Multi-omics-analyser om ætiologi og tidlig påvisning af mavekræftprækursorlæsioner

Undersøgelsespopulationen er en del af det svenske tvillingeregister (STR), som siden etableringen i slutningen af ​​1950'erne har indsamlet spørgeskemadata fra alle tvillinger født efter 1886. Dataene i denne specifikke undersøgelse er en delmængde af Screening Across the Lifespan (SALT) undersøgelsen inden for STR, hvor alle tvillinger født mellem 1911-1958 blev interviewet mellem 1998-2002. Underkohorten ved navn TwinGene blev oprettet mellem årene 2004 og 2008, da deltagerne blev inviteret til at svare på et spørgeskema om almindelige sygdomme og give en blodprøve. Der blev indsamlet prøver fra 12.618 tvillinger født 1958 eller tidligere, hvoraf blodprøver fra 12.609 var tilgængelige. Efter at have ekskluderet 10 prøver, som ikke var i stand til at linke til de tilgængelige miljødata, blev i alt 12.599 blodprøver analyseret. Corpus-dominerende CAG var karakteriseret ved et PGI/PGII-forhold på mindre end 3. Metabolomisk profilering ved hjælp af serumprøver er blevet udført baseret på Nightingale Blood Biomarker Analysis-platform. Proteomisk profilering vil blive udført af både Scanning SWATH og OLINK® Explore 384 Oncology panel. Anamnese med H. pylori-infektion undersøges ved at måle serum IgG-antistoffer mod H. pylori ved hjælp af ELISA. Detaljerede livsstilsoplysninger indsamlet af spørgeskemaer omfatter uddannelse, rygning, snusdypning, alkoholindtagelse, stofbrug, kost og højde/vægt osv. Metabolitter vil blive logtransformeret forud for analyser på grund af deres normalt skæve fordeling. For hver metabolit vil for det første CAG-patienter blive sammenlignet med alle de CAG-frie kontroller. Wilcoxon-Mann-Whitney-testen eller Kruskal-Wallis-testen vil blive brugt til at sammenligne forskelle i proteinudtryk mellem CAG- og ikke-CAG-grupper, og flere sammenligninger vil blive justeret ved hjælp af Bonferroni-korrektion. Generaliserede estimationsligningsmodeller (GEE) med den robuste mulighed vil blive tilpasset til at estimere oddsratioerne (OR'er). For det andet, i sammenligningen med MZ co-twin kontroller og DZ co-twin kontroller, vil kun komplette tvillingepar med disharmonisk CAG blive inkluderet i undersøgelsen. Specifikt vil betingede logistiske regressionsmodeller blive brugt til at kontrollere for matchningen inden for co-tvillingpar. Vi vil yderligere kombinere metabolomics og proteomics data og forsøge at opbygge en CAG-forudsigelsesmodel. Kovariater vil omfatte alder, køn, H. pylori seropositivitet, uddannelsesniveau, rygning, snusdypning og alkoholdrikning. Fællesvirkninger af forskellige metabolitter og interaktion med andre kovariater vil også blive undersøgt.