胃がん前駆体病変の病因と早期検出に関するマルチオミクス解析

研究対象集団はスウェーデン双生児登録（STR）の一部であり、1950年代後半の設立以来、1886年以降に生まれたすべての双生児からアンケートデータを収集してきた。 この特定の研究のデータは、STR 内の生涯にわたるスクリーニング (SALT) 研究のサブセットであり、1911 年から 1958 年の間に生まれたすべての双生児が 1998 年から 2002 年の間に面接を受けました。 TwinGene と名付けられたサブコホートは 2004 年から 2008 年にかけて設立され、参加者は一般的な疾患に関するアンケートに回答し、血液サンプルを提供するよう求められました。 1958年以前に生まれた双子1万2,618人からサンプルが採取され、そのうち1万2,609人からの血液サンプルが入手できた。 利用可能な環境データにリンクできなかった 10 サンプルを除外した後、合計 12,599 の血液サンプルが分析されました。 体体優位の CAG は、PGI/PGII 比が 3 未満であることが特徴です。血清サンプルを使用したメタボローム プロファイリングは、ナイチンゲール血液バイオマーカー分析プラットフォームに基づいて実行されました。 プロテオミクスプロファイリングは、Scanning SWATH と OLINK® Explore 384 Oncology パネルの両方によって実行されます。 ヘリコバクター ピロリ感染の病歴は、ELISA を使用してヘリコバクター ピロリに対する血清 IgG 抗体を測定することによって検査されます。 アンケートによって収集される詳細なライフスタイル情報には、教育、喫煙、嗅ぎタバコの浸し、飲酒、薬物使用、食事、身長/体重などが含まれます。代謝物は通常偏った分布のため、分析前に対数変換されます。 各代謝物について、まず、CAG 患者をすべての CAG のない対照と比較します。 ウィルコクソン・マン・ホイットニー検定またはクラスカル・ウォリス検定は、CAG グループと非 CAG グループ間のタンパク質発現の違いを比較するために使用され、多重比較はボンフェローニ補正を使用して調整されます。 ロバスト オプションを備えた一般化推定方程式 (GEE) モデルは、オッズ比 (OR) を推定するために適合されます。 第二に、MZ 共双子対照および DZ 共双子対照との比較では、不一致な CAG を持つ完全な双生児ペアのみが研究に含まれます。 具体的には、条件付きロジスティック回帰モデルを使用して、共双子ペア内のマッチングを制御します。 今後はメタボロミクスデータとプロテオミクスデータをさらに組み合わせて、CAG予測モデルの構築を試みます。 共変量には、年齢、性別、ピロリ菌血清陽性率、教育レベル、喫煙、嗅ぎタバコの浸し、および飲酒が含まれます。 さまざまな代謝産物の共同効果や他の共変量との相互作用も調べられます。