白血球単一細胞型遺伝子発現/転写産物の存在量、直接LS-TAの直接分析による感染に対する宿主反応。前向き研究では、トリアージ熱性患者における直接LS-TAの感染の主要なカテゴリーへのパフォーマンスを評価します:ウイルス、細菌、または活性の結核。
熱性患者のトリアージのためのインターフェロン刺激およびその他のバイオマーカー遺伝子の末梢血単一細胞型発現プロファイル
熱性疾患は一般的な状態であり、適切な治療を可能にするために、さまざまな病因に従って患者の初期のトリアージを持つことが重要です。 現在、ほとんどのスクリーニング/診断テストは病原体の検出を対象としていますが、宿主の反応を理解することを目指しているのは少数のアッセイのみであり、主に血清タンパク質の測定に基づいています(例: CRPまたはProcalcitonin)。
最近、細菌とウイルスの感染を区別するために輸血が調査されました。 ただし、血液中の遺伝子発現は、サンプルに存在するすべての成分細胞型の遺伝子発現の複合スコアを表します。 ここでは、細菌、ウイルス、および結核と呼ばれるアッセイと呼ばれるアッセイと呼ばれるアッセイと呼ばれるアッセイ(ta)と呼ばれるアッセイの3つの主要なカテゴリの感染症の3つの主要なカテゴリのバイオマーカーとして、末梢血(例えば、単球または顆粒球)の特定の単一細胞タイプの遺伝子発現を決定できる迅速なテストを開発することを提案します。 LS-TA)は、末梢血サンプルにおける他のさまざまな白血球集団の間で指定された単一細胞型の遺伝子発現を直接決定できるからです。 このような結果は、3つ以上の軸(I型またはII型インターフェロンシグナル伝達応答または炎症誘発性サイトカインシグナル伝達)に従って宿主応答の性質を表し、基礎となる感染の種類(ウイルス、細菌、または活性の結核)を示すために使用できます。
調査の概要
状態
介入・治療
詳細な説明
直接LS-TAは、一般的に利用可能な機器で実行できる血液遺伝子発現分析の比率ベースのバイオマーカー(RBB)です(例: QPCRまたはデジタルPCRマシン)。 以前の定義された分子遺伝子と分母遺伝子のTAの比を使用して、このRBBは、特定の構成単一細胞型の遺伝子発現を定量化できます(例: 全血の細胞混合サンプル内の単球と顆粒球)。 直接LS-TAは、PI [Tang 2017、https://patents.google.com/patent/us95890999b2/]によって開拓された方法でした。 また、ワクチン接種後の初期B細胞応答の定量化のために開発されました[doi:10.3390/genes12070971]。最近、この方法は、感染後に宿主反応バイオマーカーを開発して、病原体の種類(ウイルス、細菌、活性の結核など)を区別するために使用されます。 分子および分母遺伝子は、単球および顆粒球のパブリック遺伝子発現データセットを使用することにより同定されています。 診断パフォーマンスは、これらのパブリックデータを使用して良かったです。 したがって、これらのRBBは前向き研究に適用され、熱性患者の診断(トリアージ)パフォーマンスを異なる病原体の病因に評価して比較します。
単一の細胞型遺伝子発現データを取得する他の方法と比較すると、直接LS-TAには、従来の(ゴールドスタンダード)アプローチには多くの利点があります。 最近のシングルセルRNAシーケンスは、サンプル内のすべての個々の細胞に遺伝子発現データを提供することもできますが、遅く、非常にコストがかかります。 Direct LS-TAは、標的細胞型を分離する必要なく、血液サンプルの単一細胞型遺伝子発現を定量化するユニークな手法を提供します。 発熱患者の宿主応答のタイプを3つの主要軸(I II型またはII型インターフェロンシグナル伝達応答または炎症誘発性サイトカインシグナル伝達)に区別するために使用されています。これは、基礎となる感染症の病因(ウイルス感染、活動性結核、細菌感染)の性質に対応しています。
Preprint doi:10.1101/2025.01.27.634977を参照してください。 B細胞の特許:https://patents.google.com/patent/wo2022089426a1/ 単球:https://patents.google.com/patent/wo2023109365a1/ 顆粒球:https://patents.google.com/patent/gb202400180d0/
研究の種類
入学 (推定)
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前:Tang
- 電話番号:852 35053330
- メール:nelsontang@cuhk.edu.hk
研究場所
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Hong Kong、香港
- Dept of Chemical Pathology, Chinese University of Hong Kong
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コンタクト:
- Tang
- 電話番号:852 35053330
- メール:nelsontang@cuhk.edu.hk
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- 急性発症の発熱の成人患者は、体温の上昇によって定義されます。
- 患者は、インフォームドコンセントを与えるために中国語の言葉を理解する必要があります。
除外基準:
- 免疫不全または免疫不全の状態の病歴を持つ患者。 患者はステリオドまたはその他の免疫療法を受けました。
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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細菌感染グループ
後に陽性の培養結果による細菌感染による発熱があることを確認した成人患者の前向きサンプル。
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患者は、この観察研究で特別な介入なしで臨床治療を受けます。
患者の治療の期間に違いはありません。
入院後早期に追加の血液サンプリングが1つだけ含まれます。
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ウイルス感染グループ
陽性病原体診断結果によるウイルス感染による発熱を後に確認した成人患者の前向きサンプル。
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患者は、この観察研究で特別な介入なしで臨床治療を受けます。
患者の治療の期間に違いはありません。
入院後早期に追加の血液サンプリングが1つだけ含まれます。
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活性結核群
後に臨床診断および/または陽性病原体の結果による活動性結核のために発熱があることを確認した成人患者の前向きサンプル。
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患者は、この観察研究で特別な介入なしで臨床治療を受けます。
患者の治療の期間に違いはありません。
入院後早期に追加の血液サンプリングが1つだけ含まれます。
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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単球のウイルス宿主応答直接LS-TA(I型インターフェロン応答)
時間枠:入院後最初の1週間以内に最初に収集されました
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Direct LS-TAは、RBB分子遺伝子とRBB分母遺伝子のQPCRまたはDPCRによって容易に定量化できるRBBの一種です。 バイオマーカーは2つの遺伝子の比です。 単一細胞タイプ:単球。 RBB分子遺伝子:IFI27またはIFI44L。 RBB分母遺伝子:PSAP、CTSSまたはCPVL。 さまざまなRBB(例 IFI27/PSAPおよびIFI44L/PSAP比)は、感染群からのサンプルの診断パフォーマンスの感度/特異性の観点から比較されます。 ROC分析のAUCは、必要に応じて実行されます。 |
入院後最初の1週間以内に最初に収集されました
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ウイルス宿主応答顆粒球におけるダイレクトLS-TA(I型インターフェロン応答)
時間枠:入院後最初の1週間以内に最初に収集されました
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Direct LS-TAは、RBB分子遺伝子とRBB分母遺伝子のQPCRまたはDPCRによって容易に定量化できるRBBの一種です。 バイオマーカーは2つの遺伝子の比です。 単一細胞タイプ:顆粒球。 RBB分子遺伝子:RSAD2またはIFIT1。 RBB分母遺伝子:SAT1またはSRGN。 さまざまなRBBは、感染群における診断パフォーマンスの感度/特異性の観点から比較されます。 ROC分析のAUCは、必要に応じて実行されます。 |
入院後最初の1週間以内に最初に収集されました
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細菌感染宿主応答単球における直接LS-TA(炎症誘発反応)
時間枠:入院後最初の1週間以内に最初に収集されました
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Direct LS-TAは、RBB分子遺伝子とRBB分母遺伝子のペアのQPCRまたはデジタルPCR(DPCR)によって容易に定量化できる一種のRBBです。
バイオマーカーは2つの遺伝子の比です。
単一細胞タイプ:単球。
RBB分子遺伝子:VNN1またはNLRC4。
RBB分母遺伝子:PSAP、CTSSまたはCPVL。
さまざまなRBBは、感染群における診断パフォーマンスの感度/特異性の観点から比較されます。
ROC分析のAUCは、必要に応じて実行されます。
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入院後最初の1週間以内に最初に収集されました
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細菌感染宿主応答顆粒球における直接LS-TA(炎症誘発反応)
時間枠:入院後最初の1週間以内に最初に収集されました
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Direct LS-TAは、RBB分子遺伝子とRBB分母遺伝子のQPCRまたはDPCRによって容易に定量化できるRBBの一種です。 バイオマーカーは2つの遺伝子の比です。 単一細胞タイプ:顆粒球。 RBB分子遺伝子:ALPL、ANXA3またはARG1。 RBB分母遺伝子:SAT1またはSRGN。 さまざまなRBBは、感染群における診断パフォーマンスの感度/特異性の観点から比較されます。 ROC分析のAUCは、必要に応じて実行されます。 |
入院後最初の1週間以内に最初に収集されました
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単球におけるアクティブTB宿主応答直接LS-TA(タイプIIインターフェロン応答)
時間枠:入院後最初の1週間以内に最初に収集されました
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Direct LS-TAは、RBB分子遺伝子とRBB分母遺伝子のQPCRまたはDPCRによって容易に定量化できるRBBの一種です。 バイオマーカーは2つの遺伝子の比です。 単一細胞タイプ:単球。 RBB分子遺伝子:WARS1、ATF3またはCALHM6。 RBB分母遺伝子:PSAP、CTSSまたはCPVL。 さまざまなRBBは、感染群における診断パフォーマンスの感度/特異性の観点から比較されます。 ROC分析のAUCは、必要に応じて実行されます。 |
入院後最初の1週間以内に最初に収集されました
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顆粒球におけるアクティブTB宿主応答直接LS-TA(タイプIIインターフェロン応答)
時間枠:入院後最初の1週間以内に最初に収集されました
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Direct LS-TAは、RBB分子遺伝子とRBB分母遺伝子のQPCRまたはDPCRによって容易に定量化できるRBBの一種です。 バイオマーカーは2つの遺伝子の比です。 単一細胞タイプ:顆粒球。 RBB分子遺伝子:ANKRD22、BATF2、CD274、FCGR1AまたはETV7。 RBB分母遺伝子:SAT1またはSRGN。 さまざまなRBBは、感染群における診断パフォーマンスの感度/特異性の観点から比較されます。 ROC分析のAUCは、必要に応じて実行されます。 |
入院後最初の1週間以内に最初に収集されました
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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直接LS-TA結果分布と感染群におけるこれらの直接LS-TA RBBの中央値
時間枠:入院後最初の1週間以内に最初に収集されました
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バイオマーカーの統計的分布とコントロール範囲との統計的比較または対照群の中央値との比較。
結果は、統計テストのp値として報告されます。
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入院後最初の1週間以内に最初に収集されました
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定量的PCRとデジタルPCRのパフォーマンスを比較する方法評価
時間枠:入院後最初の1週間以内に最初に収集されました
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両方のTA定量化方法のアッセイ性能と精度を評価します:定量的PCRとデジタルPCR。 定量的PCRの結果は、Delta-Delta CT値として報告されます。 デジタルPCRの結果は、2カウントの比率として報告されます。 そして、デルタ・デルタCT値との比較のために、コントロール制御(MOM)の平均/中央値の倍数に変換されました。 |
入院後最初の1週間以内に最初に収集されました
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協力者と研究者
出版物と役立つリンク
一般刊行物
- Huang D, Liu AYN, Leung KS, Tang NLS. Direct Measurement of B Lymphocyte Gene Expression Biomarkers in Peripheral Blood Transcriptomics Enables Early Prediction of Vaccine Seroconversion. Genes (Basel). 2021 Jun 25;12(7):971. doi: 10.3390/genes12070971.
- Huang B, Huang J, Chiang NH, Chen Z, Lui G, Ling L, Kwan MYW, Wong JSC, Mak PQ, Ling JWH, Lam ICS, Ng RWY, Wang X, Gao R, Hui DS, Ma SL, Chan PKS, Tang NLS. Interferon response and profiling of interferon response genes in peripheral blood of vaccine-naive COVID-19 patients. Front Immunol. 2024 Jan 10;14:1315602. doi: 10.3389/fimmu.2023.1315602. eCollection 2023.
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (推定)
一次修了 (推定)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
キーワード
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- Direct LS-TA prospective study
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
IPD プランの説明
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
米国で製造され、米国から輸出された製品。
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。