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感染性心内膜炎中金黄色葡萄球菌的下一代测序和基于细胞培养的表征 (NESSIE)

2020年2月3日 更新者:Mahmoud A. Diab、Jena University Hospital

感染性心内膜炎是一种致命性疾病,死亡率在 20% 到 40% 之间。 抗生素治疗至关重要。 它主要以阳性血培养的微生物结果为指导。 然而,基于培养的微生物诊断可以识别物种,但不能识别病原体的菌株或基因型特征。 鉴定菌株可能具有最大的临床意义。 金黄色葡萄球菌是全世界最常见的 IE 致病微生物 (16%-32%)。 这种病原体会导致大量瓣膜破坏和脓肿,这在很大程度上取决于不同金黄色葡萄球菌菌株之间不同毒力因子的表达。

目前可以通过基于细胞培养的测定 (CCBA) 来实现金黄色葡萄球菌的功能表征和毒力因子的测定。 然而,这些测试非常耗时,不能作为常规临床诊断进行。 下一代测序 (NSG) 有可能识别病原体的基因型特征,这对于确定其毒力潜力很重要。

本研究的目的是评估 NGS 在金黄色葡萄球菌毒力因子预测中的可能应用,并将其与使用 CCBA 确定的毒力因子进行比较。

希望通过比较 NGS 和 CCBA,研究人员能够更快地确定可能的毒力因子。 NGS 方法可进一步用于描述受感染的瓣膜组织和血培养样本中不同细菌菌株的流行情况。 收集的数据将作为进一步评估基于 NGS 的 IE 诊断潜力的基础,以及 NGS 指导的抗生素治疗与护理标准抗生素治疗之间的比较。

研究概览

详细说明

金黄色葡萄球菌产生大量瓣膜破坏和脓肿以及从急性感染转变为慢性感染以及从急性感染转变为慢性感染的能力是感染性心内膜炎现代治疗中的一个重要问题。 此外,产生不同毒力因子以逃避免疫防御机制的能力证明治疗更加困难。 另一个难题是从血培养样本和受感染的瓣膜样本中分离出不同金黄色葡萄球菌菌株的证据。 这使得基于金黄色葡萄球菌的心内膜炎的可能治疗比预期的更困难。

血培养样本中细菌的分离可能需要很长时间(3-14 天),并且基于细胞培养的检测 (CCBA) 并未作为诊断程序定期实施。 由于时间消耗和成本高,CCBA 在临床环境中并不经常使用。 CCBA方法的意义在于确定可能的毒力因子。 利用下一代序列 (NGS) 方法,有可能更快地获得有关罪魁祸首微生物的信息,并识别不同的菌株和毒力因子。

迄今为止,尚未对通过 NGS 获得的毒力因子遗传信息与通过基于细胞培养的测定获得的表型信息之间的相关性进行研究。如果得到证实,基于 NGE 的病原体及其表型行为分析可以指导抗菌治疗,并使它个性化。 将使用 NGS 和 CCBA 检查血培养和受感染的组织瓣膜样本。 研究人员旨在比较这两种方法中毒力因子结果的差异,以表征不同金黄色葡萄球菌菌株在血培养和瓣膜样本中的流行情况,并评估基于 NGS 的 IE 诊断的可能潜力,并比较NGS 指导的抗菌治疗对护理治疗标准的影响。

研究类型

观察性的

注册 (预期的)

10

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息,以及有关进行该研究的地点的信息。

学习地点

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

18年 及以上 (成人、年长者)

接受健康志愿者

有资格学习的性别

全部

取样方法

非概率样本

研究人群

诊断为感染性心内膜炎且有心脏瓣膜心脏手术指征的患者

描述

纳入标准:

  • 诊断为感染性心内膜炎且有心脏瓣膜心脏手术指征的患者
  • 签署知情同意书
  • 年龄≥18岁
  • 病原体(金黄色葡萄球菌)可以从血液培养物和去除的瓣膜组织中分离出来

排除标准:

  • 不能从切除的瓣膜组织中分离出金黄色葡萄球菌

学习计划

本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的?

设计细节

研究衡量的是什么?

主要结果指标

结果测量
措施说明
大体时间
生物膜生长
大体时间:通过学习完成(约1年)
从纳入患者的血液和心脏组织中分离出的金黄色葡萄球菌菌株构建生物膜的能力
通过学习完成(约1年)

次要结果测量

结果测量
措施说明
大体时间
入侵特征
大体时间:通过学习完成(约1年)
从纳入患者的血液和心脏组织中分离出的金黄色葡萄球菌菌株侵入其他细胞的特征(宿主细胞侵入;宿主细胞中的持久性;将在细胞培养中进行测试)
通过学习完成(约1年)
附着力特性
大体时间:通过学习完成(约1年)
从纳入患者的血液和心脏组织中分离出的金黄色葡萄球菌菌株粘附到其他人体细胞的特征(关于粘附到心脏组织能力的重要信息;测试将在细胞培养中进行)
通过学习完成(约1年)
毒素产生
大体时间:通过学习完成(约1年)
从纳入患者的血液和心脏组织中分离出的金黄色葡萄球菌菌株在产生毒素方面的特征,这些毒素将导致有关炎症过程诱导和宿主细胞死亡诱导的信息
通过学习完成(约1年)

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

调查人员

  • 首席研究员:Mahmoud A Diab, Dr. med.、Jena University Hospital, Clinic for Cardiac and Thoracic Surgery

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始 (实际的)

2019年9月1日

初级完成 (预期的)

2020年2月28日

研究完成 (预期的)

2020年7月31日

研究注册日期

首次提交

2019年9月5日

首先提交符合 QC 标准的

2020年2月3日

首次发布 (实际的)

2020年2月6日

研究记录更新

最后更新发布 (实际的)

2020年2月6日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2020年2月3日

最后验证

2020年2月1日

更多信息

与本研究相关的术语

计划个人参与者数据 (IPD)

计划共享个人参与者数据 (IPD)?

未定

药物和器械信息、研究文件

研究美国 FDA 监管的药品

研究美国 FDA 监管的设备产品

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