Badanie endotypowania infekcji opłucnej w Oksfordzie (TORPIDS-2)
Proteomika płynu opłucnowego od pacjentów z zakażeniem opłucnej wykazuje sygnatury różnorodnych odpowiedzi neutrofilowych: badanie endotypowania infekcji opłucnej Oxfordu (TORPIDS 2)
Zakażenie opłucnej jest poważną chorobą, której częstość występowania wzrasta na całym świecie. Podfenotypy zakażenia opłucnej pozostają nieznane. Zaprojektowaliśmy badanie mające na celu endotypowanie choroby i ocenę związku między fenotypem pacjenta, mikrobiologią i wynikami klinicznymi.
Poddaliśmy 80 próbek płynu opłucnowego nieznakowanej spektrometrii mas.
Analiza szlaków białek ulegających różnej ekspresji pozwoliła zidentyfikować degranulację neutrofilów, glikolizę, szlak pentozofosforanowy oraz aktywację wątroby i receptorów X retinoidowych (LXR-RXR). Silniejsza degranulacja neutrofilów była powiązana ze zwiększoną glikolizą i aktywacją pentozofosforanu.
Pacjenci z zakażeniem opłucnej wykazują sygnatury proteomiczne wskazujące na różnorodne reakcje odporności zależnej od neutrofili, glikolizy i aktywacji pentozofosforanu.
Przegląd badań
Status
Szczegółowy opis
Zakażenie opłucnej jest powszechną i ciężką chorobą, której częstość występowania rośnie na całym świecie. Endotypy zakażenia opłucnej pozostają nieznane. Lepsze zrozumienie zmienności biologicznej odpowiedzi pacjenta na infekcję może prowadzić do ulepszonych metod leczenia i wyników klinicznych. Zaprojektowaliśmy badanie, którego celem było endotypowanie choroby i ocena związku między fenotypem pacjenta, mikrobiologią i wynikami klinicznymi.
Poddaliśmy 80 próbek płynu opłucnowego z badania PILOT – prospektywnego badania dotyczącego infekcji opłucnej – nieznakowanej spektrometrii mas. Białka zatrzymywano, jeśli wykryto je w co najmniej 50% próbek, co dało w sumie 449 białek. Do grupowania próbek zastosowano nienadzorowane grupowanie hierarchiczne i analizy UMAP, do oceny korelacji zastosowano metody Spearmana i dokładne metody Fischera, a ekspresję białka skorelowano z wynikami klinicznymi.
Wykres UMAP podzielił próbki na dwie różne i odrębne kohorty. Analiza szlaków białek ulegających różnej ekspresji pozwoliła zidentyfikować degranulację neutrofilów, glikolizę, szlak pentozofosforanowy oraz aktywację wątroby i receptorów X retinoidowych (LXR-RXR). Silniejsza degranulacja neutrofilów była powiązana ze zwiększoną glikolizą i aktywacją pentozofosforanu. Próbki zdominowane przez Streptococcus Pneumoniae wykazywały wysoką degranulację neutrofilów. Zwiększona aktywność szlaku LXR-RXR była powiązana z lepszym przeżyciem.
Pacjenci z zakażeniem opłucnej wykazują sygnatury proteomiczne wskazujące na różnorodne reakcje odporności zależnej od neutrofili, glikolizy i aktywacji pentozofosforanu, które są powiązane z mikrobiologią. Terapia ukierunkowana na szlak LXR-XRX za pomocą agonistów może poprawić przeżycie.
Typ studiów
Zapisy (Rzeczywisty)
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
Oxfordshire
-
Oxford, Oxfordshire, Zjednoczone Królestwo, OX3 7FZ
- Laboratory of Pleural Translational Research, Nuffield Department of Medicine, University of Oxford
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Próbki pobrane do badania klinicznego PILOT (DOI: 10.1183/13993003.00130-2020) wykorzystano w badaniu TORPIDS-2.
Do badania włączano pacjentów, których obraz kliniczny wskazywał na zakażenie opłucnej i którekolwiek z poniższych kryteriów: 1. makroskopowo ropny płyn opłucnowy; lub 2. płyn opłucnowy, którego posiew wykazał zakażenie bakteryjne; lub 3. płyn opłucnowy, w którym w barwieniu metodą Grama wykazano obecność bakterii; lub 4. płyn opłucnowy o pH ≤7,2 (mierzonym gazometrią) lub niskim stężeniu glukozy (≤3 mmol·L-1 lub ≤55 mg·dL-1) u pacjenta z klinicznymi objawami zakażenia; lub 5. tomografia komputerowa ze wzmocnieniem kontrastowym (CT) wykazująca zakażenie opłucnej (konsolidacja leżącego pod spodem płuca ze wzmocnionym zbiorem opłucnej) u pacjenta z klinicznymi objawami zakażenia, przy wykluczeniu innych źródeł zakażenia. Lekarz rekrutujący ocenił dowody zakażenia na podstawie gorączki, podwyższonej liczby białych krwinek we krwi obwodowej lub podwyższonych markerów stanu zapalnego w surowicy, takich jak białko C-reaktywne (CRP). Kryteria wyłączenia z badania były następujące: 1. wiek <18 lat; 2. brak płynu opłucnowego do analizy; 3. przebyta pneumonektomia po stronie zakażenia opłucnej; oraz 4. oczekiwane przeżycie <3 miesięcy z powodu chorób współistniejących, według oceny lekarza rekrutującego.
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
|---|
|
Zapisy
Wszystkie próbki pobrano podczas rekrutacji pacjentów do badania PILOTOWEGO (PMID: 32675200, ISRCTN 50236700)
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Endotypy infekcji opłucnej
Ramy czasowe: 12 miesięcy
|
Odkrycie biologicznych endotypów infekcji opłucnej
|
12 miesięcy
|
|
Związek między endotypami a mikrobiologią
Ramy czasowe: 12 miesięcy
|
Zbadaj związek między endotypami infekcji opłucnej a mikrobiologią
|
12 miesięcy
|
|
Związek między endotypami a przeżyciem jednego roku
Ramy czasowe: 12 miesięcy
|
Zbadaj związek między endotypami zakażenia opłucnej a rocznym przeżyciem
|
12 miesięcy
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Związek między endotypami a koniecznością leczenia chirurgicznego
Ramy czasowe: 12 miesięcy
|
Zbadaj związek między endotypami zakażenia opłucnej a koniecznością leczenia chirurgicznego
|
12 miesięcy
|
|
Związek między poziomami plazminogenu płynu opłucnowego i elastazy neutrofilowej
Ramy czasowe: 12 miesięcy
|
Zbadaj związek między poziomem plazminogenu płynu opłucnowego a poziomem białka elastazy neutrofilowej
|
12 miesięcy
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Publikacje i pomocne linki
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Ukończenie studiów (Rzeczywisty)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- R74885/RE001
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Opis planu IPD
Typ informacji pomocniczych dotyczących udostępniania IPD
- PROTOKÓŁ BADANIA
- ICF
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .