O estudo de endotipagem de infecção pleural de Oxford (TORPIDS-2)

A infecção pleural é uma doença comum e grave, com incidência crescente em todo o mundo. Os endotipos da infecção pleural permanecem desconhecidos. Uma melhor compreensão da variação do paciente na resposta biológica subjacente à infecção pode levar a melhores tratamentos e resultados clínicos. Desenhamos um estudo com o objetivo de endotipar a doença e avaliar a associação entre fenótipo do paciente, microbiologia e evolução clínica.

Submetemos 80 amostras de líquido pleural do estudo PILOT, um estudo prospectivo sobre infecção pleural, à espectrometria de massa não marcada. As proteínas foram retidas se fossem detectadas em pelo menos 50% das amostras, resultando em um total de 449 proteínas. Agrupamento hierárquico não supervisionado e análises UMAP foram usados ​​para agrupar amostras, os métodos exatos de Spearman e Fischer foram usados ​​para avaliação de correlação e a expressão proteica foi correlacionada com resultados clínicos.

A plotagem UMAP separou as amostras em duas coortes diferentes e distintas. A análise da via das proteínas diferencialmente expressas identificou desgranulação de neutrófilos, glicólise, via das pentoses fosfato e ativação dos receptores X do fígado e retinóides (LXR-RXR). Maior desgranulação de neutrófilos foi associada ao aumento da glicólise e ativação de pentose fosfato. Espécimes dominados por Streptococcus Pneumoniae exibiram alta desgranulação de neutrófilos. O aumento da atividade da via LXR-RXR foi associado a uma melhor sobrevida.

Pacientes com infecção pleural exibem assinaturas proteômicas indicando diversas respostas de imunidade mediada por neutrófilos, glicólise e ativação de pentose fosfato que foram associadas à microbiologia. O direcionamento terapêutico da via LXR-XRX com agonistas pode melhorar a sobrevida.