Oxford Pleural Infection Endotyping Study (TORPIDS-2)

Pleurainfeksjon er en vanlig og alvorlig sykdom med økende forekomst over hele verden. Endotypene av pleurainfeksjon forblir ukjente. En bedre forståelse av pasientvariasjon i underliggende biologisk respons på infeksjon kan føre til forbedrede behandlinger og kliniske resultater. Vi designet en studie med sikte på å endotype sykdommen og vurdere sammenhengen mellom pasientens fenotype, mikrobiologi og klinisk utfall.

Vi utsatte 80 pleuravæskeprøver fra PILOT-studien, en prospektiv studie på pleurainfeksjon, for umerket massespektrometri. Proteiner ble beholdt hvis de ble påvist i minst 50 % av prøvene, noe som resulterte i totalt 449 proteiner. Uovervåket hierarkisk klynging og UMAP-analyser ble brukt til å klynge prøver, Spearman og eksakte Fischers metoder ble brukt for korrelasjonsvurdering og proteinuttrykk ble korrelert med kliniske utfall.

UMAP-plotting skilte prøvene inn i to forskjellige og distinkte kohorter. Baneanalyse av de differensielt uttrykte proteinene identifiserte nøytrofildegranulering, glykolyse, pentosefosfatveien og aktivering av lever og retinoid X-reseptorer (LXR-RXR). Høyere nøytrofil degranulering var assosiert med økt glykolyse og pentosefosfataktivering. Prøver dominert av Streptococcus Pneumoniae viste høy nøytrofil degranulering. Økt aktivitet av LXR-RXR-veien var assosiert med bedre overlevelse.

Pleurale infeksjonspasienter viser proteomiske signaturer som indikerer forskjellige responser av nøytrofilmediert immunitet, glykolyse og pentosefosfataktivering som var assosiert med mikrobiologi. Terapeutisk målretting av LXR-XRX-banen med agonister kan forbedre overlevelsen.