Oxfordská studie endotypizace pleurální infekce (TORPIDS-2)
Proteomika pleurální tekutiny od pacientů s pleurální infekcí vykazuje znaky různých neutrofilních odpovědí: Oxfordská studie endotypizace pleurální infekce (TORPIDS 2)
Pleurální infekce je závažné onemocnění s celosvětově rostoucím výskytem. Subfenotypy pleurální infekce zůstávají neznámé. Navrhli jsme studii k endotypizaci onemocnění a posouzení souvislosti mezi fenotypem pacienta, mikrobiologií a klinickým výsledkem.
Podrobili jsme 80 vzorků pleurální tekutiny neznačené hmotnostní spektrometrii.
Analýza dráhy odlišně exprimovaných proteinů identifikovala degranulaci neutrofilů, glykolýzu, pentózofosfátovou dráhu a aktivaci jaterních a retinoidních X receptorů (LXR-RXR). Vyšší degranulace neutrofilů byla spojena se zvýšenou glykolýzou a aktivací pentózofosfátu.
Pacienti s pleurální infekcí vykazují proteomické signatury indikující různé reakce neutrofily zprostředkované imunity, glykolýzy a aktivace pentózofosfátu.
Přehled studie
Postavení
Detailní popis
Pleurální infekce je běžné a závažné onemocnění s celosvětově rostoucím výskytem. Endotypy pleurální infekce zůstávají neznámé. Lepší pochopení variací pacientů v základní biologické odpovědi na infekci může vést ke zlepšení léčby a klinickým výsledkům. Navrhli jsme studii s cílem endotypovat onemocnění a posoudit souvislost mezi fenotypem pacienta, mikrobiologií a klinickým výsledkem.
Podrobili jsme 80 vzorků pleurální tekutiny ze studie PILOT, prospektivní studie pleurální infekce, neznačené hmotnostní spektrometrii. Proteiny byly zachovány, pokud byly detekovány v alespoň 50 % vzorků, což mělo za následek celkem 449 proteinů. Ke shlukování vzorků bylo použito neřízené hierarchické shlukování a UMAP analýzy, pro hodnocení korelace byly použity Spearmanovy a exaktní Fischerovy metody a exprese proteinů byla korelována s klinickými výsledky.
Vynesení UMAP rozdělilo vzorky do dvou různých a odlišných kohort. Analýza dráhy odlišně exprimovaných proteinů identifikovala degranulaci neutrofilů, glykolýzu, dráhu pentózafosfátu a aktivaci jaterních a retinoidních X receptorů (LXR-RXR). Vyšší degranulace neutrofilů byla spojena se zvýšenou glykolýzou a aktivací pentózofosfátu. Vzorky ovládané Streptococcus Pneumoniae vykazovaly vysokou degranulaci neutrofilů. Zvýšená aktivita dráhy LXR-RXR byla spojena s lepším přežitím.
Pacienti s pleurální infekcí vykazují proteomické znaky indikující různé reakce neutrofily zprostředkované imunity, glykolýzy a aktivace pentózofosfátu, které byly spojeny s mikrobiologií. Terapeutické cílení na dráhu LXR-XRX pomocí agonistů může zlepšit přežití.
Typ studie
Zápis (Aktuální)
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
Oxfordshire
-
Oxford, Oxfordshire, Spojené království, OX3 7FZ
- Laboratory of Pleural Translational Research, Nuffield Department of Medicine, University of Oxford
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Vzorky odebrané pro PILOT klinickou studii (DOI: 10.1183/13993003.00130-2020) použitý pro studii TORPIDS-2.
Pacienti byli zahrnuti, pokud měli klinický obraz odpovídající pleurální infekci a kterékoli z následujících kritérií: 1. pleurální tekutina, která byla makroskopicky hnisavá; nebo 2. pleurální tekutina, která byla pozitivní při kultivaci na bakteriální infekci; nebo 3. pleurální tekutina, která prokázala bakterie při barvení podle Grama; nebo 4. pleurální tekutina s pH ≤7,2 (měřeno analyzátorem krevních plynů) nebo nízkou hladinou glukózy (≤3 mmol·L-1 nebo ≤55 mg·dL-1) u pacienta s klinickými známkami infekce; nebo 5. kontrastní počítačová tomografie (CT) průkaz pleurální infekce (konsolidace spodní plíce se zesíleným pleurálním sběrem) u pacienta s klinickými známkami infekce, spolu s vyloučením jiných zdrojů infekce. Důkaz infekce byl hodnocen přijímajícím lékařem na základě horečky, zvýšeného počtu bílých krvinek v periferní krvi nebo zvýšených sérových zánětlivých markerů, jako je C-reaktivní protein (CRP). Kritéria pro vyloučení ze studie byla následující: 1. věk <18 let; 2. není k dispozici pleurální tekutina pro analýzu; 3. předchozí pneumonektomie na straně pleurální infekce; a 4. očekávané přežití < 3 měsíce v důsledku komorbidního onemocnění, jak posoudil přijímací lékař.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
|---|
|
Zápis
Všechny vzorky byly odebrány při zařazování pacientů do studie PILOT (PMID: 32675200, ISRCTN 50236700)
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Endotypy pleurální infekce
Časové okno: 12 měsíců
|
Objev biologických endotypů pleurální infekce
|
12 měsíců
|
|
Asociace mezi endotypy a mikrobiologií
Časové okno: 12 měsíců
|
Zkoumejte souvislost mezi endotypy pleurální infekce a mikrobiologií
|
12 měsíců
|
|
Asociace mezi endotypy a jednoročním přežitím
Časové okno: 12 měsíců
|
Zkoumejte souvislost mezi endotypy pleurální infekce a jednoročním přežitím
|
12 měsíců
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Asociace mezi endotypy a potřebou chirurgické léčby
Časové okno: 12 měsíců
|
Zkoumejte souvislost mezi endotypy pleurální infekce a potřebou chirurgické léčby
|
12 měsíců
|
|
Asociace mezi hladinami plazminogenu pleurální tekutiny a neutrofilní elastázy
Časové okno: 12 měsíců
|
Zkoumejte souvislost mezi hladinami plazminogenu v pleurální tekutině a hladinami proteinu neutrofilní elastázy
|
12 měsíců
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Publikace a užitečné odkazy
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Aktuální)
Dokončení studie (Aktuální)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- R74885/RE001
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Popis plánu IPD
Typ podpůrných informací pro sdílení IPD
- PROTOKOL STUDY
- ICF
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .