嚢胞性線維症患者における嫌気性細菌の疫学：記述的かつ非介入的研究 (ANA-MUCO)

嚢胞性線維症 (CF) は致死的な遺伝性疾患であり、その予後は患者の呼吸障害に依存します。 実際、気道の微生物、特に緑膿菌の慢性定着は、感染症の増悪と顕著な呼吸機能障害を引き起こし、罹患率と死亡率の主な原因となっている。 現在、抗生物質療法は、細菌の発生を阻止し、呼吸機能の低下を遅らせるための主な治療法です。 しかし、病気の進行中、この治療法は細菌の順応と抗生物質耐性の発現によって制限されます。

ハイスループットシーケンス法の開発のおかげで、CF患者の呼吸器微生物叢が主に説明され、新しい治療アプローチへの道が示されています。 i) CF 児の呼吸器微生物叢は幼い頃から、健康な子供と比べて変化している、ii) 病気の進行を通じて細菌の多様性が徐々に減少している、iii) 嫌気性菌が健康な子供の重要な部分を占めている、ということが確立されています。およびCF呼吸器微生物叢。 したがって、肺微生物叢の組成は、CF 呼吸器サンプル中の緑膿菌の唯一の検出よりも優れた疾患進行指標となる可能性があります。 さらに、呼吸器微生物叢は、微生物/微生物間、または微生物/宿主間の直接相互作用を通じて病因に影響を与える可能性があります。 最近、CF 患者コホートの呼吸器微生物叢の特徴付け (MUCOBIOME 研究、2012 ～ 2015 年) のおかげで、緑膿菌の最初の定着における嫌気性菌 (特にポルフィロモナス属に属する種) の潜在的な役割が強調されました。 実際、34 人の CF 患者を対象とした呼吸器微生物叢の研究では、患者がポルフィロモナス属菌の定着を奪われているか、定着度が低い場合、緑膿菌定着の相対リスクは 3.7 倍高いことが明らかになりました。 逆に、ポルフィロモナス属の相対的な存在量は増加しています。イバカフトール治療を受けている CF 患者では、呼吸機能の改善と相関しています。 したがって、バイオマーカーとして使用されることに加えて、研究者らは、ポルフィロモナス属などの一部の厳密な嫌気性種が、CF病原体（緑膿菌など）の競合体として作用し、気道内でのそれらの定着を制限する可能性があるという事実を推測している。

研究者らはここで、気道内の嫌気性細菌をよりよく特徴付けるために補完的な研究の必要性を認識している。 ANA-MUCO 研究の目的は、CF 患者コホートの喀痰中の嫌気性細菌を特定して記載すること、分離された嫌気性種の抗生物質耐性プロファイルを特徴付けること、CF 集団内での嫌気性細菌の再分配を研究すること、および相互作用を評価することです。嫌気性菌と CF 病原体の間 (P. 緑膿菌、黄色ブドウ球菌、インフルエンザ菌など）。 嫌気性菌の説明を可能な限り徹底的にするために、この研究の革新的な点は、国際ヒトマイクロバイオーム基準 (IHMS) の推奨に従って、喀痰中の嫌気性条件を保存する特定のサンプルキットの構想と使用です。 。 次に、CF 呼吸器サンプルの肺恒常性に関与する可能性のある嫌気性細菌を同定するために、拡張培養および分子アプローチが実行されます。