Sequenzierung der nächsten Generation und zellkulturbasierte Charakterisierung von S. Aureus bei infektiöser Endokarditis (NESSIE)
Infektiöse Endokarditis ist eine tödliche Krankheit mit einer Sterblichkeitsrate zwischen 20 und 40 %. Die Antibiotikatherapie ist von größter Bedeutung. Sie orientiert sich in erster Linie an mikrobiellen Ergebnissen aus positiver Blutkultur. Die kulturbasierte mikrobiologische Diagnostik kann jedoch die Art, nicht aber den Stamm oder die genotypischen Merkmale eines Erregers identifizieren. Die Identifizierung des Stammes kann von größter klinischer Bedeutung sein. S. aureus ist weltweit der häufigste Erreger von IE (16 % - 32 %). Dieser Erreger verursacht massive Klappenzerstörung und Abszesse, was stark von der Expression von Virulenzfaktoren abhängt, die zwischen verschiedenen S. aureus-Stämmen variieren.
Die funktionelle Charakterisierung von S. aureus und die Bestimmung von Virulenzfaktoren können derzeit durch zellkulturbasierte Assays (CCBA) erreicht werden. Diese Tests sind jedoch sehr zeitaufwändig und können nicht als klinische Routinediagnostik durchgeführt werden. Next Generation Sequencing (NSG) hat das Potenzial, die genotypischen Merkmale des Pathogens zu identifizieren, was wichtig ist, um sein virulentes Potenzial zu bestimmen.
Ziel dieser Studie ist es, den möglichen Einsatz von NGS zur Vorhersage von Virulenzfaktoren von S. aureus zu evaluieren und mit den mittels CCBA ermittelten Virulenzfaktoren zu vergleichen.
Hoffentlich erhalten die Ermittler durch den Vergleich von NGS und CCBA einen schnelleren Weg, um die möglichen Virulenzfaktoren zu bestimmen. Das NGS-Verfahren kann weiter verwendet werden, um die Prävalenz verschiedener Bakterienstämme in infiziertem Klappengewebe und Blutkulturproben zu beschreiben. Die gesammelten Daten dienen als Grundlage für die weitere Bewertung der Potenziale der NGS-basierten Diagnose von IE sowie für einen Vergleich zwischen der NGS-geführten Antibiotikabehandlung und der standardmäßigen Antibiotikabehandlung.
Studienübersicht
Status
Bedingungen
Detaillierte Beschreibung
Die Fähigkeit des Staphylococcus aureus, eine massive Klappenzerstörung sowie Abszesse hervorzurufen und von einer akuten zu einer chronischen Infektion und umgekehrt überzugehen, ist ein bedeutendes Thema in der modernen Behandlung von infektiöser Endokarditis. Darüber hinaus erschwert die Fähigkeit, verschiedene Virulenzfaktoren zu produzieren, um den Immunabwehrmechanismen zu entgehen, die Behandlung. Ein weiteres Rätsel ist der Nachweis verschiedener S. aureus-Stämme, die aus Blutkulturproben und infizierten Klappenproben isoliert wurden. Dies macht eine mögliche Behandlung einer S. aureus-basierten Endokarditis schwieriger als erwartet.
Die Isolierung von Bakterien in den Blutkulturproben kann viel Zeit in Anspruch nehmen (3-14 Tage), und zellkulturbasierte Assays (CCBA) werden nicht regelmäßig als diagnostisches Verfahren eingesetzt. CCBA wird aufgrund des Zeitaufwands und der hohen Kosten nicht regelmäßig im klinischen Umfeld eingesetzt. Die Bedeutung der CCBA-Methode liegt in der Bestimmung der möglichen Virulenzfaktoren. Mithilfe der Next Generation Sequence (NGS)-Methode könnte es möglich sein, diese Informationen über den schuldigen Mikroorganismus schneller zu gewinnen und die verschiedenen Stämme und Virulenzfaktoren zu identifizieren.
Bisher wurden solche Korrelationen zwischen genetischen Informationen über Virulenzfaktoren, die durch NGS gewonnen wurden, und phänotypischen Informationen, die durch zellkulturbasierte Assays gewonnen wurden, noch nicht durchgeführt. Im Falle eines Nachweises könnte die NGE-basierte Analyse der Krankheitserreger und ihres phänotypischen Verhaltens eine Anleitung für eine antimikrobielle Therapie geben und machen es individualisiert. Blutkulturen und infizierte Gewebeklappenproben werden mit NGS und CCBA untersucht. Ziel der Forscher ist es, die Unterschiede in den Virulenzfaktor-Ergebnissen dieser beiden Methoden zu vergleichen, die Prävalenz verschiedener Stämme von S. aureus in Blutkultur- und Klappenproben zu charakterisieren und die möglichen Potenziale einer NGS-basierten Diagnose von IE zu bewerten und zu vergleichen die Auswirkungen der NGS-geführten antimikrobiellen Therapie auf die Standardtherapie.
Studientyp
Einschreibung (Voraussichtlich)
Kontakte und Standorte
Studienkontakt
- Name: Mahmoud A Diab, Dr. med.
- Telefonnummer: 9322978 03641
- E-Mail: mahmoud.diab@med.uni-jena.de
Studieren Sie die Kontaktsicherung
- Name: Andreas Oberbach, Prof. Dr.
- Telefonnummer: 35536336 0341
- E-Mail: andreas.oberbach@medizin.uni-leipzig.de
Studienorte
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Jena, Deutschland, 07747
- Rekrutierung
- Jena University Hospital, Clinic for Cardiothoracic surgery
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Kontakt:
- Mahmoud A Diab, Dr. med.
- Telefonnummer: 9322978 +49 3641
- E-Mail: mahmoud.diab@med.uni-jena.de
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Kontakt:
- Ilia Velichkov
- Telefonnummer: 9322947 +49 3641
- E-Mail: ilia.velichkov@med.uni-jena.de
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Studienberechtigte Geschlechter
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Patienten mit der Diagnose infektiöse Endokarditis und Indikation zur Herzoperation an einer Herzklappe
- unterschriebene Einverständniserklärung
- Alter ≥18 Jahre
- Krankheitserreger (S. aureus) können aus der Blutkultur UND aus dem entnommenen Klappengewebe isoliert werden
Ausschlusskriterien:
- S. aureus kann nicht aus entnommenem Klappengewebe isoliert werden
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Biofilmwachstum
Zeitfenster: bis zum Studienabschluss (ca. 1 Jahr)
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Fähigkeit von S. aureus-Stämmen, die aus dem Blut und Herzgewebe eingeschlossener Patienten isoliert wurden, einen Biofilm aufzubauen
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bis zum Studienabschluss (ca. 1 Jahr)
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Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Invasionsmerkmale
Zeitfenster: bis zum Studienabschluss (ca. 1 Jahr)
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Eigenschaften der S. aureus-Stämme, die aus Blut und Herzgewebe eingeschlossener Patienten isoliert wurden, um in andere Zellen einzudringen (Wirtszellinvasion; Persistenz in Wirtszellen; Tests werden in Zellkultur durchgeführt)
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bis zum Studienabschluss (ca. 1 Jahr)
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Hafteigenschaften
Zeitfenster: bis zum Studienabschluss (ca. 1 Jahr)
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Eigenschaften der aus Blut und Herzgewebe eingeschlossener Patienten isolierten S. aureus-Stämme, an anderen menschlichen Zellen zu haften (wichtige Information bezüglich der Fähigkeit, sich an Herzgewebe anzuheften; Test wird in Zellkultur durchgeführt)
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bis zum Studienabschluss (ca. 1 Jahr)
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Toxinproduktion
Zeitfenster: bis zum Studienabschluss (ca. 1 Jahr)
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Eigenschaften der aus dem Blut und Herzgewebe der eingeschlossenen Patienten isolierten S. aureus-Stämme hinsichtlich der Produktion von Toxinen, die zu Informationen über die Induktion von Entzündungsprozessen und die Induktion von Wirtszelltod führen werden
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bis zum Studienabschluss (ca. 1 Jahr)
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Ermittler
- Hauptermittler: Mahmoud A Diab, Dr. med., Jena University Hospital, Clinic for Cardiac and Thoracic Surgery
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Primärer Abschluss (Voraussichtlich)
Studienabschluss (Voraussichtlich)
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Schlüsselwörter
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
- 01 (Miami VAHS)
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Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
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