Оксфордское исследование эндотипирования плевральной инфекции (TORPIDS-2)
Протеомика плевральной жидкости пациентов с плевральной инфекцией демонстрирует признаки разнообразных нейтрофильных реакций: Оксфордское исследование эндотипирования плевральной инфекции (TORPIDS 2)
Плевральная инфекция является тяжелым заболеванием, заболеваемость которого растет во всем мире. Субфенотипы плевральной инфекции остаются неизвестными. Мы разработали исследование для эндотипирования заболевания и оценки связи между фенотипом пациента, микробиологией и клиническим исходом.
Мы подвергли 80 образцов плевральной жидкости немеченой масс-спектрометрии.
Анализ путей дифференциально экспрессируемых белков выявил дегрануляцию нейтрофилов, гликолиз, пентозофосфатный путь, а также активацию печени и ретиноидных X-рецепторов (LXR-RXR). Более высокая дегрануляция нейтрофилов была связана с усилением гликолиза и активации пентозофосфата.
У пациентов с плевральной инфекцией наблюдаются протеомные признаки, указывающие на разнообразные реакции нейтрофильно-опосредованного иммунитета, гликолиза и активации пентозофосфата.
Обзор исследования
Статус
Подробное описание
Плевральная инфекция является распространенным и тяжелым заболеванием, заболеваемость которого растет во всем мире. Эндотипы плевральной инфекции остаются неизвестными. Лучшее понимание различий у пациентов в основной биологической реакции на инфекцию может привести к улучшению лечения и клинических результатов. Мы разработали исследование с целью эндотипировать заболевание и оценить связь между фенотипом пациента, микробиологией и клиническим исходом.
Мы подвергли 80 образцов плевральной жидкости из исследования PILOT, проспективного исследования плевральной инфекции, немеченой масс-спектрометрии. Белки сохранялись, если они были обнаружены как минимум в 50% образцов, в результате чего всего было обнаружено 449 белков. Для кластеризации образцов использовались неконтролируемая иерархическая кластеризация и анализ UMAP, для оценки корреляции использовались методы Спирмена и точные методы Фишера, а экспрессия белка коррелировала с клиническими результатами.
График UMAP разделил образцы на две разные и разные когорты. Анализ путей дифференциально экспрессируемых белков выявил дегрануляцию нейтрофилов, гликолиз, пентозофосфатный путь, а также активацию печени и ретиноидных X-рецепторов (LXR-RXR). Более высокая дегрануляция нейтрофилов была связана с усилением гликолиза и активации пентозофосфата. В образцах с доминированием Streptococcus Pneumoniae наблюдалась высокая дегрануляция нейтрофилов. Повышенная активность пути LXR-RXR была связана с лучшей выживаемостью.
У пациентов с плевральной инфекцией наблюдаются протеомные признаки, указывающие на разнообразные реакции нейтрофил-опосредованного иммунитета, гликолиза и активации пентозофосфата, которые связаны с микробиологией. Терапевтическое воздействие на путь LXR-XRX с помощью агонистов может улучшить выживаемость.
Тип исследования
Регистрация (Действительный)
Контакты и местонахождение
Места учебы
-
-
Oxfordshire
-
Oxford, Oxfordshire, Соединенное Королевство, OX3 7FZ
- Laboratory of Pleural Translational Research, Nuffield Department of Medicine, University of Oxford
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Взрослый
- Пожилой взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Метод выборки
Исследуемая популяция
Описание
Образцы, собранные для клинического исследования PILOT (DOI: 10.1183/13993003.00130-2020) использованный для исследования TORPIDS-2.
Пациенты были включены в исследование, если у них была клиническая картина, соответствующая плевральной инфекции и любому из следующих критериев: 1. макроскопически гнойная плевральная жидкость; или 2. плевральная жидкость, положительная при посеве на бактериальную инфекцию; или 3. плевральная жидкость, в которой при окрашивании по Граму были обнаружены бактерии; или 4. плевральная жидкость с pH ≤7,2 (измеряется с помощью анализатора газов крови) или низким уровнем глюкозы (≤3 ммоль·л-1 или ≤55 мг·дл-1) у пациента с клиническими признаками инфекции; или 5. компьютерная томография (КТ) с контрастным усилением, свидетельствующая о плевральной инфекции (консолидация подлежащего легкого с усилением плеврального скопления) у пациента с клиническими признаками инфекции, наряду с исключением других источников инфекции. Признаки инфекции оценивались врачом, набиравшим пациентов, на основании лихорадки, повышенного количества лейкоцитов в периферической крови или повышенных маркеров воспаления в сыворотке крови, таких как С-реактивный белок (СРБ). Критерии исключения из исследования были следующими: 1. возраст <18 лет; 2. плевральная жидкость для анализа отсутствует; 3. предшествующая пневмонэктомия на стороне плевральной инфекции; и 4. ожидаемая выживаемость <3 месяцев из-за сопутствующего заболевания по оценке врача, набравшего участие в отборе.
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
|---|
|
Регистрация
Все образцы были собраны при включении пациентов в исследование PILOT (PMID: 32675200, ISRCTN 50236700).
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Эндотипы плевральной инфекции
Временное ограничение: 12 месяцев
|
Открытие биологических эндотипов плевральной инфекции
|
12 месяцев
|
|
Связь между эндотипами и микробиологией
Временное ограничение: 12 месяцев
|
Изучить связь между эндотипами плевральной инфекции и микробиологией.
|
12 месяцев
|
|
Связь между эндотипами и годовой выживаемостью
Временное ограничение: 12 месяцев
|
Изучить связь между эндотипами плевральной инфекции и годовой выживаемостью.
|
12 месяцев
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Связь между эндотипами и необходимостью хирургического лечения
Временное ограничение: 12 месяцев
|
Изучить связь между эндотипами плевральной инфекции и необходимостью хирургического лечения.
|
12 месяцев
|
|
Связь между уровнями плазминогена в плевральной жидкости и эластазы нейтрофилов
Временное ограничение: 12 месяцев
|
Исследовать связь между уровнем плазминогена в плевральной жидкости и уровнем белка эластазы нейтрофилов.
|
12 месяцев
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Публикации и полезные ссылки
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Первичное завершение (Действительный)
Завершение исследования (Действительный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- R74885/RE001
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Описание плана IPD
Совместное использование IPD Поддерживающий тип информации
- STUDY_PROTOCOL
- МКФ
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .