El estudio de endotipado de la infección pleural de Oxford (TORPIDS-2)

La infección pleural es una enfermedad común y grave con una incidencia cada vez mayor en todo el mundo. Los endotipos de infección pleural siguen siendo desconocidos. Una mejor comprensión de la variación de los pacientes en la respuesta biológica subyacente a la infección puede conducir a mejores tratamientos y resultados clínicos. Diseñamos un estudio con el objetivo de endotipar la enfermedad y evaluar la asociación entre el fenotipo del paciente, la microbiología y el resultado clínico.

Sometimos 80 muestras de líquido pleural del estudio PILOT, un estudio prospectivo sobre infección pleural, a espectrometría de masas no marcada. Las proteínas se retuvieron si se detectaron en al menos el 50 % de las muestras, lo que dio como resultado un total de 449 proteínas. Se utilizaron agrupamientos jerárquicos no supervisados ​​y análisis UMAP para agrupar las muestras, se utilizaron los métodos de Spearman y Fischer exacto para la evaluación de la correlación y la expresión de proteínas se correlacionó con los resultados clínicos.

El trazado UMAP separó las muestras en dos cohortes diferentes y distintas. El análisis de la vía de las proteínas expresadas diferencialmente identificó la desgranulación de los neutrófilos, la glucólisis, la vía de las pentosas fosfato y la activación de los receptores hepáticos y de retinoides X (LXR-RXR). Una mayor desgranulación de neutrófilos se asoció con un aumento de la glucólisis y la activación de las pentosas fosfato. Los especímenes dominados por Streptococcus Pneumoniae exhibieron una alta desgranulación de neutrófilos. Una mayor actividad de la vía LXR-RXR se asoció con una mejor supervivencia.

Los pacientes con infección pleural exhiben firmas proteómicas que indican diversas respuestas de inmunidad mediada por neutrófilos, glucólisis y activación de pentosas fosfato que se asociaron con la microbiología. La terapia dirigida a la vía LXR-XRX con agonistas puede mejorar la supervivencia.