Análisis multiómicos sobre la etiología y la detección temprana de lesiones precursoras del cáncer de estómago

La población de estudio forma parte del Registro Sueco de Gemelos (STR), que desde su creación a finales de la década de 1950 ha recopilado datos de cuestionarios de todos los gemelos nacidos después de 1886. Los datos de este estudio específico son un subconjunto del estudio Screening Across the Lifespan (SALT) dentro del STR, en el que todos los gemelos nacidos entre 1911 y 1958 fueron entrevistados entre 1998 y 2002. La subcohorte denominada TwinGene se creó entre los años 2004 y 2008 cuando se invitó a los participantes a responder un cuestionario sobre enfermedades comunes y proporcionar una muestra de sangre. Se recogieron muestras de 12.618 gemelos nacidos en 1958 o antes, de los cuales estaban disponibles muestras de sangre de 12.609. Después de excluir 10 muestras que no pudieron vincularse con los datos ambientales disponibles, se analizaron un total de 12.599 muestras de sangre. El CAG dominante en el cuerpo se caracterizó por una relación PGI/PGII inferior a 3. Se realizó un perfil metabolómico utilizando muestras de suero basándose en la plataforma de análisis de biomarcadores sanguíneos Nightingale. El perfil proteómico se realizará mediante el panel Scanning SWATH y OLINK® Explore 384 Oncology. El historial de infección por H. pylori se examina midiendo los anticuerpos IgG séricos contra H. pylori mediante ELISA. La información detallada sobre el estilo de vida recopilada mediante cuestionarios incluye educación, tabaquismo, rapé, consumo de alcohol, consumo de drogas, dieta y altura/peso, etc. Los metabolitos se transformarán logarítmicamente antes de los análisis, debido a su distribución generalmente sesgada. Para cada metabolito, en primer lugar, los pacientes con CAG se compararán con todos los controles libres de CAG. Se utilizará la prueba de Wilcoxon-Mann-Whitney o la prueba de Kruskal-Wallis para comparar diferencias de expresiones de proteínas entre grupos CAG y no CAG, y se ajustarán comparaciones múltiples mediante la corrección de Bonferroni. Se ajustarán modelos de ecuaciones de estimación generalizada (GEE) con la opción robusta para estimar los odds ratios (OR). En segundo lugar, en la comparación con los controles de gemelos MZ y los controles de gemelos DZ, solo se incluirán en el estudio pares de gemelos completos con CAG discordante. Específicamente, se utilizarán modelos de regresión logística condicional para controlar la coincidencia dentro de pares de gemelos. Combinaremos aún más datos de metabolómica y proteómica e intentaremos construir un modelo de predicción CAG. Las covariables incluirán edad, sexo, seropositividad a H. pylori, nivel educativo, tabaquismo, tabaco y consumo de alcohol. También se examinarán los efectos conjuntos de diferentes metabolitos y la interacción con otras covariables.