Мультиомный анализ этиологии и раннего выявления поражений-предшественников рака желудка

Исследуемая популяция является частью Шведского реестра близнецов (STR), который с момента своего создания в конце 1950-х годов собирал анкетные данные всех близнецов, родившихся после 1886 года. Данные этого конкретного исследования являются частью исследования «Скрининг всей продолжительности жизни» (SALT) в рамках STR, в котором все близнецы, родившиеся в период 1911–1958 годов, были опрошены в период с 1998 по 2002 год. Подгруппа под названием TwinGene была создана в период с 2004 по 2008 год, когда участникам было предложено ответить на анкету о распространенных заболеваниях и сдать образец крови. Образцы были собраны у 12 618 близнецов, родившихся в 1958 году или ранее, из которых были доступны образцы крови от 12 609 близнецов. После исключения 10 образцов, которые не удалось связать с имеющимися данными об окружающей среде, всего было проанализировано 12 599 образцов крови. Корпус-доминантный CAG характеризовался соотношением PGI/PGII менее 3. Метаболомное профилирование с использованием образцов сыворотки было выполнено на основе платформы анализа биомаркеров крови Nightingale. Протеомное профилирование будет выполняться как с помощью Scanning SWATH, так и с помощью панели OLINK® Explore 384 Oncology. Анамнез инфекции H. pylori исследуют путем измерения сывороточных антител IgG против H. pylori с помощью ELISA. Подробная информация об образе жизни, собранная с помощью анкет, включает образование, курение, употребление табака, употребление алкоголя, употребление наркотиков, диету, рост/вес и т. д. Метаболиты будут преобразованы в журнал перед анализом из-за их обычно неравномерного распределения. Для каждого метаболита, во-первых, пациентов с CAG будут сравнивать со всеми контрольными группами без CAG. Тест Уилкоксона-Манна-Уитни или тест Крускала-Уоллиса будут использоваться для сравнения различий в экспрессии белка между группами CAG и без CAG, а множественные сравнения будут скорректированы с использованием поправки Бонферрони. Модели обобщенного уравнения оценки (GEE) с робастной опцией будут адаптированы для оценки отношений шансов (OR). Во-вторых, при сравнении с контрольными близнецами MZ и контрольными близнецами DZ в исследование будут включены только полные пары близнецов с дискордантным CAG. В частности, модели условной логистической регрессии будут использоваться для контроля совпадения внутри пар близнецов. Далее мы объединим данные метаболомики и протеомики и попытаемся построить модель прогнозирования CAG. Ковариаты будут включать возраст, пол, серопозитивность к H. pylori, уровень образования, курение, употребление нюхательного табака и употребление алкоголя. Также будут изучены совместные эффекты различных метаболитов и взаимодействие с другими ковариатами.