Oxford Pleural Infection Endotyping Study (TORPIDS-2)
Pleuralvätskeproteomik från patienter med pleural infektion visar signaturer av olika neutrofila svar: Oxford Pleural Infection Endotyping Study (TORPIDS 2)
Pleural infektion är en allvarlig sjukdom med ökande förekomst över hela världen. Subfenotyperna av pleural infektion förblir okända. Vi utformade en studie för att endotypa sjukdomen och bedöma sambandet mellan patientens fenotyp, mikrobiologi och kliniskt resultat.
Vi utsatte 80 pleuravätskeprover för omärkt masspektrometri.
Väganalys av de differentiellt uttryckta proteinerna identifierade neutrofildegranuleringen, glykolysen, pentosfosfatvägen och aktiveringen av levern och retinoid X-receptorer (LXR-RXR). Högre neutrofildegranulering var associerad med ökad glykolys och pentosfosfataktivering.
Pleurala infektionspatienter uppvisar proteomiska signaturer som indikerar olika svar av neutrofilmedierad immunitet, glykolys och pentosfosfataktivering.
Studieöversikt
Status
Detaljerad beskrivning
Pleural infektion är en vanlig och allvarlig sjukdom med ökande förekomst över hela världen. Endotyperna av pleural infektion förblir okända. En bättre förståelse för patienternas variation i det underliggande biologiska svaret på infektion kan leda till förbättrade behandlingar och kliniska resultat. Vi designade en studie med syftet att endotypa sjukdomen och bedöma sambandet mellan patientens fenotyp, mikrobiologi och kliniskt utfall.
Vi utsatte 80 pleuravätskeprov från PILOT-studien, en prospektiv studie på pleural infektion, för omärkt masspektrometri. Proteiner behölls om de upptäcktes i minst 50 % av proverna, vilket resulterade i totalt 449 proteiner. Oövervakad hierarkisk klustring och UMAP-analyser användes för att klustera prover, Spearman och exakta Fischers metoder användes för korrelationsbedömning och proteinuttryck korrelerades med kliniska resultat.
UMAP-plotting separerade proverna i två olika och distinkta kohorter. Väganalys av de differentiellt uttryckta proteinerna identifierade neutrofildegranulering, glykolys, pentosfosfatvägen och aktivering av lever och retinoid X-receptorer (LXR-RXR). Högre neutrofildegranulering var associerad med ökad glykolys och pentosfosfataktivering. Prover dominerade av Streptococcus Pneumoniae uppvisade hög neutrofil degranulering. Ökad aktivitet av LXR-RXR-vägen var associerad med bättre överlevnad.
Pleurala infektionspatienter uppvisar proteomiska signaturer som indikerar olika svar av neutrofilmedierad immunitet, glykolys och pentosfosfataktivering som var associerade med mikrobiologi. Terapeutisk inriktning på LXR-XRX-vägen med agonister kan förbättra överlevnaden.
Studietyp
Inskrivning (Faktisk)
Kontakter och platser
Studieorter
-
-
Oxfordshire
-
Oxford, Oxfordshire, Storbritannien, OX3 7FZ
- Laboratory of Pleural Translational Research, Nuffield Department of Medicine, University of Oxford
-
-
Deltagandekriterier
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
- Vuxen
- Äldre vuxen
Tar emot friska volontärer
Testmetod
Studera befolkning
Beskrivning
Prover insamlade för den kliniska PILOT-prövningen (DOI: 10.1183/13993003.00130-2020) används för TORPIDS-2-studien.
Patienter inkluderades om de hade en klinisk presentation som överensstämde med pleural infektion och något av följande kriterier: 1. pleuravätska som var makroskopiskt purulent; eller 2. pleuravätska som var positiv på odling för bakteriell infektion; eller 3. pleuravätska som visade bakterier på Gram-färgning; eller 4. Pleuralvätska med pH ≤7,2 (mätt med blodgasanalysator) eller låg glukosnivå (≤3 mmol·L-1 eller ≤55 mg·dL-1) hos en patient med kliniska tecken på infektion. eller 5. kontrastförstärkt datortomografi (CT) tecken på pleural infektion (konsolidering av underliggande lunga med ökad pleural samling) hos en patient med kliniska tecken på infektion, tillsammans med uteslutning av andra infektionskällor. Bevis på infektion bedömdes av den rekryterande läkaren på basis av feber, ett förhöjt antal vita blodkroppar i perifert blod eller förhöjda seruminflammatoriska markörer såsom C-reaktivt protein (CRP). Studiens uteslutningskriterier var följande: 1. ålder <18 år; 2. ingen pleuravätska tillgänglig för analys; 3. tidigare pneumonektomi på sidan av pleurainfektion; och 4. förväntad överlevnad på <3 månader på grund av samtidig sjukdom, enligt bedömning av den rekryterande läkaren.
Studieplan
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
|---|
|
Inskrivning
Alla prover samlades in vid patientregistrering för PILOT-studien (PMID: 32675200, ISRCTN 50236700)
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Endotyper av pleurainfektion
Tidsram: 12 månader
|
Upptäckt av biologiska endotyper av pleurainfektion
|
12 månader
|
|
Samband mellan endotyper och mikrobiologi
Tidsram: 12 månader
|
Undersöka sambandet mellan endotyper av pleurainfektion och mikrobiologi
|
12 månader
|
|
Samband mellan endotyper och ettårsöverlevnad
Tidsram: 12 månader
|
Undersök sambandet mellan endotyper av pleurainfektion och ettårsöverlevnad
|
12 månader
|
Sekundära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Samband mellan endotyper och behov av kirurgisk behandling
Tidsram: 12 månader
|
Undersök sambandet mellan endotyper av pleurainfektion och behov av kirurgisk behandling
|
12 månader
|
|
Samband mellan nivåer av pleuralvätska plasminogen och neutrofil elastas
Tidsram: 12 månader
|
Undersök sambandet mellan plasminogen och neutrofila elastasproteinnivåer i pleuravätskan
|
12 månader
|
Samarbetspartners och utredare
Sponsor
Publikationer och användbara länkar
Studieavstämningsdatum
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
Primärt slutförande (Faktisk)
Avslutad studie (Faktisk)
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Första postat (Faktisk)
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senast verifierad
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Nyckelord
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- R74885/RE001
Plan för individuella deltagardata (IPD)
Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?
IPD-planbeskrivning
IPD-delning som stöder informationstyp
- STUDY_PROTOCOL
- ICF
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .