Multi-omics-analyses van de etiologie en vroege detectie van voorloperlaesies van maagkanker

De onderzoekspopulatie maakt deel uit van de Zweedse Tweelingregistratie (STR), die sinds de oprichting eind jaren vijftig vragenlijstgegevens verzamelt van alle tweelingen geboren na 1886. De gegevens in dit specifieke onderzoek zijn een subset van het Screening Across the Lifespan (SALT) onderzoek binnen de STR, waarin alle tweelingen geboren tussen 1911-1958 tussen 1998-2002 werden geïnterviewd. Het subcohort TwinGene werd tussen 2004 en 2008 opgezet toen deelnemers werden uitgenodigd om te reageren op een vragenlijst over veel voorkomende ziekten en om een ​​bloedmonster af te geven. Er werden monsters verzameld van 12.618 tweelingen geboren in 1958 of eerder, waarvan er van 12.609 bloedmonsters beschikbaar waren. Na het uitsluiten van 10 monsters die geen verband konden leggen met de beschikbare milieugegevens, werden in totaal 12.599 bloedmonsters geanalyseerd. Corpus-dominante CAG werd gekenmerkt door een PGI/PGII-verhouding van minder dan 3. Metabolomische profilering met behulp van serummonsters is uitgevoerd op basis van het Nightingale Blood Biomarker Analysis-platform. Proteomische profilering zal worden uitgevoerd door zowel Scanning SWATH als het OLINK® Explore 384 Oncology-panel. De geschiedenis van H. pylori-infectie wordt onderzocht door serum-IgG-antilichamen tegen H. pylori te meten met behulp van ELISA. Gedetailleerde levensstijlinformatie verzameld door vragenlijsten omvat opleiding, roken, snuiftabak, alcoholgebruik, drugsgebruik, voeding en lengte/gewicht, enz. Metabolieten zullen voorafgaand aan analyses in logbestanden worden getransformeerd, vanwege de doorgaans scheve verdeling ervan. Voor elke metaboliet zullen eerst CAG-patiënten worden vergeleken met alle CAG-vrije controles. De Wilcoxon-Mann-Whitney-test of Kruskal-Wallis-test zullen worden gebruikt voor het vergelijken van verschillen in eiwitexpressies tussen CAG- en niet-CAG-groepen, en meerdere vergelijkingen zullen worden aangepast met behulp van Bonferroni-correctie. Er zullen gegeneraliseerde schattingsvergelijkingsmodellen (GEE-modellen) met de robuuste optie worden toegepast om de odds ratio's (OR's) te schatten. Ten tweede zullen in de vergelijking met MZ co-twin controles en DZ co-twin controles alleen complete tweelingparen met dissonante CAG in het onderzoek worden opgenomen. Concreet zullen conditionele logistische regressiemodellen worden gebruikt om de matching binnen co-tweelingparen te controleren. We zullen metabolomics- en proteomics-gegevens verder combineren en proberen een CAG-voorspellingsmodel op te bouwen. Covariabelen zijn onder meer leeftijd, geslacht, H. pylori-seropositiviteit, opleidingsniveau, roken, snuiftabak en alcoholgebruik. Gezamenlijke effecten van verschillende metabolieten en interactie met andere covariaten zullen ook worden onderzocht.