がん治療選択のための非侵襲的包括的なゲノムプロファイリングの臨床的有用性を評価するための、リキッドバイオプシーに基づくプレシジョンオンコロジー研究

1. サイトの監視と監査の計画を含む、データの検証とレジストリの手順に対応する品質保証計画。

   すべての情報は、Redcap でホストされる研究固有の症例報告フォーム (CRF) で収集されるか、研究データベースに直接入力されます。 患者情報を保護するために、以下の措置が講じられます。

   • データベースはパスワードで保護されます。許可されたスタッフのみがプロジェクト データを入力および表示できます。
   • パスワードとシステム ID は共有されません。
   • ワークステーション/ファイルの物理的なセキュリティは維持されます。 データベースが開いているワークステーションが放置されることはありません。
   • スタッフは、データ入力システムとセキュリティ手順についてトレーニングを受けます。
   • 試験データは、シドニー キンメル総合がんセンター臨床研究室およびがんセンター安全委員会によって審査/監視されます。

2. レジストリに入力されたデータを、範囲またはレジストリ内の他のデータ フィールドとの一貫性について事前定義されたルールと比較するためのデータ チェック。

   データチェックは、SKCCC SOP DM-01-04 CRF ドキュメント基準に従って実行されます。

   Case Report Form (CRF): 各治験被験者について治験依頼者に報告されるプロトコルに必要なすべての情報を記録するように設計された、印刷された、光学的、または電子的な文書。 ICH GCP 1.11 ソース ドキュメント: 元のドキュメント、データ、および記録 (例: 病院の記録、臨床およびオフィス カルテ、検査ノート、覚書、被験者の日記または評価チェックリスト、薬局の調剤記録、自動化された機器から記録されたデータ、認証済みのコピーまたは転写)正確かつ完全であることが確認された後、マイクロフィッシュ、写真のネガ、マイクロフィルムまたは磁気メディア、X 線、被験者ファイル、および薬局、研究所、および臨床試験に関与する医療技術部門に保管されている記録)。 ICH GCP 1.52

3. データを外部データ ソース (たとえば、医療記録、紙または電子の症例報告フォーム、または対話型音声応答システム) と比較することにより、登録データの正確性、完全性、または代表性を評価するためのソース データ検証。

   すべての研究データは、生成されたデータの完全性と正確性を確保するプロトコル委員長によって完全性と正確性についてレビューされます。 このプロジェクトに参加する指定研究コーディネーターは、各参加者に関連する臨床情報を収集します。 このようなデータには、医療記録番号、年齢、性別、治療歴、循環腫瘍マーカー、腫瘍の大きさ、腫瘍のグレード、腫瘍受容体の状態、病理学レポート、喫煙歴、ホルモン歴、併用薬、およびパリティが含まれますが、これらに限定されません。 . このような情報は、既存の臨床データベース/EMR (EPIC など) および患者アンケート情報から取得され、電子スケジュールおよび処方システムも含まれる場合があります。

   フォローアップ情報は、医療記録のレビューによって収集されます。 さらに、参加者は電話で連絡を取り、質問や説明、追加のフォローアップ要件をサポートする場合があります。

4. レジストリで使用される各変数の詳細な説明を含むデータ ディクショナリ。変数のソース、使用されている場合はコーディング情報 (たとえば、世界保健機関の医薬品辞書、MedDRA)、および関連する場合は正常範囲が含まれます。

   データ ディクショナリのソースは、印刷中の Botsis et al., JCO CCI, 2023 に含まれています。

5. 患者募集、データ収集、データ管理、データ分析、有害事象の報告、および変更管理などのレジストリ操作および分析活動に対処するための標準操作手順。

   これらの活動は、研究プロトコルとグッドクリニカルプラクティスの原則に従って実施されます。 研究の実施と進捗状況に関する情報は、現在の制度基準に従って、地元の治験審査委員会 (IRB) に報告されます。 この研究は、現在の制度基準に従って定期的な年次レビューを受けます。

6. 効果を実証するために必要な参加者数または参加年数を特定するためのサンプルサイズ評価。

   非腺癌NSCLC、小細胞肺癌、神経内分泌肺癌、中皮腫、食道癌、乳癌、頭頸部癌を含む150人の固形腫瘍患者を募集します。 リキッドバイオプシーアッセイの分析性能に基づいて、85%を超える個人で腫瘍特異的変異が検出されると予想されます。 1.5 年で積み立てを完了する予定です。 分析は、主にこのフィージビリティ スタディを説明するものです。 150 人の患者のサンプルサイズは、観察された割合の推定値に関する妥当な信頼を提供します。 臨床的に重要なバリアントを持つ患者の割合。 95% 信頼区間の幅は 16.5% より狭くなります。

7. データの不一致または範囲外の結果のために、変数が欠落している、利用できない、報告されていない、解釈できない、または欠落していると見なされる状況に対処するために、欠落しているデータを計画します。

   欠落しているデータは、下流の分析から除外されます。

8. 研究プロトコルまたは計画で指定されているように、主要な目的と二次的な目的に対処するために採用される分析原理と統計手法を説明する統計分析計画。

   1. 主な目的の分析:

      主な目的は、上記のように、さまざまなレベルのエビデンス (遺伝子および変化の種類によって層別化) にわたって臨床的に重要なバリアントの数と有病率を決定し、それに応じて MTB 治療が推奨される患者の割合を決定することです。 ctDNAサンプルで検出された臨床的意義のあるバリアントを保有する患者の割合を95％の信頼区間とともに推定するために、記述分析が実行されます。 リキッドバイオプシーによって検出された変異プロファイルに従って、実行可能な変更に合わせて調整された MTB 治療の推奨を有する患者の割合、および MTB の推奨に従って治療された患者の割合が推定されます。 リキッドバイオプシーの収集から MTB 推奨までの日数、および MTB 推奨から治療開始までの日数は、平均、中央値、標準偏差、および範囲によって要約されます。 30 人の患者ごとにデータを要約する予定です。

   2. 副次的な目的の分析:

次のがん治療までの時間は、治療を開始してから、主治医の決定に従って次のがん治療を開始するまでの時間です。 無増悪生存期間 (PFS) は、治療開始から RECIST による X 線検査による進行、臨床的進行、または担当医の評価による疾患の悪化までの時間です。 全生存期間 (OS) は、治療の開始から何らかの原因による死亡までの時間です。 PFS と OS は、MTB の推奨がある患者とない患者、および推奨される治療を受けている患者と受けていない患者の Kaplan-Meier 法による特性になります。

記述的分析は、治療クラス別の MTB ベースの治療推奨の頻度 (標準治療、臨床試験、適応外使用)、および治療推奨からの逸脱と理由 (臨床的悪化、他のプロトコル、患者の不適格、適応外治療が利用できない、臨床試験が実行できない (例: 物理的な距離）、募集していない臨床試験、医師の決定、患者の選択など） ベースラインでのリキッドバイオプシー分析によって得られた検出された変化の一致は、時間一致またはアーカイブ組織標本と比較して要約され、カッパ統計を使用して定量化されます。

リキッドバイオプシー分析によって得られた腫瘍タイプごとの無細胞 DNA 収量および ctDNA 量を決定するために、記述的分析も実施されます。 さらに、腫瘍の種類別および分析前の変数別のアッセイ成功率は、以下を含む最小限の技術データ要素で実行されます。

• 採血管の種類
• サンプル構成
• 配送温度
• 血液分画法
• 分別までの時間
• 検体分離方法
• 冷凍庫までの時間
• 保管温度
• 濃度：細胞濃度または分子濃度
• アッセイ方法
• アッセイ時間