オックスフォード胸膜感染症のエンドタイピング研究 (TORPIDS-2)
胸膜感染症患者の胸水プロテオミクスは多様な好中球反応の特徴を示す: オックスフォード胸膜感染症エンドタイピング研究 (TORPIDS 2)
胸膜感染症は、世界中で発生率が増加している重篤な疾患です。 胸膜感染症のサブ表現型は依然として不明です。我々は、この疾患のエンドタイプを特定し、患者の表現型、微生物学、および臨床転帰の間の関連を評価する研究を計画しました。
80 個の胸水サンプルを非標識質量分析に供しました。
差次的に発現されたタンパク質の経路解析により、好中球の脱顆粒、解糖、ペントースリン酸経路、肝臓およびレチノイド X 受容体 (LXR-RXR) の活性化が特定されました。 好中球脱顆粒の増加は、解糖およびペントースリン酸活性化の増加と関連していました。
胸膜感染患者は、好中球媒介免疫、解糖、およびペントースリン酸活性化の多様な反応を示すプロテオームサインを示します。
調査の概要
詳細な説明
胸膜感染症は一般的かつ重篤な疾患であり、世界中で発生率が増加しています。 胸膜感染のエンドタイプは依然として不明です。 感染に対する根本的な生物学的反応における患者の多様性をより深く理解することは、治療と臨床転帰の改善につながる可能性があります。 私たちは、この疾患のエンドタイプを特定し、患者の表現型、微生物学、臨床転帰の間の関連性を評価することを目的として研究を計画しました。
私たちは、胸膜感染症に関する前向き研究である PILOT 研究からの 80 個の胸水サンプルを非標識質量分析に供しました。 サンプルの少なくとも 50% でタンパク質が検出された場合、タンパク質は保持されており、合計 449 個のタンパク質が得られました。 教師なし階層クラスタリングと UMAP 分析を使用してサンプルをクラスター化し、スピアマン法と正確なフィッシャー法を相関評価に使用して、タンパク質発現と臨床転帰を相関させました。
UMAP プロットにより、サンプルが 2 つの異なる異なるコホートに分離されました。 差次的に発現されたタンパク質の経路解析により、好中球の脱顆粒、解糖、ペントースリン酸経路、肝臓およびレチノイド X 受容体 (LXR-RXR) の活性化が同定されました。 好中球脱顆粒の増加は、解糖およびペントースリン酸活性化の増加と関連していました。 肺炎球菌が優勢な検体では、高度な好中球脱顆粒が見られました。 LXR-RXR 経路の活性の増加は生存率の向上と関連していました。
胸膜感染患者は、微生物学に関連する好中球媒介免疫、解糖、およびペントースリン酸活性化の多様な反応を示すプロテオームサインを示します。 アゴニストで LXR-XRX 経路を標的とする治療は生存率を改善する可能性があります。
研究の種類
入学 (実際)
連絡先と場所
研究場所
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Oxfordshire
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Oxford、Oxfordshire、イギリス、OX3 7FZ
- Laboratory of Pleural Translational Research, Nuffield Department of Medicine, University of Oxford
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
PILOT 臨床試験のために収集されたサンプル (DOI: 10.1183/13993003.00130-2020) TORPIDS-2 研究に使用されました。
患者は、胸膜感染症と一致する臨床症状を示し、以下の基準のいずれかに該当する場合に含まれた: 1. 肉眼的に化膿性の胸水; 2.または 2. 細菌感染の培養検査で陽性となった胸水。または 3. グラム染色で細菌を示した胸水。感染の臨床的証拠がある患者のpH 7.2以下(血液ガス分析器で測定)または低血糖値(3 mmol・L-1以下または55 mg・dL-1以下)の胸水;または 4.または 5. 感染の臨床的証拠がある患者における胸膜感染の造影コンピュータ断層撮影 (CT) の証拠 (胸膜収集の強化による下層の肺の強化)、および他の感染源の除外。 感染の証拠は、発熱、末梢血白血球数の上昇、または C 反応性タンパク質 (CRP) などの血清炎症マーカーの上昇に基づいて、採用医師によって評価されました。 研究除外基準は次のとおりであった: 1. 年齢 <18 歳; 2. 分析に利用できる胸水がない。 3. 胸膜感染症側の以前の肺切除術。 4. 採用担当医師の判断による、併存疾患により予想生存期間が 3 か月未満である。
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
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登録
すべてのサンプルは、PILOT 研究の患者登録時に収集されました (PMID: 32675200、ISRCTN 50236700)
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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胸膜感染のエンドタイプ
時間枠:12ヶ月
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胸膜感染の生物学的エンドタイプの発見
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12ヶ月
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エンドタイプと微生物学の関係
時間枠:12ヶ月
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胸膜感染症のエンドタイプと微生物学の関連性を調査する
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12ヶ月
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エンドタイプと1年生存との関連性
時間枠:12ヶ月
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胸膜感染のエンドタイプと1年生存率との関連を調査する
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12ヶ月
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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エンドタイプと外科的治療の必要性との関連性
時間枠:12ヶ月
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胸膜感染症のエンドタイプと外科的治療の必要性との関連性を調査する
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12ヶ月
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胸水プラスミノーゲンと好中球エラスターゼのレベル間の関連
時間枠:12ヶ月
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胸水プラスミノーゲンと好中球エラスターゼタンパク質レベルの関連性を調査する
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12ヶ月
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協力者と研究者
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出版物と役立つリンク
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (実際)
研究の完了 (実際)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
その他の研究ID番号
- R74885/RE001
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個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
IPD プランの説明
IPD 共有サポート情報タイプ
- STUDY_PROTOCOL
- ICF
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
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