Multi-omics analyser om etiologi och tidig upptäckt av magcancerprekursorlesioner

Studiepopulationen ingår i Svenska Tvillingregistret (STR), som sedan starten i slutet av 1950-talet samlat in enkätdata från alla tvillingar födda efter 1886. Data i denna specifika studie är en delmängd av Screening Across the Lifespan-studien (SALT) inom STR, där alla tvillingar födda mellan 1911-1958 intervjuades mellan 1998-2002. Underkohorten som heter TwinGene skapades mellan åren 2004 och 2008 då deltagarna bjöds in att svara på ett frågeformulär om vanliga sjukdomar och lämna ett blodprov. Prover togs från 12 618 tvillingar födda 1958 eller tidigare, varav blodprov från 12 609 fanns tillgängliga. Efter att ha exkluderat 10 prover som inte kunde länka till tillgängliga miljödata analyserades totalt 12 599 blodprover. Corpus-dominant CAG kännetecknades av ett PGI/PGII-förhållande på mindre än 3. Metabolomisk profilering med hjälp av serumprover har utförts baserat på Nightingale Blood Biomarker Analysis-plattform. Proteomisk profilering kommer att utföras av både Scanning SWATH och OLINK® Explore 384 Oncology panel. Historik av H. pylori-infektion undersöks genom att mäta serum-IgG-antikroppar mot H. pylori med hjälp av ELISA. Detaljerad livsstilsinformation som samlas in genom frågeformulär inkluderar utbildning, rökning, snusdoppning, alkoholdrickande, droganvändning, diet och längd/vikt, etc. Metaboliter kommer att logga omvandlas före analyser, på grund av dess vanligtvis skeva fördelning. För varje metabolit kommer för det första CAG-patienter att jämföras med alla CAG-fria kontroller. Wilcoxon-Mann-Whitney-testet eller Kruskal-Wallis-testet kommer att användas för att jämföra skillnader i proteinuttryck mellan CAG- och icke-CAG-grupper, och flera jämförelser kommer att justeras med Bonferroni-korrigering. Generaliserade skattningsekvationsmodeller (GEE) med det robusta alternativet kommer att anpassas för att uppskatta oddskvoterna (OR). För det andra, i jämförelsen med MZ co-twin kontroller och DZ co-twin kontroller, kommer endast kompletta tvillingpar med diskordant CAG att inkluderas i studien. Specifikt kommer villkorade logistiska regressionsmodeller att användas för att kontrollera matchningen inom samtvillingpar. Vi kommer att kombinera metabolomik och proteomikdata ytterligare och försöka bygga upp en CAG-prediktionsmodell. Kovariater kommer att inkludera ålder, kön, H. pylori seropositivitet, utbildningsnivå, rökning, snusdoppning och alkoholdrickande. Gemensamma effekter av olika metaboliter och interaktion med andra kovariater kommer också att undersökas.