поступления в отделение интенсивной терапии (день 0), затем через 48 часов (день 2) и 7 дней (день 7) после поступления в отделение интенсивной терапии, а затем еженедельно до выписки из отделения интенсивной терапии. Ректальные и ротоглоточные мазки будут выполняться обученным парамедицинским персоналом с использованием стерильных мазков с транспортной средой ESwab® (Becton, Dickinson and Company, Нью-Джерси, США). Тампоны будут хранить при температуре -80°C до выделения ДНК.
экстракция ДНК
Выделение ДНК будет проводиться с использованием набора QIAamp PowerFecal Pro DNA® (Qiagen®, Courtaboeuf, France) для ректальных мазков и набора Extracta DNA Prep® (Quanta Biosciences®, Беверли, США) для мазков из ротоглотки. ДНК будет количественно определена с помощью набора для анализа Quantit® dsDNA HighSensitivity Assay Kit (Fisher Scientific).
Амплификация и секвенирование 16S рРНК
Области V3 и V4 последовательностей бактериального гена 16S рРНК будут амплифицировать с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) с универсальными праймерами (TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG и GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGTATCTAATCC), следуя протоколу Illumina MiSeq® System (Illumina®). Ампликоны будут очищены, а затем секвенированы с использованием системы секвенирования MiSeq® ((Illumina®).
Обработка последовательностей
Обработка последовательностей и кластеризация операционных таксономических единиц (OTU) будут выполняться с использованием программного обеспечения SHAMAN (приложение SHiny для метагеномного анализа) на основе программного обеспечения R® (пакет DESeq2), предоставленного Институтом Пастера. Таксономическая классификация будет выполняться с использованием ссылки на базу данных SILVA.
статистический анализ
Статистический анализ будет проводиться с использованием программного обеспечения SHAMAN (приложение SHiny для метагеномного анализа). Будут проанализированы бактериальные типы, семейства и перераспределение родов, а относительная численность бактериальных родов будет сравнена между различными популяциями. Альфа-разнообразие будет анализироваться с использованием различных параметров (индекс Шеннона, индекс разнообразия Симпсона), а также бета-разнообразие (анализ главных компонент).
Будут сравниваться разные популяции пациентов и здоровых добровольцев, и будет изучаться эволюция микробиоты во времени.
Тип исследования
Регистрация (Действительный)
Контакты и местонахождение
Места учебы
-
-
-
Le Kremlin-Bicetre, Франция, 94270
- APHP Bicêtre Hospital
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
Принимает здоровых добровольцев
Метод выборки
Исследуемая популяция
Описание
Критерии включения:
- Госпитализация в травматологический центр больницы Бисетр при тяжелой травме с:
либо изолированная тяжелая черепно-мозговая травма (ЧМТ): ЧМТ с исходной шкалой комы Глазго (ШКГ) ≤ 8 и баллом AISextrahead ≤3; либо тяжелая травма без ЧМТ (оценка AISextrahead > 3)
- Предполагаемая продолжительность пребывания в отделении интенсивной терапии 48 часов или более
Критерий исключения:
- Антимикробная терапия в течение предшествующих 3 мес.
- Длительное применение кортикостероидов
- Активный рак
- Институционализированный пациент
- Перфорация желудочно-кишечного тракта или неотложная хирургия желудочно-кишечного тракта после травмы
- Отзыв согласия
- Пациент под опекой
- Беременные или кормящие женщины
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Наблюдательные модели: Кейс-контроль
- Временные перспективы: Перспективный
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Пациенты с изолированной тяжелой черепно-мозговой травмой (ЧМТ)
ЧМТ с исходной шкалой комы Глазго (GCS) ≤ 8 и оценкой AISExtrahead ≤3.
Мазки из ротоглотки и прямой кишки будут выполняться для каждого пациента в течение первых 24 часов после поступления в отделение интенсивной терапии (день 0), затем через 48 часов (день 2) и 7 дней (день 7) после поступления в отделение интенсивной терапии, а затем еженедельно до выписки из отделения интенсивной терапии.
|
Будет выполняться обученным парамедицинским персоналом с использованием стерильных тампонов с транспортной средой ESwab® (Becton, Dickinson and Company, Нью-Джерси, США).
Тампоны будут хранить при температуре -80°C до выделения ДНК.
Будет выполняться обученным парамедицинским персоналом с использованием стерильных тампонов с транспортной средой ESwab® (Becton, Dickinson and Company, Нью-Джерси, США).
Тампоны будут хранить при температуре -80°C до выделения ДНК.
Будет оцениваться на 90 день +/- 7 дней.
|
|
Пациенты с тяжелой травмой без ЧМТ
Пациенты с тяжелой травмой без ЧМТ (оценка AIExtrahead > 3).
Мазки из ротоглотки и прямой кишки будут выполняться для каждого пациента в течение первых 24 часов после поступления в отделение интенсивной терапии (день 0), затем через 48 часов (день 2) и 7 дней (день 7) после поступления в отделение интенсивной терапии, а затем еженедельно до выписки из отделения интенсивной терапии.
|
Будет выполняться обученным парамедицинским персоналом с использованием стерильных тампонов с транспортной средой ESwab® (Becton, Dickinson and Company, Нью-Джерси, США).
Тампоны будут хранить при температуре -80°C до выделения ДНК.
Будет выполняться обученным парамедицинским персоналом с использованием стерильных тампонов с транспортной средой ESwab® (Becton, Dickinson and Company, Нью-Джерси, США).
Тампоны будут хранить при температуре -80°C до выделения ДНК.
Будет оцениваться на 90 день +/- 7 дней.
|
|
Здоровый контроль
Лица, у которых не было изучаемых состояний или иных связанных состояний или симптомов, как указано в квалификационных требованиях. Ротоглоточный и ректальный мазки будут браться только один раз, при включении, после чего участие контрольного лица в исследовании будет завершено. |
Будет выполняться обученным парамедицинским персоналом с использованием стерильных тампонов с транспортной средой ESwab® (Becton, Dickinson and Company, Нью-Джерси, США).
Тампоны будут хранить при температуре -80°C до выделения ДНК.
Будет выполняться обученным парамедицинским персоналом с использованием стерильных тампонов с транспортной средой ESwab® (Becton, Dickinson and Company, Нью-Джерси, США).
Тампоны будут хранить при температуре -80°C до выделения ДНК.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Изменение альфа-разнообразия микробиоты по индексу Шеннона
Временное ограничение: С 0 по 90 день
|
Мазки из ротоглотки и прямой кишки, взятые на 0-й, 2-й и 7-й день после поступления в ОИТ, а затем еженедельно до выписки из ОИТ или не позднее 90-го дня, будут использоваться для выделения ДНК, амплификации и секвенирования бактериальной 16S рРНК с целью выявления бактериальные виды, колонизирующие кишечник.
|
С 0 по 90 день
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Альфа- и бета-разнообразие ротоглоточной и ректальной микробиоты в разное время после травмы.
Временное ограничение: С 0 по 90 день
|
Мазки из ротоглотки и прямой кишки, взятые на 0-й, 2-й и 7-й день после поступления в ОИТ, а затем еженедельно до выписки из ОИТ или не позднее 90-го дня, будут использоваться для выделения ДНК, амплификации и секвенирования бактериальной 16S рРНК с целью выявления виды бактерий.
|
С 0 по 90 день
|
|
Инфекции, приобретенные в отделении интенсивной терапии
Временное ограничение: С 0 по 90 день
|
Уровень инфицирования в отделении интенсивной терапии во время пребывания в отделении интенсивной терапии
|
С 0 по 90 день
|
|
Количество пациентов с колонизацией или инфекцией бактериями с множественной лекарственной устойчивостью во время пребывания в отделении интенсивной терапии
Временное ограничение: С 0 по 90 день
|
Колонизация бактерий с множественной лекарственной устойчивостью или инфекция, приобретенная во время пребывания в отделении интенсивной терапии.
|
С 0 по 90 день
|
|
Смерть при выписке из реанимации и через 90 дней после травмы.
Временное ограничение: С 0 по 90 день
|
Смертность при выписке из отделения интенсивной терапии и через 90 дней после травмы
|
С 0 по 90 день
|
|
Шкала оценки инвалидности (DRS-F) через 90 дней после травмы
Временное ограничение: С 0 по 90 день
|
Неврологический исход через 90 дней после травмы, оцениваемый по Шкале оценки инвалидности, перевод на французский язык (DRS-F) с оценкой от 0 (нет инвалидности) до 29 (крайнее вегетативное состояние)
|
С 0 по 90 день
|
Соавторы и исследователи
Соавторы
Следователи
- Главный следователь: Samy Figueiredo, MD, PhD, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Первичное завершение (Действительный)
Завершение исследования (Оцененный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- APHP180537
- 2018-A02973-52 (Другой идентификатор: IDRCB)
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .