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Evolution der oropharyngealen und rektalen Mikrobiota nach schwerer traumatischer Hirnverletzung (BBAX)

29. Mai 2024 aktualisiert von: Assistance Publique - Hôpitaux de Paris

Vom Gehirn zu den Käfern: Entwicklung der oropharyngealen und rektalen Mikrobiota von Patienten mit schwerer traumatischer Hirnverletzung, die auf der Intensivstation aufgenommen wurden

Veränderungen der menschlichen Darmmikrobiota wurden mit verschiedenen pathologischen Zuständen wie Fettleibigkeit, entzündlichen Darmerkrankungen und neurodegenerativen Erkrankungen in Verbindung gebracht. Kürzlich wurde die „Brain-Gut Axis“, eine bidirektionale Kommunikationsachse zwischen Gehirn und Darm, beschrieben. In kürzlich durchgeführten Tierstudien wurde eine akute Hirnverletzung mit schnellen Veränderungen der Darmmikrobiota in Verbindung gebracht.

Beim Menschen ist ein Schädel-Hirn-Trauma (TBI) eine der Hauptursachen für Tod und Invalidität. Die Muster der Darm- und oropharyngealen Mikrobiota nach TBI sind unbekannt. Der Hauptzweck dieser Studie ist die Charakterisierung der Darm- und oropharyngealen Mikrobiota von Patienten mit schwerem SHT.

Studienübersicht

Status

Aktiv, nicht rekrutierend

Bedingungen

Intervention / Behandlung

Detaillierte Beschreibung

Studienprotokoll :

Beobachtende prospektive Kohortenstudie.

Patienten

Patienten, die aufgrund eines schweren Traumas auf der Intensivstation aufgenommen wurden, werden eingeschlossen. Zwei Gruppen von Patienten mit schwerem Trauma werden untersucht:

  1. Patienten mit isoliertem schwerem Schädel-Hirn-Trauma (TBI): TBI mit anfänglicher Glasgow Coma Scale (GCS) ≤ 8 und AISextrahead-Score ≤ 3
  2. Patienten mit schwerem Trauma ohne SHT (AISextrahead-Score > 3)

Als Kontrollpopulation dient eine Gruppe gesunder Individuen.

Erwartete Gesamteinschreibung 20 Patienten in jeder Gruppe und 10 gesunde Kontrollen.

Erhebung von Patientendaten

Für jeden Patienten werden folgende Daten erhoben:

  • Demografische Daten: Alter, Geschlecht, Größe, Gewicht, Aufnahmedatum auf der Intensivstation, vereinfachter akuter Physiologie-Score II (SAPS II), Verletzungsschwere-Score (ISS), abgekürzte Verletzungsskala (AIS) bei Aufnahme auf der Intensivstation.
  • Traumabezogene Daten: Anzahl und Art der traumabezogenen Organverletzungen, anfängliches GCS, Vorhandensein von Mydriasis bei der anfänglichen Behandlung.
  • Faktoren mit potenziellen Auswirkungen auf die Mikrobiota: antimikrobielle Therapie, Ernährungstyp, Medikamente (Protonenpumpenhemmer, Opioide, Sedierung, Katecholamine, Steroide), chirurgischer Eingriff während des Aufenthalts auf der Intensivstation.
  • Evolution: Erwerb multiresistenter Bakterien während des Aufenthalts auf der Intensivstation, auf der Intensivstation erworbene Infektionen. Dauer der mechanischen Beatmung, extrarenale Ausscheidung, Aufenthaltsdauer auf der Intensivstation, neurologisches Ergebnis, bewertet anhand der Disability Rating Scale (DRS-F) bei Entlassung aus der Intensivstation und 90 Tage nach Trauma, Tod bei Entlassung aus der Intensivstation und 90 Tage.

Beispielsammlung

Oropharyngeale und rektale Abstriche werden bei jedem Patienten innerhalb der ersten 24 Stunden nach Aufnahme auf der Intensivstation (Tag 0), dann 48 Stunden (Tag 2) und 7 Tage (Tag 7) nach Aufnahme auf der Intensivstation und danach wöchentlich bis zur Entlassung aus der Intensivstation durchgeführt. Rektal- und Oropharynxabstriche werden von geschultem medizinischem Personal mit sterilen Tupfern mit Transportmedium ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA) durchgeführt. Die Abstriche werden bis zur DNA-Extraktion bei -80 °C gelagert.

DNA-Extraktion

Die DNA-Extraktion wird mit dem QIAamp PowerFecal Pro DNA®-Kit (Qiagen®, Courtaboeuf, Frankreich) für rektale Abstriche und dem Extracta DNA Prep®-Kit (Quanta Biosciences®, Beverly, USA) für oropharyngeale Abstriche durchgeführt. Die DNA wird mit dem Quantit® dsDNA HighSensitivity Assay Kit (Fisher Scientific) quantifiziert.

16S-rRNA-Amplifikation und -Sequenzierung

Die V3- und V4-Regionen der bakteriellen 16S-rRNA-Gensequenzen werden durch Polymerase-Kettenreaktion (PCR) mit universellen Primern (TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG und GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGTATCTAATCC) gemäß dem Illumina MiSeq®-Systemprotokoll (Illumina®) amplifiziert. Amplikons werden gereinigt und dann mit dem MiSeq®-Sequenzierungssystem ((Illumina®) sequenziert.

Verarbeitung von Sequenzen

Sequenzverarbeitung und Operational Taxonomic Unit (OTU)-Clustering werden mit der SHAMAN-Software (SHiny Application for Metagenomic ANalysis) basierend auf der R®-Software (Paket DESeq2) durchgeführt, die vom Pasteur Institute bereitgestellt wird. Die taxonomische Klassifizierung wird unter Verwendung der SILVA-Datenbankreferenz durchgeführt.

statistische Analyse

Die statistische Analyse wird mit der SHAMAN-Software (SHiny Application for Metagenomic ANalysis) durchgeführt. Die Verteilung von Bakterienstämmen, Familien und Gattungen wird analysiert, und die relative Häufigkeit von Bakteriengattungen wird zwischen den verschiedenen Populationen verglichen. Die Alpha-Diversität wird anhand verschiedener Parameter (Shannon-Index, Simpson-Diversitätsindex) sowie die Beta-Diversität (Hauptkomponentenanalyse) analysiert.

Die verschiedenen Populationen von Patienten und gesunden Probanden werden verglichen und die Entwicklung der Mikrobiota im Laufe der Zeit untersucht.

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Tatsächlich)

58

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienorte

  • Frankreich
      • Le Kremlin-Bicetre, Frankreich, 94270
        • APHP Bicêtre Hospital

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

14 Jahre und älter (Erwachsene, Älterer Erwachsener)

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Ja

Probenahmeverfahren

Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe

Studienpopulation

Patienten, die 18 Jahre oder älter sind und aufgrund eines schweren Traumas auf der Intensivstation aufgenommen wurden.

Beschreibung

Einschlusskriterien:

  • Aufnahme in das Traumazentrum des Bicêtre-Krankenhauses für schweres Trauma mit:

entweder isoliertes schweres Schädel-Hirn-Trauma (TBI): TBI mit anfänglicher Glasgow Coma Scale (GCS) ≤ 8 und AISextrahead-Score ≤ 3; entweder schweres Trauma ohne SHT (AISextrahead-Score > 3)

  • Geschätzte Aufenthaltsdauer auf der Intensivstation 48 Stunden oder mehr

Ausschlusskriterien:

  • Antimikrobielle Therapie innerhalb der letzten 3 Monate
  • Langzeitanwendung von Kortikosteroiden
  • Aktiver Krebs
  • Institutionalisierter Patient
  • Magen-Darm-Perforation oder Notfall-Magen-Darm-Operation nach einem Trauma
  • Widerruf der Einwilligung
  • Patient unter Vormundschaft
  • Schwangere oder stillende Frauen

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

  • Beobachtungsmodelle: Fallkontrolle
  • Zeitperspektiven: Interessent

Kohorten und Interventionen

Gruppe / Kohorte
Intervention / Behandlung
Patienten mit isoliertem schwerem Schädel-Hirn-Trauma (SHT)
TBI mit anfänglicher Glasgow Coma Scale (GCS) ≤ 8 und AISextrahead-Score ≤ 3. Oropharyngeale und rektale Abstriche werden bei jedem Patienten innerhalb der ersten 24 Stunden nach Aufnahme auf der Intensivstation (Tag 0), dann 48 Stunden (Tag 2) und 7 Tage (Tag 7) nach Aufnahme auf der Intensivstation und danach wöchentlich bis zur Entlassung aus der Intensivstation durchgeführt.
Verfahren: Oropharyngealer Abstrich
Wird von geschultem medizinischem Personal mit sterilen Tupfern mit Transportmedium ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA) durchgeführt. Die Abstriche werden bis zur DNA-Extraktion bei -80 °C gelagert.
Verfahren: Rektalabstrich
Wird von geschultem medizinischem Personal mit sterilen Tupfern mit Transportmedium ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA) durchgeführt. Die Abstriche werden bis zur DNA-Extraktion bei -80 °C gelagert.
Verfahren: Bewertungsskala für Behinderung (DRS-F)
Wird am 90. Tag +/- 7 Tage beurteilt.
Patienten mit schwerem Trauma ohne SHT
Patienten mit schwerem Trauma ohne TBI (AISextrahead-Score > 3). Oropharyngeale und rektale Abstriche werden bei jedem Patienten innerhalb der ersten 24 Stunden nach Aufnahme auf der Intensivstation (Tag 0), dann 48 Stunden (Tag 2) und 7 Tage (Tag 7) nach Aufnahme auf der Intensivstation und danach wöchentlich bis zur Entlassung aus der Intensivstation durchgeführt.
Verfahren: Oropharyngealer Abstrich
Wird von geschultem medizinischem Personal mit sterilen Tupfern mit Transportmedium ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA) durchgeführt. Die Abstriche werden bis zur DNA-Extraktion bei -80 °C gelagert.
Verfahren: Rektalabstrich
Wird von geschultem medizinischem Personal mit sterilen Tupfern mit Transportmedium ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA) durchgeführt. Die Abstriche werden bis zur DNA-Extraktion bei -80 °C gelagert.
Verfahren: Bewertungsskala für Behinderung (DRS-F)
Wird am 90. Tag +/- 7 Tage beurteilt.
Gesunde Kontrollen

Personen, die die untersuchten Erkrankungen oder anderweitig verwandte Erkrankungen oder Symptome nicht hatten, wie in den Zulassungsvoraussetzungen angegeben.

Oropharyngeale und rektale Abstriche werden nur einmal bei der Aufnahme genommen, danach ist die Teilnahme der Kontrollperson an der Studie abgeschlossen.
Verfahren: Oropharyngealer Abstrich
Wird von geschultem medizinischem Personal mit sterilen Tupfern mit Transportmedium ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA) durchgeführt. Die Abstriche werden bis zur DNA-Extraktion bei -80 °C gelagert.
Verfahren: Rektalabstrich
Wird von geschultem medizinischem Personal mit sterilen Tupfern mit Transportmedium ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA) durchgeführt. Die Abstriche werden bis zur DNA-Extraktion bei -80 °C gelagert.

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Veränderung der Alpha-Diversität der Mikrobiota, gemessen am Shannon-Index
Zeitfenster: Von Tag 0 bis Tag 90
Die oropharyngealen und rektalen Abstriche, die an Tag 0, Tag 2, Tag 7 nach der Aufnahme auf der Intensivstation und danach wöchentlich bis zur Entlassung aus der Intensivstation oder spätestens am Tag 90 durchgeführt werden, werden für die DNA-Extraktion und die bakterielle 16S-rRNA-Amplifikation und -Sequenzierung zur Identifizierung verwendet die Bakterienart, die den Darm besiedelt.
Von Tag 0 bis Tag 90

Sekundäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Alpha- und Beta-Diversität der oropharyngealen und rektalen Mikrobiota zu verschiedenen Zeitpunkten nach dem Trauma.
Zeitfenster: Von Tag 0 bis Tag 90
Die oropharyngealen und rektalen Abstriche, die an Tag 0, Tag 2, Tag 7 nach der Aufnahme auf der Intensivstation und danach wöchentlich bis zur Entlassung aus der Intensivstation oder spätestens am Tag 90 durchgeführt werden, werden für die DNA-Extraktion und die bakterielle 16S-rRNA-Amplifikation und -Sequenzierung zur Identifizierung verwendet die Bakterienart.
Von Tag 0 bis Tag 90
Auf der Intensivstation erworbene Infektionen
Zeitfenster: Von Tag 0 bis Tag 90
Die auf der Intensivstation erworbenen Infektionsraten während des Aufenthalts auf der Intensivstation
Von Tag 0 bis Tag 90
Anzahl der Patienten, die sich während des Aufenthalts auf der Intensivstation mit multiresistenten Bakterien ansiedeln oder infizieren
Zeitfenster: Von Tag 0 bis Tag 90
Besiedelung mit multiresistenten Bakterien oder Infektion, die während des Aufenthalts auf der Intensivstation erworben wurde
Von Tag 0 bis Tag 90
Tod bei Entlassung aus der Intensivstation und 90 Tage nach Trauma.
Zeitfenster: Von Tag 0 bis Tag 90
Die Todesraten bei der Entlassung aus der Intensivstation und 90 Tage nach dem Trauma
Von Tag 0 bis Tag 90
Disability Rating Scale (DRS-F)-Score 90 Tage nach dem Trauma
Zeitfenster: Von Tag 0 bis Tag 90
Neurologisches Ergebnis 90 Tage nach Trauma, bewertet durch die Disability Rating Scale, die französische Übersetzung (DRS-F), zitiert von 0 (keine Behinderung) bis 29 (extremer vegetativer Zustand)
Von Tag 0 bis Tag 90

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Sponsor

Assistance Publique - Hôpitaux de Paris

Mitarbeiter

Université Paris-Saclay

Ermittler

  • Hauptermittler: Samy Figueiredo, MD, PhD, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

21. April 2019

Primärer Abschluss (Tatsächlich)

2. Januar 2023

Studienabschluss (Geschätzt)

1. Dezember 2024

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

24. Mai 2019

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

24. Mai 2019

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

29. Mai 2019

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

30. Mai 2024

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

29. Mai 2024

Zuletzt verifiziert

1. Mai 2024

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Schlüsselwörter

Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen

Andere Studien-ID-Nummern

  • APHP180537
  • 2018-A02973-52 (Andere Kennung: IDRCB)

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UNENTSCHIEDEN

Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt

Nein

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt

Nein

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

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