Sequenziamento di nuova generazione e caratterizzazione basata su coltura cellulare di S. Aureus nell'endocardite infettiva (NESSIE)
L'endocardite infettiva è una malattia mortale con un tasso di mortalità compreso tra il 20 e il 40%. La terapia antibiotica è della massima importanza. È guidato principalmente dai risultati microbici dell'emocoltura positiva. Tuttavia, la diagnostica microbiologica basata sulla coltura può identificare la specie, ma non il ceppo o le caratteristiche genotipiche di un patogeno. L'identificazione del ceppo può essere della massima importanza clinica. S. aureus è l'organismo causale più comune di IE in tutto il mondo (16% -32%). Questo patogeno provoca una massiccia distruzione della valvola e ascessi, che è fortemente dipendente dall'espressione di fattori di virulenza che variano tra i diversi ceppi di S. aureus.
La caratterizzazione funzionale di S. aureus e la determinazione dei fattori di virulenza possono attualmente essere ottenute mediante saggi basati su colture cellulari (CCBA). Tuttavia, questi test richiedono molto tempo e non possono essere eseguiti come diagnostica clinica di routine. Next Generation Sequencing (NSG) ha il potenziale per identificare le caratteristiche genotipiche del patogeno, che è importante per determinare il suo potenziale virulento.
Lo scopo di questo studio è valutare il possibile utilizzo di NGS nella previsione dei fattori di virulenza di S. aureus e confrontarlo con i fattori di virulenza determinati utilizzando CCBA.
Si spera che, confrontando NGS e CCBA, gli investigatori ottengano un modo più rapido per determinare i possibili fattori di virulenza. Il metodo NGS può essere ulteriormente utilizzato per descrivere la prevalenza di diversi ceppi di batteri nel tessuto valvolare infetto e nei campioni di emocoltura. I dati raccolti serviranno come base per un'ulteriore valutazione delle potenzialità della diagnosi di IE basata su NGS, nonché per un confronto tra il trattamento antibiotico guidato da NGS e il trattamento antibiotico standard di cura.
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Descrizione dettagliata
La capacità dello Staphylococcus aureus di produrre una massiccia distruzione della valvola così come gli ascessi e di passare dall'infezione acuta a quella cronica e viceversa è un problema significativo nel moderno trattamento dell'endocardite infettiva. Inoltre, la capacità di produrre diversi fattori di virulenza per eludere i meccanismi di difesa immunitaria rende il trattamento più difficile. Un altro enigma è la prova di diversi ceppi di S. aureus isolati da campioni di emocoltura e campioni di valvole infette. Ciò rende un possibile trattamento dell'endocardite da S. aureus più difficile del previsto.
L'isolamento dei batteri nei campioni di emocoltura può richiedere molto tempo (3-14 giorni) e le analisi basate su colture cellulari (CCBA) non vengono regolarmente implementate come procedura diagnostica. Il CCBA non viene utilizzato regolarmente in ambito clinico a causa del consumo di tempo e dei costi elevati. Il significato del metodo CCBA risiede nella determinazione dei possibili fattori di virulenza. Utilizzando il metodo Next Generation Sequence (NGS), potrebbe essere possibile ottenere queste informazioni sul microrganismo colpevole più velocemente e identificare i diversi ceppi e fattori di virulenza.
Ad oggi, tali correlazioni tra le informazioni genetiche sui fattori di virulenza acquisite da NGS e le informazioni fenotipiche ottenute da saggi basati su colture cellulari non sono state ancora eseguite. ha individualizzato. I campioni di emocoltura e valvola di tessuto infetto saranno esaminati utilizzando NGS e CCBA. Gli investigatori mirano a confrontare le differenze nei risultati del fattore di virulenza in questi due metodi, a caratterizzare la prevalenza di diversi ceppi di S. aureus nei campioni di emocoltura e valvola e di valutare le possibili potenzialità della diagnosi basata su NGS di IE e di confrontare gli effetti della terapia antimicrobica guidata da NGS rispetto allo standard della terapia di cura.
Tipo di studio
Iscrizione (Anticipato)
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
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Jena, Germania, 07747
- Reclutamento
- Jena University Hospital, Clinic for Cardiothoracic surgery
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Contatto:
- Mahmoud A Diab, Dr. med.
- Numero di telefono: 9322978 +49 3641
- Email: mahmoud.diab@med.uni-jena.de
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Contatto:
- Ilia Velichkov
- Numero di telefono: 9322947 +49 3641
- Email: ilia.velichkov@med.uni-jena.de
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- pazienti con la diagnosi di endocardite infettiva e indicazione per chirurgia cardiaca su una valvola cardiaca
- consenso informato firmato
- età ≥18 anni
- i patogeni (S. aureus) possono essere isolati dall'emocoltura E dal tessuto valvolare rimosso
Criteri di esclusione:
- S. aureus non può essere isolato dal tessuto valvolare rimosso
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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crescita del biofilm
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi (circa 1 anno)
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capacità dei ceppi di S. aureus isolati dal sangue e dal tessuto cardiaco dei pazienti inclusi di costruire un biofilm
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attraverso il completamento degli studi (circa 1 anno)
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Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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caratteristiche di invasione
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi (circa 1 anno)
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caratteristiche dei ceppi di S. aureus isolati dal sangue e dal tessuto cardiaco dei pazienti inclusi per invadere altre cellule (invasione della cellula ospite; persistenza nelle cellule ospiti; i test saranno condotti in coltura cellulare)
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attraverso il completamento degli studi (circa 1 anno)
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caratteristiche di adesione
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi (circa 1 anno)
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caratteristiche dei ceppi di S. aureus isolati dal sangue e dal tessuto cardiaco dei pazienti inclusi per aderire ad altre cellule umane (informazioni importanti sulla capacità di attaccarsi al tessuto cardiaco; il test sarà condotto in coltura cellulare)
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attraverso il completamento degli studi (circa 1 anno)
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produzione di tossine
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi (circa 1 anno)
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caratteristiche dei ceppi di S. aureus isolati dal sangue e dal tessuto cardiaco dei pazienti inclusi per quanto riguarda la produzione di tossine che porteranno a informazioni sull'induzione dei processi infiammatori e sull'induzione della morte della cellula ospite
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attraverso il completamento degli studi (circa 1 anno)
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Investigatori
- Investigatore principale: Mahmoud A Diab, Dr. med., Jena University Hospital, Clinic for Cardiac and Thoracic Surgery
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Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Effettivo)
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Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
- 01 (Miami VAHS)
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