Sequenciamento de próxima geração e caracterização baseada em cultura celular de S. aureus em endocardite infecciosa (NESSIE)
A endocardite infecciosa é uma doença mortal com uma taxa de mortalidade entre 20 e 40%. A antibioticoterapia é de extrema importância. É guiado principalmente por resultados microbianos de hemocultura positiva. No entanto, o diagnóstico microbiológico baseado em cultura pode identificar a espécie, mas não a cepa ou as características genotípicas de um patógeno. Identificar a cepa pode ser de extrema importância clínica. S. aureus é o organismo causador mais comum de EI em todo o mundo (16%-32%). Este patógeno causa destruição massiva de válvulas e abscessos, o que é fortemente dependente da expressão de fatores de virulência que variam entre diferentes cepas de S. aureus.
Atualmente, a caracterização funcional de S. aureus e a determinação de fatores de virulência podem ser realizadas por meio de ensaios baseados em cultura de células (CCBA). No entanto, esses testes são muito demorados e não podem ser realizados como diagnósticos clínicos de rotina. O sequenciamento de próxima geração (NSG) tem o potencial de identificar as características genotípicas do patógeno, o que é importante para determinar seu potencial virulento.
O objetivo deste estudo é avaliar a possível utilização do NGS na predição de fatores de virulência de S. aureus e compará-lo com os fatores de virulência determinados por CCBA.
Esperançosamente, comparando o NGS e o CCBA, os investigadores obterão uma maneira mais rápida de determinar os possíveis fatores de virulência. O método NGS pode ainda ser utilizado para descrever a prevalência de diferentes cepas de bactérias em tecido valvular infectado e amostras de hemocultura. Os dados coletados servirão de base para uma avaliação mais aprofundada dos potenciais do diagnóstico de EI baseado em NGS, bem como uma comparação entre o tratamento antibiótico guiado por NGS e o tratamento antibiótico padrão.
Visão geral do estudo
Status
Descrição detalhada
A capacidade do Staphylococcus aureus de produzir destruição massiva da válvula, bem como abscessos e mudar de infecção aguda para crônica e vice-versa, é uma questão significativa no tratamento moderno da endocardite infecciosa. Além disso, a capacidade de produzir diferentes fatores de virulência para driblar os mecanismos de defesa imune torna o tratamento mais difícil. Outro enigma é a prova de diferentes cepas de S. aureus isoladas de amostras de hemocultura e amostras de válvulas infectadas. Isso torna um possível tratamento da endocardite baseada em S. aureus mais difícil do que o esperado.
O isolamento de bactérias nas amostras de hemocultura pode levar muito tempo (3 a 14 dias) e os ensaios baseados em cultura de células (CCBA) não são implementados regularmente como um procedimento de diagnóstico. CCBA não é usado regularmente no ambiente clínico devido ao consumo de tempo e alto custo. A importância do método CCBA reside na determinação dos possíveis fatores de virulência. Utilizando o método Next Generation Sequence (NGS), pode ser possível obter essas informações sobre o microrganismo culpado mais rapidamente e identificar as diferentes cepas e fatores de virulência.
Até o momento, essas correlações entre informações genéticas sobre fatores de virulência obtidos por NGS e informações fenotípicas obtidas por ensaios baseados em cultura de células ainda não foram realizadas. Se comprovada, a análise baseada em NGE dos patógenos e seu comportamento fenotípico pode orientar a terapia antimicrobiana e tornar é individualizado. A hemocultura e as amostras de tecido infectado da válvula serão examinadas usando o NGS e o CCBA. Os investigadores pretendem comparar as diferenças nos resultados do fator de virulência nestes dois métodos, caracterizar a prevalência de diferentes cepas de S. aureus na hemocultura e amostras de válvulas e avaliar os possíveis potenciais de diagnóstico de EI baseado em NGS e comparar os efeitos da terapia antimicrobiana guiada por NGS para o padrão de terapia de cuidados.
Tipo de estudo
Inscrição (Antecipado)
Contactos e Locais
Contato de estudo
- Nome: Mahmoud A Diab, Dr. med.
- Número de telefone: 9322978 03641
- E-mail: mahmoud.diab@med.uni-jena.de
Estude backup de contato
- Nome: Andreas Oberbach, Prof. Dr.
- Número de telefone: 35536336 0341
- E-mail: andreas.oberbach@medizin.uni-leipzig.de
Locais de estudo
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Jena, Alemanha, 07747
- Recrutamento
- Jena University Hospital, Clinic for Cardiothoracic surgery
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Contato:
- Mahmoud A Diab, Dr. med.
- Número de telefone: 9322978 +49 3641
- E-mail: mahmoud.diab@med.uni-jena.de
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Contato:
- Ilia Velichkov
- Número de telefone: 9322947 +49 3641
- E-mail: ilia.velichkov@med.uni-jena.de
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Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
Aceita Voluntários Saudáveis
Gêneros Elegíveis para o Estudo
Método de amostragem
População do estudo
Descrição
Critério de inclusão:
- pacientes com diagnóstico de endocardite infecciosa e indicação de cirurgia cardíaca em válvula cardíaca
- consentimento informado assinado
- idade ≥18 anos
- patógenos (S. aureus) podem ser isolados da hemocultura E do tecido da válvula removido
Critério de exclusão:
- S. aureus não pode ser isolado do tecido da válvula removido
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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crescimento de biofilme
Prazo: até a conclusão do estudo (cerca de 1 ano)
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capacidade de cepas de S. aureus isoladas do sangue e tecido cardíaco de pacientes incluídos para construir um biofilme
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até a conclusão do estudo (cerca de 1 ano)
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Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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características de invasão
Prazo: até a conclusão do estudo (cerca de 1 ano)
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características das cepas de S. aureus isoladas do sangue e tecido cardíaco dos pacientes incluídos para invadir outras células (invasão de células hospedeiras; persistência em células hospedeiras; testes serão realizados em cultura celular)
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até a conclusão do estudo (cerca de 1 ano)
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características de adesão
Prazo: até a conclusão do estudo (cerca de 1 ano)
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características das cepas de S. aureus isoladas do sangue e tecido cardíaco dos pacientes incluídos para aderir a outras células humanas (informações importantes sobre a capacidade de se ligar ao tecido cardíaco; o teste será realizado em cultura de células)
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até a conclusão do estudo (cerca de 1 ano)
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produção de toxina
Prazo: até a conclusão do estudo (cerca de 1 ano)
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características das cepas de S. aureus isoladas do sangue e tecido cardíaco dos pacientes incluídos quanto à produção de toxinas que levarão a informações sobre a indução de processos inflamatórios e indução de morte da célula hospedeira
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até a conclusão do estudo (cerca de 1 ano)
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Investigadores
- Investigador principal: Mahmoud A Diab, Dr. med., Jena University Hospital, Clinic for Cardiac and Thoracic Surgery
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
Conclusão Primária (Antecipado)
Conclusão do estudo (Antecipado)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- 01 (Miami VAHS)
Plano para dados de participantes individuais (IPD)
Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
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