囊性纤维化患者厌氧菌的流行病学：描述性和非干预性研究 (ANA-MUCO)

囊性纤维化 (CF) 是一种致命的遗传病，其预后取决于患者的呼吸功能障碍。 事实上，气道微生物的慢性定植，特别是铜绿假单胞菌，会导致感染恶化和显着的呼吸功能损害，并且是发病率和死亡率的主要原因。 如今，抗生素治疗是阻止细菌生长和减缓呼吸功能退化的主要治疗方案。 然而，在疾病进展期间，这种治疗方法受到细菌调节和抗生素耐药性发展的限制。

由于高通量测序方法的发展，主要描述了 CF 患者的呼吸道微生物群，并为新的治疗方法指明了方向。 已经确定，i）从小，CF 儿童的呼吸微生物群与健康儿童相比发生了变化，ii）细菌多样性在整个疾病演变过程中逐渐减少，iii）厌氧菌代表健康儿童的重要组成部分和 CF 呼吸微生物群。 因此，与在 CF 呼吸道样本中仅检测铜绿假单胞菌相比，肺微生物群组成可能是更好的疾病进展指标。 此外，呼吸微生物群可以通过微生物/微生物或微生物/宿主之间的直接相互作用影响发病机制。 最近，由于 CF 患者队列的呼吸微生物群特征（MUCOBIOME 研究，2012-2015），厌氧菌（特别是属于 Porphyromonas 属的物种）在第一次铜绿假单胞菌定植中的潜在作用得到了强调。 事实上，对 34 名 CF 患者的呼吸道微生物群研究表明，如果患者被剥夺或低度定植卟啉单胞菌属，则铜绿假单胞菌定植的相对风险高 3.7 倍。 相反，卟啉单胞菌属的相对丰度增加。在接受 Ivacaftor 治疗的 CF 患者中，它与呼吸功能改善相关。 因此，除了用作生物标志物外，研究人员还推测一些严格厌氧的物种，如卟啉单胞菌属，可以作为 CF 病原体（如铜绿假单胞菌）的竞争者并限制它们在呼吸道中的建立。

研究人员在这里看到了补充研究的必要性，以便更好地表征气道中的厌氧菌。 ANA-MUCO 研究的目的是识别和描述 CF 患者队列痰液中的厌氧菌，表征分离出的厌氧菌的抗生素耐药性特征，研究 CF 人群中的厌氧菌重新分配并评估相互作用厌氧菌和 CF 病原体之间（P. 铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌、流感嗜血杆菌……）。 为了尽可能详尽地描述厌氧菌，本研究的创新之处在于根据国际人类微生物组标准 (IHMS) 的建议，构思和使用特定样本试剂盒以保持痰液中的厌氧条件. 然后，将采用扩展培养和分子方法来鉴定可能参与 CF 呼吸道样本中肺稳态的厌氧菌。