Lo studio di endotipizzazione delle infezioni pleuriche di Oxford (TORPIDS-2)
La proteomica del liquido pleurico di pazienti con infezione pleurica mostra segni di diverse risposte neutrofile: lo studio di endotipizzazione delle infezioni pleuriche di Oxford (TORPIDS 2)
L’infezione pleurica è una malattia grave con crescente incidenza in tutto il mondo. I sottofenotipi dell'infezione pleurica rimangono sconosciuti. Abbiamo progettato uno studio per endotipizzare la malattia e valutare l'associazione tra fenotipo del paziente, microbiologia ed esito clinico.
Abbiamo sottoposto 80 campioni di liquido pleurico alla spettrometria di massa senza etichetta.
L'analisi del percorso delle proteine differenzialmente espresse ha identificato la degranulazione dei neutrofili, la glicolisi, la via del pentoso fosfato e l'attivazione del fegato e dei recettori dei retinoidi X (LXR-RXR). Una maggiore degranulazione dei neutrofili è stata associata ad un aumento della glicolisi e all’attivazione del pentoso fosfato.
I pazienti con infezione pleurica mostrano firme proteomiche che indicano diverse risposte di immunità mediata dai neutrofili, glicolisi e attivazione del pentoso fosfato.
Panoramica dello studio
Stato
Descrizione dettagliata
L’infezione pleurica è una malattia comune e grave con un’incidenza crescente in tutto il mondo. Gli endotipi dell’infezione pleurica rimangono sconosciuti. Una migliore comprensione della variazione del paziente nella risposta biologica sottostante all’infezione può portare a trattamenti e risultati clinici migliori. Abbiamo progettato uno studio con l'obiettivo di endotipizzare la malattia e valutare l'associazione tra fenotipo del paziente, microbiologia ed esito clinico.
Abbiamo sottoposto 80 campioni di liquido pleurico provenienti dallo studio PILOT, uno studio prospettico sull'infezione pleurica, alla spettrometria di massa senza etichetta. Le proteine venivano trattenute se venivano rilevate in almeno il 50% dei campioni, per un totale di 449 proteine. Per raggruppare i campioni sono stati utilizzati il clustering gerarchico non supervisionato e le analisi UMAP, per la valutazione della correlazione sono stati utilizzati i metodi di Spearman e Fischer esatti e l'espressione proteica è stata correlata ai risultati clinici.
Il grafico UMAP ha separato i campioni in due coorti diverse e distinte. L'analisi del percorso delle proteine differenzialmente espresse ha identificato la degranulazione dei neutrofili, la glicolisi, la via del pentoso fosfato e l'attivazione dei recettori X del fegato e dei retinoidi (LXR-RXR). Una maggiore degranulazione dei neutrofili è stata associata ad un aumento della glicolisi e all’attivazione del pentoso fosfato. I campioni dominati da Streptococcus Pneumoniae hanno mostrato un'elevata degranulazione dei neutrofili. Una maggiore attività del percorso LXR-RXR è stata associata a una migliore sopravvivenza.
I pazienti con infezione pleurica mostrano firme proteomiche che indicano diverse risposte di immunità mediata dai neutrofili, glicolisi e attivazione del pentoso fosfato che erano associate alla microbiologia. Il targeting terapeutico della via LXR-XRX con agonisti può migliorare la sopravvivenza.
Tipo di studio
Iscrizione (Effettivo)
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
-
-
Oxfordshire
-
Oxford, Oxfordshire, Regno Unito, OX3 7FZ
- Laboratory of Pleural Translational Research, Nuffield Department of Medicine, University of Oxford
-
-
Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
- Adulto
- Adulto più anziano
Accetta volontari sani
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Campioni raccolti per la sperimentazione clinica PILOT (DOI: 10.1183/13993003.00130-2020) utilizzato per lo studio TORPIDS-2.
I pazienti venivano inclusi se presentavano una presentazione clinica compatibile con un'infezione pleurica e uno qualsiasi dei seguenti criteri: 1. liquido pleurico macroscopicamente purulento; o 2. liquido pleurico positivo alla coltura per infezione batterica; o 3. liquido pleurico che presentava presenza di batteri alla colorazione di Gram; o 4. liquido pleurico con pH ≤7,2 (misurato mediante emogasanalizzatore) o basso livello di glucosio (≤3 mmol·L-1 o ≤55 mg·dL-1) in un paziente con evidenza clinica di infezione; o 5. evidenza della tomografia computerizzata (TC) con mezzo di contrasto di infezione pleurica (consolidamento del polmone sottostante con aumento della raccolta pleurica) in un paziente con evidenza clinica di infezione, insieme all'esclusione di altre fonti di infezione. La prova dell'infezione è stata valutata dal medico reclutatore sulla base della febbre, di un'elevata conta dei globuli bianchi nel sangue periferico o di marcatori infiammatori sierici elevati come la proteina C-reattiva (CRP). I criteri di esclusione dallo studio erano i seguenti: 1. età <18 anni; 2. nessun liquido pleurico disponibile per l'analisi; 3. precedente pneumonectomia dal lato dell'infezione pleurica; e 4. sopravvivenza prevista <3 mesi a causa di comorbilità, secondo il giudizio del medico reclutante.
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
|---|
|
Iscrizione
Tutti i campioni sono stati raccolti al momento dell'arruolamento dei pazienti per lo studio PILOT (PMID: 32675200, ISRCTN 50236700)
|
Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
|
Endotipi di infezione pleurica
Lasso di tempo: 12 mesi
|
Scoperta degli endotipi biologici dell'infezione pleurica
|
12 mesi
|
|
Associazione tra endotipi e microbiologia
Lasso di tempo: 12 mesi
|
Indagare l'associazione tra endotipi di infezione pleurica e microbiologia
|
12 mesi
|
|
Associazione tra endotipi e sopravvivenza a un anno
Lasso di tempo: 12 mesi
|
Indagare l'associazione tra endotipi di infezione pleurica e sopravvivenza a un anno
|
12 mesi
|
Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
|
Associazione tra endotipi e necessità di trattamento chirurgico
Lasso di tempo: 12 mesi
|
Indagare l'associazione tra endotipi di infezione pleurica e necessità di trattamento chirurgico
|
12 mesi
|
|
Associazione tra i livelli di plasminogeno nel liquido pleurico e di elastasi dei neutrofili
Lasso di tempo: 12 mesi
|
Studiare l'associazione tra i livelli di plasminogeno nel liquido pleurico e di proteina elastasi dei neutrofili
|
12 mesi
|
Collaboratori e investigatori
Sponsor
Pubblicazioni e link utili
Studiare le date dei record
Studia le date principali
Inizio studio (Effettivo)
Completamento primario (Effettivo)
Completamento dello studio (Effettivo)
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Effettivo)
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
- R74885/RE001
Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)
Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?
Descrizione del piano IPD
Tipo di informazioni di supporto alla condivisione IPD
- STUDIO_PROTOCOLLO
- ICF
Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio
Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .