L'étude d'endotypage des infections pleurales d'Oxford (TORPIDS-2)
La protéomique du liquide pleural de patients atteints d'une infection pleurale montre les signatures de diverses réponses neutrophiles : l'étude d'endotypage de l'infection pleurale d'Oxford (TORPIDS 2)
L’infection pleurale est une maladie grave dont l’incidence augmente dans le monde. Les sous-phénotypes de l'infection pleurale restent inconnus. Nous avons conçu une étude pour endotyper la maladie et évaluer l'association entre le phénotype du patient, la microbiologie et les résultats cliniques.
Nous avons soumis 80 échantillons de liquide pleural à une spectrométrie de masse non marquée.
L'analyse de la voie des protéines différentiellement exprimées a identifié la dégranulation des neutrophiles, la glycolyse, la voie du pentose phosphate et l'activation des récepteurs X du foie et des rétinoïdes (LXR-RXR). Une dégranulation plus élevée des neutrophiles était associée à une augmentation de la glycolyse et de l'activation du pentose phosphate.
Les patients atteints d'une infection pleurale présentent des signatures protéomiques indiquant diverses réponses d'immunité médiée par les neutrophiles, de glycolyse et d'activation du pentose phosphate.
Aperçu de l'étude
Statut
Description détaillée
L’infection pleurale est une maladie courante et grave dont l’incidence est croissante dans le monde. Les endotypes de l'infection pleurale restent inconnus. Une meilleure compréhension de la variation des patients dans la réponse biologique sous-jacente à l’infection pourrait conduire à de meilleurs traitements et résultats cliniques. Nous avons conçu une étude dans le but d'endotyper la maladie et d'évaluer l'association entre le phénotype du patient, la microbiologie et les résultats cliniques.
Nous avons soumis 80 échantillons de liquide pleural de l'étude PILOT, une étude prospective sur l'infection pleurale, à une spectrométrie de masse non marquée. Les protéines ont été retenues si elles étaient détectées dans au moins 50 % des échantillons, soit un total de 449 protéines. Un regroupement hiérarchique non supervisé et des analyses UMAP ont été utilisés pour regrouper les échantillons, les méthodes de Spearman et exactes de Fischer ont été utilisées pour l'évaluation de la corrélation et l'expression des protéines a été corrélée aux résultats cliniques.
Le tracé UMAP a séparé les échantillons en deux cohortes différentes et distinctes. L'analyse de la voie des protéines différentiellement exprimées a identifié la dégranulation des neutrophiles, la glycolyse, la voie des pentoses phosphates et l'activation des récepteurs X du foie et des rétinoïdes (LXR-RXR). Une dégranulation plus élevée des neutrophiles était associée à une augmentation de la glycolyse et de l'activation du pentose phosphate. Les spécimens dominés par Streptococcus Pneumoniae présentaient une dégranulation élevée des neutrophiles. Une activité accrue de la voie LXR-RXR était associée à une meilleure survie.
Les patients atteints d'une infection pleurale présentent des signatures protéomiques indiquant diverses réponses d'immunité médiée par les neutrophiles, de glycolyse et d'activation du pentose phosphate associées à la microbiologie. Le ciblage thérapeutique de la voie LXR-XRX avec des agonistes peut améliorer la survie.
Type d'étude
Inscription (Réel)
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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Oxfordshire
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Oxford, Oxfordshire, Royaume-Uni, OX3 7FZ
- Laboratory of Pleural Translational Research, Nuffield Department of Medicine, University of Oxford
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
- Adulte
- Adulte plus âgé
Accepte les volontaires sains
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Échantillons collectés pour l'essai clinique PILOT (DOI : 10.1183/13993003.00130-2020) utilisé pour l’étude TORPIDS-2.
Les patients ont été inclus s'ils présentaient une présentation clinique compatible avec une infection pleurale et l'un des critères suivants : 1. liquide pleural macroscopiquement purulent ; ou 2. liquide pleural dont la culture était positive pour une infection bactérienne ; ou 3. liquide pleural présentant des bactéries lors de la coloration de Gram ; ou 4. liquide pleural avec un pH ≤7,2 (mesuré par un analyseur des gaz du sang) ou un faible taux de glucose (≤3 mmol·L-1 ou ≤55 mg·dL-1) chez un patient présentant des signes cliniques d'infection ; ou 5. preuve par tomodensitométrie (TDM) avec contraste d'une infection pleurale (consolidation du poumon sous-jacent avec amélioration de la collection pleurale) chez un patient présentant des signes cliniques d'infection, ainsi que l'exclusion d'autres sources d'infection. Les signes d'infection ont été évalués par le médecin recruteur sur la base de la fièvre, d'un nombre élevé de globules blancs dans le sang périphérique ou de marqueurs inflammatoires sériques élevés tels que la protéine C-réactive (CRP). Les critères d'exclusion de l'étude étaient les suivants : 1. âge < 18 ans ; 2. aucun liquide pleural disponible pour l'analyse ; 3. pneumonectomie antérieure du côté d'une infection pleurale ; et 4. survie attendue <3 mois en raison d'une maladie comorbide, telle que jugée par le médecin recruteur.
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
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Inscription
Tous les échantillons ont été collectés lors du recrutement des patients pour l'étude PILOT (PMID : 32675200, ISRCTN 50236700).
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Endotypes d'infection pleurale
Délai: 12 mois
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Découverte d'endotypes biologiques d'infection pleurale
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12 mois
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Association entre endotypes et microbiologie
Délai: 12 mois
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Étudier l'association entre les endotypes d'infection pleurale et la microbiologie
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12 mois
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Association entre les endotypes et la survie à un an
Délai: 12 mois
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Étudier l'association entre les endotypes d'infection pleurale et la survie à un an
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12 mois
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Association entre endotypes et nécessité d’un traitement chirurgical
Délai: 12 mois
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Étudier l'association entre les endotypes d'infection pleurale et la nécessité d'un traitement chirurgical
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12 mois
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Association entre les niveaux de plasminogène du liquide pleural et d'élastase des neutrophiles
Délai: 12 mois
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Étudier l'association entre les niveaux de plasminogène du liquide pleural et de protéine élastase des neutrophiles
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12 mois
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Publications et liens utiles
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Réel)
Achèvement de l'étude (Réel)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- R74885/RE001
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- CIF
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