感染性心内膜炎における黄色ブドウ球菌の次世代シーケンシングと細胞培養に基づく特性評価 (NESSIE)

黄色ブドウ球菌が膿瘍と同様に大量の弁破壊を引き起こし、急性感染から慢性感染に、またはその逆に切り替える能力は、感染性心内膜炎の現代の治療において重要な問題です。 さらに、免疫防御機構を回避するためにさまざまな毒性因子を生成する能力は、治療がより困難であることを証明しています。 別の難問は、血液培養サンプルと感染弁サンプルから分離された異なる黄色ブドウ球菌株の証明です。 これにより、黄色ブドウ球菌に基づく心内膜炎の治療が予想以上に困難になる可能性があります。

血液培養サンプル中の細菌の分離には多くの時間がかかる場合があり (3 ～ 14 日)、細胞培養ベースのアッセイ (CCBA) は診断手順として定期的に実施されていません。 CCBA は、時間とコストがかかるため、臨床現場では定期的に使用されていません。 CCBA メソッドの重要性は、可能な毒性要因の決定にあります。 次世代シークエンス (NGS) メソッドを利用することで、原因微生物に関するこの情報をより迅速に取得し、さまざまな菌株や毒性因子を特定できる可能性があります。

今日まで、NGS によって得られた病原性因子に関する遺伝情報と細胞培養ベースのアッセイによって得られた表現型情報との間のそのような相関関係はまだ実行されていません。個性化しました。 血液培養および感染組織弁のサンプルは、NGS および CCBA を使用して検査されます。 研究者らは、これら 2 つの方法における病原性因子の結果の違いを比較し、血液培養および弁サンプルにおける黄色ブドウ球菌の異なる株の有病率を特徴付け、IE の NGS ベースの診断の可能性を評価し、比較することを目指しています。標準治療に対するNGSに基づく抗菌薬療法の効果。