Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Hostrespons op infectie door directe analyse van leukocyten single celtype genexpressie/transcript-abundantie, directe ls-ta. Een prospectieve studie zal de prestaties van directe LS-TA bij triage-febriele patiënten evalueren in belangrijke categorieën infecties: virale, bacteriële of actieve tuberculose.

27 februari 2025 bijgewerkt door: Nelson Tang, Chinese University of Hong Kong

Perifeer bloed met één cel-type expressieprofiel van interferon-gestimuleerde en andere biomarkergenen voor triage van febriele patiënten

Febriele ziekte is een veel voorkomende aandoening en het is cruciaal om een ​​vroege triage van patiënten te hebben volgens verschillende etiologieën om een ​​passende behandeling mogelijk te maken. Momenteel zijn de meeste screening/diagnostische tests gericht op de detectie van pathogenen, terwijl slechts enkele testen de respons van de gastheer bedragen, en ze zijn meestal gebaseerd op een meting van serumeiwitten (b.v. CRP of procalcitonine).

Onlangs is bloedtranscriptoom onderzocht om bacteriële en virale infecties te onderscheiden. Genexpressie in bloed vertegenwoordigt echter een samengestelde score van genexpressie van alle componentceltypen aanwezig in het monster. Hier stellen we voor om een ​​snelle test te ontwikkelen die genuitdrukkingen van een gespecificeerd enkel celtype in perifeer bloed (bijvoorbeeld monocyten of granulocyten) kan bepalen als een gastheerrespons Biomarker om drie belangrijke categorieën infecties te differentiëren die bacterieel, viral en tuberculosis kunnen worden genoemd, is direct leuk Bepaal direct de genexpressie van een gespecificeerd enkelvoudige celtype bij verschillende andere leukocytenpopulaties rechtstreeks in een perifeer bloedmonster. Dergelijke resultaten duiden op de aard van de hostrespons volgens 3 of meer assen (type I of type II interferons signaleringsrespons of pro-inflammatoire cytokinesignalering) en het kan worden gebruikt om het type onderliggende infectie (virale, bacteriële of actieve tuberculose) aan te geven.

Studie Overzicht

Toestand

Nog niet aan het werven

Conditie

Interventie / Behandeling

Gedetailleerde beschrijving

Direct LS-TA is een op ratio gebaseerde biomarker (RBB) voor bloedgenexpressieanalyse die kan worden uitgevoerd in algemeen beschikbare apparatuur (b.v. qPCR of digitale PCR -machines). Met behulp van de verhouding van TA van eerder gedefinieerd teller gen en denominatorgen, kan deze RBB genexpressie van het gespecificeerde constitutionele enkelvoudige celtype kwantificeren (b.v. Monocyten en granulocyten) in een celmengselmonster van volbloed. Direct LS-TA was een methode die werd ontwikkeld door de PI [Tang 2017, https://patens.google.com/patent/us9589099b2/]. En het is ontwikkeld voor kwantificering van vroege B -celrespons na vaccinatie [DOI: 10.3390/genen12070971]. Onlangs wordt de methode gebruikt om biomarkers van gastheerrespons te ontwikkelen na infectie om het type pathogenen te onderscheiden (zoals virale, bacteriële of actieve tuberculose). Numerator- en noemergenen zijn geïdentificeerd met behulp van publieke genexpressiegegevenssets voor monocyten en granulocyten. Diagnostische prestaties waren goed met behulp van deze openbare gegevens. Daarom zullen deze RBB's worden toegepast in de prospectieve studie om hun diagnostische (triage) prestaties van febriele patiënten te evalueren en te vergelijken met verschillende pathogene etiologieën.

In vergelijking met andere methoden om genexpressiegegevens van het afzonderlijke celtype te verkrijgen, heeft directe LS-TA veel voordelen. De conventionele (gouden standaard) benadering is het kwantificeren van genexpressie in een monster van gezuiverd enkelceltype uit perifeer bloed, maar het is een zeer arbeidsintensieve procedure. Recente RNA-sequencing met één cel kan ook genexpressiegegevens bieden voor elke individuele cel in een monster, maar het is langzaam en zeer duur. Directe LS-TA biedt de unieke techniek om genexpressie van het type enkele celtype in bloedmonsters te kwantificeren zonder de noodzaak om het beoogde celtype te isoleren. Het is gebruikt om het type gastheerrespons bij koortspatiënten te differentiëren in 3 belangrijke assen (type I of type II interferons signaleringsrespons of pro-inflammatoire cytokinesignalering) die overeenkomen met de aard van onderliggende infectie-aetiologieën (virale infectie, actieve tuberculose en bacteriële infectie).

Zie preprint doi: 10.1101/2025.01.27.634977. en patenten in B -cellen: https://patens.google.com/patent/wo2022089426a1/ Monocytes: https://patens.google.com/patent/wo2023109365a1/ Granulocytes: https://patens.google.com/patent/gb202400180d0/

Studietype

Observationeel

Inschrijving (Geschat)

200

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studiecontact

Studie Locaties

  • Hongkong
      • Hong Kong, Hongkong
        • Dept of Chemical Pathology, Chinese University of Hong Kong
        • Contact:

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

  • Volwassen
  • Oudere volwassene

Accepteert gezonde vrijwilligers

Nee

Bemonsteringsmethode

Niet-waarschijnlijkheidssteekproef

Studie Bevolking

Patiënten met koorts als gevolg van infecties die later klinisch worden gediagnosticeerd als virale infectie, bacteriële infectie of actieve tuberculose.

Beschrijving

Inclusiecriteria:

  • Volwassen patiënten met koorts van acuut begin dat wordt gedefinieerd door een verhoogde lichaamstemperatuur.
  • Patiënt moet het Chinese woord begrijpen om geïnformeerde toestemming te geven.

Uitsluitingscriteria:

  • Patiënten met een geschiedenis van enige immunodeficiëntie of immuungecompromitteerde toestand. Patiënten ontvingen steriod of andere immunotherapie.

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

Cohorten en interventies

Groep / Cohort
Interventie / Behandeling
Bacteriële infectiegroep
Een prospectieve steekproef van volwassen patiënten die later bevestigden koorts te hebben als gevolg van bacteriële infectie door positieve kweekresultaten.
Ander: Geen interventie
Patiënten krijgen een klinische behandeling zonder speciale interventie in dit observationele onderzoek. Er is geen verschil in de behandeling van de behandeling van patiënten. Het omvat slechts één extra bloedbemonstering vroeg na toelating.
Virale infectiegroep
Een prospectieve steekproef van volwassen patiënten die later bevestigden koorts te hebben als gevolg van virale infectie door positieve pathogeen diagnostische resultaten.
Ander: Geen interventie
Patiënten krijgen een klinische behandeling zonder speciale interventie in dit observationele onderzoek. Er is geen verschil in de behandeling van de behandeling van patiënten. Het omvat slechts één extra bloedbemonstering vroeg na toelating.
Actieve tuberculosegroep
Een prospectieve steekproef van volwassen patiënten die later bevestigden koorts te hebben als gevolg van actieve tuberculose door klinische diagnose en/of positieve pathogeenresultaten.
Ander: Geen interventie
Patiënten krijgen een klinische behandeling zonder speciale interventie in dit observationele onderzoek. Er is geen verschil in de behandeling van de behandeling van patiënten. Het omvat slechts één extra bloedbemonstering vroeg na toelating.

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Virale gastheerrespons Direct LS-TA in monocyten (Type I Interferon-reactie)
Tijdsspanne: Eerste verzamelde monster binnen de eerste week na de toelating

Direct LS-TA is een soort RBB die gemakkelijk kan worden gekwantificeerd door qPCR of DPCR van een paar genen, het RBB-tellergen en het RBB-noemergengen. De biomarker is de verhouding van de 2 genen. Single Cell-Type: monocyt. RBB -teller gen: ifi27 of ifi44L. RBB Denominator Gene: PSAP, CTSS of CPVL.

De verschillende RBB (bijv. IFI27/PSAP en IFI44L/PSAP -verhoudingen) worden vergeleken in termen van hun gevoeligheid/specificiteit van diagnostische prestaties in de monsters van infectiegroepen. AUC van ROC -analyse zal waar nodig worden uitgevoerd.
Eerste verzamelde monster binnen de eerste week na de toelating
Virale gastheerrespons Direct LS-TA in granulocyten (type I interferon-reactie)
Tijdsspanne: Eerste verzamelde monster binnen de eerste week na de toelating

Direct LS-TA is een soort RBB die gemakkelijk kan worden gekwantificeerd door qPCR of DPCR van een paar genen, het RBB-tellergen en het RBB-noemergengen. De biomarker is de verhouding van de 2 genen. Single Cell-Type: Granulocyt. RBB -teller gen: RSAD2 of Ifit1.

RBB Denominator Gene: SAT1 of SRGN. De verschillende RBB zal worden vergeleken in termen van hun gevoeligheid/specificiteit van diagnostische prestaties in de infectiegroepen. AUC van ROC -analyse zal waar nodig worden uitgevoerd.
Eerste verzamelde monster binnen de eerste week na de toelating
Bacteriële infectie Host Response Direct LS-TA in monocyten (pro-inflammatoire reactie)
Tijdsspanne: Eerste verzamelde monster binnen de eerste week na de toelating
Directe LS-TA is een soort RBB die gemakkelijk kan worden gekwantificeerd door qPCR of digitale PCR (DPCR) van een paar genen, het RBB-tellergen en het RBB-noemergen. De biomarker is de verhouding van de 2 genen. Single Cell-Type: monocyt. RBB -teller gen: VNN1 of NLRC4. RBB Denominator Gene: PSAP, CTSS of CPVL. De verschillende RBB's zullen worden vergeleken in termen van hun gevoeligheid/specificiteit van diagnostische prestaties in de infectiegroepen. AUC van ROC -analyse zal waar nodig worden uitgevoerd.
Eerste verzamelde monster binnen de eerste week na de toelating
Bacteriële infectie Hostrespons Direct LS-TA in granulocyten (pro-inflammatoire respons)
Tijdsspanne: Eerste verzamelde monster binnen de eerste week na de toelating

Direct LS-TA is een soort RBB die gemakkelijk kan worden gekwantificeerd door qPCR of DPCR van een paar genen, het RBB-tellergen en het RBB-noemergengen. De biomarker is de verhouding van de 2 genen. Single Cell-Type: Granulocyt. RBB -teller gen: ALPL, Anxa3 of Arg1.

RBB Denominator Gene: SAT1 of SRGN. De verschillende RBB zal worden vergeleken in termen van hun gevoeligheid/specificiteit van diagnostische prestaties in de infectiegroepen. AUC van ROC -analyse zal waar nodig worden uitgevoerd.
Eerste verzamelde monster binnen de eerste week na de toelating
Actieve TB-hostrespons Direct LS-TA in monocyten (type II interferonrespons)
Tijdsspanne: Eerste verzamelde monster binnen de eerste week na de toelating

Direct LS-TA is een soort RBB die gemakkelijk kan worden gekwantificeerd door qPCR of DPCR van een paar genen, het RBB-tellergen en het RBB-noemergengen. De biomarker is de verhouding van de 2 genen. Single Cell-Type: monocyt.

RBB -teller gen: Wars1, ATF3 of CALHM6. RBB Denominator Gene: PSAP, CTSS of CPVL. De verschillende RBB zal worden vergeleken in termen van hun gevoeligheid/specificiteit van diagnostische prestaties in infectiegroepen. AUC van ROC -analyse zal waar nodig worden uitgevoerd.
Eerste verzamelde monster binnen de eerste week na de toelating
Actieve TB-hostrespons Direct LS-TA in granulocyten (type II interferonrespons)
Tijdsspanne: Eerste verzamelde monster binnen de eerste week na de toelating

Direct LS-TA is een soort RBB die gemakkelijk kan worden gekwantificeerd door qPCR of DPCR van een paar genen, het RBB-tellergen en het RBB-noemergengen. De biomarker is de verhouding van de 2 genen. Single Cell-Type: Granulocyt. RBB -teller gen: ANKRD22, BATF2, CD274, FCGR1A of ETV7.

RBB Denominator Gene: SAT1 of SRGN. De verschillende RBB zal worden vergeleken in termen van hun gevoeligheid/specificiteit van diagnostische prestaties in infectiegroepen. AUC van ROC -analyse zal waar nodig worden uitgevoerd.
Eerste verzamelde monster binnen de eerste week na de toelating

Secundaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Directe LS-TA-resultatenverdeling en mediaan van deze directe LS-TA RBB in infectiegroepen
Tijdsspanne: Eerste verzamelde monster binnen de eerste week na de toelating
De statistische verdeling van de biomarker en statistische vergelijking met het controlebereik of vergelijking met mediaan voor controlegroep. De resultaten zullen worden gerapporteerd als p-waarden van de statistische tests.
Eerste verzamelde monster binnen de eerste week na de toelating
Methode -evaluatie om de prestaties van kwantitatieve PCR en digitale PCR te vergelijken
Tijdsspanne: Eerste verzamelde monster binnen de eerste week na de toelating

Evalueer de testprestaties en precisie van beide TA -kwantificatiemethoden: kwantitatieve PCR en digitale PCR.

Kwantitatieve PCR-resultaten zullen worden gerapporteerd als Delta-Delta CT-waarden. Digitale PCR -resultaten worden gerapporteerd als verhoudingen van 2 tellingen. En vervolgens omgezet in meerdere van gemiddelde/mediaan in de controlecontrole (MOM) voor vergelijking met Delta-Delta CT-waarden.
Eerste verzamelde monster binnen de eerste week na de toelating

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Sponsor

Chinese University of Hong Kong

Publicaties en nuttige links

De persoon die verantwoordelijk is voor het invoeren van informatie over het onderzoek stelt deze publicaties vrijwillig ter beschikking. Dit kan gaan over alles wat met het onderzoek te maken heeft.

Algemene publicaties

Nuttige links

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Geschat)

1 februari 2025

Primaire voltooiing (Geschat)

1 september 2028

Studie voltooiing (Geschat)

1 december 2028

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

18 februari 2025

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

20 februari 2025

Eerst geplaatst (Werkelijk)

25 maart 2025

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Werkelijk)

25 maart 2025

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

27 februari 2025

Laatst geverifieerd

1 februari 2025

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Trefwoorden

Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden

Andere studie-ID-nummers

  • Direct LS-TA prospective study

Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)

Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?

ONBESLIST

Beschrijving IPD-plan

Beschrijvende statistieken van resultaten worden op een redelijk verzoek verstrekt.

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

product vervaardigd in en geëxporteerd uit de V.S.

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

Abonneren