Oxfordin keuhkopussin infektion endotyyppitutkimus (TORPIDS-2)
Keuhkopussin tulehdusta sairastavien potilaiden keuhkopussin nesteproteomiikka osoittaa erilaisia neutrofiilisiä vasteita: Oxfordin keuhkopussin infektion endotyyppitutkimus (TORPIDS 2)
Keuhkopussin infektio on vakava sairaus, jonka ilmaantuvuus lisääntyy maailmanlaajuisesti. Keuhkopussin infektion alafenotyypit ovat edelleen tuntemattomia. Suunnittelimme tutkimuksen endotyypisimme taudin ja arvioimme potilaan fenotyypin, mikrobiologian ja kliinisen lopputuloksen välistä yhteyttä.
Teimme 80 keuhkopussin nestenäytettä merkitsemättömälle massaspektrometrialle.
Erilaisesti ilmentyneiden proteiinien reittianalyysi identifioi neutrofiilien degranulaation, glykolyysin, pentoosifosfaattireitin ja maksan ja retinoidi-X-reseptorien (LXR-RXR) aktivoitumisen. Suurempi neutrofiilien degranulaatio liittyi lisääntyneeseen glykolyysiin ja pentoosifosfaatin aktivaatioon.
Keuhkopussin infektiopotilailla on proteomisia allekirjoituksia, jotka osoittavat neutrofiilien välittämän immuniteetin, glykolyysin ja pentoosifosfaattiaktivaation erilaisia vasteita.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Keuhkopussin infektio on yleinen ja vakava sairaus, jonka ilmaantuvuus lisääntyy maailmanlaajuisesti. Keuhkopussin infektion endotyypit ovat edelleen tuntemattomia. Parempi ymmärrys potilaan vaihteluista taustalla olevan biologisen vasteen infektiolle voi johtaa parempiin hoitoihin ja kliinisiin tuloksiin. Suunnittelimme tutkimuksen, jonka tavoitteena on endotyypittää sairaus ja arvioida potilaan fenotyypin, mikrobiologian ja kliinisen lopputuloksen välistä yhteyttä.
Teimme 80 keuhkopussin nestenäytettä PILOT-tutkimuksesta, joka on prospektiivinen tutkimus keuhkopussin infektiosta, leimaamattomaan massaspektrometriaan. Proteiinit säilytettiin, jos niitä havaittiin vähintään 50 %:ssa näytteistä, jolloin saatiin yhteensä 449 proteiinia. Näytteiden ryhmittelyyn käytettiin valvomatonta hierarkkista klusterointia ja UMAP-analyysejä, korrelaation arvioinnissa Spearmanin ja tarkkaa Fischerin menetelmiä ja proteiinien ilmentyminen korreloi kliinisten tulosten kanssa.
UMAP-kaavio jakoi näytteet kahteen eri kohorttiin. Erilaisesti ilmentyneiden proteiinien reittianalyysi tunnisti neutrofiilien degranulaation, glykolyysin, pentoosifosfaattireitin ja maksan ja retinoidi-X-reseptorien (LXR-RXR) aktivoitumisen. Suurempi neutrofiilien degranulaatio liittyi lisääntyneeseen glykolyysiin ja pentoosifosfaatin aktivaatioon. Streptococcus Pneumoniaen hallitsemilla näytteillä oli korkea neutrofiilien degranulaatio. LXR-RXR-reitin lisääntynyt aktiivisuus liittyi parempaan eloonjäämiseen.
Keuhkopussin infektiopotilailla on proteomisia allekirjoituksia, jotka osoittavat neutrofiilien välittämän immuniteetin, glykolyysin ja pentoosifosfaattiaktivaation erilaisia vasteita, jotka liittyvät mikrobiologiaan. LXR-XRX-reitin terapeuttinen kohdistaminen agonisteilla voi parantaa eloonjäämistä.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
Oxfordshire
-
Oxford, Oxfordshire, Yhdistynyt kuningaskunta, OX3 7FZ
- Laboratory of Pleural Translational Research, Nuffield Department of Medicine, University of Oxford
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Kliinistä PILOT-tutkimusta varten kerätyt näytteet (DOI: 10.1183/13993003.00130-2020) käytetään TORPIDS-2-tutkimuksessa.
Potilaat otettiin mukaan, jos heillä oli keuhkopussin infektion mukainen kliininen esitys ja jokin seuraavista kriteereistä: 1. keuhkopussin neste, joka oli makroskooppisesti märkivää; tai 2. keuhkopussin neste, joka oli positiivinen bakteeri-infektion viljelmässä; tai 3. keuhkopussin neste, joka osoitti bakteereja Gram-värjäyksessä; tai 4. keuhkopussin neste, jonka pH on ≤ 7,2 (mitattu verikaasuanalysaattorilla) tai matala glukoositaso (≤3 mmol·L-1 tai ≤55 mg·dL-1) potilaalla, jolla on kliinisiä merkkejä infektiosta; tai 5. Varjoaineella vahvistetun tietokonetomografian (CT) näyttö keuhkopussin infektiosta (keuhkon taustalla olevan keuhkon yhdistäminen lisääntyneen keuhkopussin kerääntymisen kanssa) potilaalla, jolla on kliinisiä merkkejä infektiosta, sekä muiden infektiolähteiden poissulkeminen. Rekrytoiva lääkäri arvioi infektion todisteet kuumeen, kohonneen ääreisveren valkosolumäärän tai kohonneiden seerumin tulehdusmerkkiaineiden, kuten C-reaktiivisen proteiinin (CRP) perusteella. Tutkimuksen poissulkemiskriteerit olivat seuraavat: 1. ikä <18 vuotta; 2. keuhkopussin nestettä ei ole saatavilla analysoitavaksi; 3. aiempi pneumonectomia keuhkopussin infektion puolelta; ja 4. <3 kuukauden odotettu eloonjäämisaika rinnakkaissairauden vuoksi, palvelukseen ottavan lääkärin arvioiden mukaan.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
|---|
|
Ilmoittautuminen
Kaikki näytteet kerättiin potilaiden ilmoittautumisen yhteydessä PILOT-tutkimukseen (PMID: 32675200, ISRCTN 50236700)
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Keuhkopussin infektion endotyypit
Aikaikkuna: 12 kuukautta
|
Keuhkopussin infektion biologisten endotyyppien löytäminen
|
12 kuukautta
|
|
Endotyyppien ja mikrobiologian välinen yhteys
Aikaikkuna: 12 kuukautta
|
Tutki keuhkopussin infektioiden endotyyppien ja mikrobiologian välistä yhteyttä
|
12 kuukautta
|
|
Endotyyppien ja yhden vuoden eloonjäämisen välinen yhteys
Aikaikkuna: 12 kuukautta
|
Tutki keuhkopussin infektioiden endotyyppien ja yhden vuoden eloonjäämisen välistä yhteyttä
|
12 kuukautta
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Endotyyppien ja kirurgisen hoidon tarpeen välinen yhteys
Aikaikkuna: 12 kuukautta
|
Tutki keuhkopussin infektioiden endotyyppien ja kirurgisen hoidon tarpeen välistä yhteyttä
|
12 kuukautta
|
|
Yhteys keuhkopussin nesteen plasminogeenin ja neutrofiilien elastaasin välillä
Aikaikkuna: 12 kuukautta
|
Tutki keuhkopussin nesteen plasminogeenin ja neutrofiilien elastaasiproteiinitasojen välistä yhteyttä
|
12 kuukautta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- R74885/RE001
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
IPD-suunnitelman kuvaus
IPD-jakamista tukeva tietotyyppi
- STUDY_PROTOCOL
- ICF
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .