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Resposta do hospedeiro à infecção por análise direta da expressão/abundância de transcrição do tipo de célula única de leucócitos, LS-TA direto. Um estudo prospectivo avaliará o desempenho do LS-TA direto em pacientes com triagem febril em principais categorias de infecções: tuberculose viral, bacteriana ou ativa.

27 de fevereiro de 2025 atualizado por: Nelson Tang, Chinese University of Hong Kong

Perfil de expressão do tipo de célula única de sangue periférico de genes estimulados por interferon e outros genes de biomarcadores para a triagem de pacientes febris

A doença febril é uma condição comum e é crucial ter uma triagem precoce de pacientes de acordo com várias etiologias para permitir o tratamento apropriado. Atualmente, a maioria dos testes de triagem/diagnóstico tem como alvo a detecção de patógenos, enquanto apenas alguns ensaios visam entender a resposta do host e são baseados principalmente em uma medição de proteínas séricas (por exemplo, CRP ou procalcitonina).

Recentemente, o transcriptoma sanguíneo foi explorado para diferenciar infecções bacterianas e virais. No entanto, a expressão gênica no sangue representa uma pontuação composta da expressão gênica de todos os tipos de células componentes presentes na amostra. Here, we propose to develop a rapid test that can determine gene expressions of a specified single cell type in peripheral blood (e.g., monocytes or granulocytes) as a host response biomarker to differentiate three major categories of infections that are bacterial, viral, and tuberculosis The assay is called Direct Leukocyte Single cell-type transcript abundance (TA) assay (DIRECT LS-TA) as Ele pode determinar diretamente a expressão gênica de um tipo de célula única especificada entre várias outras populações de leucócitos diretamente em uma amostra de sangue periférico. Tais resultados significam a natureza da resposta do hospedeiro de acordo com 3 ou mais eixos (resposta de sinalização de interferon tipo I ou tipo II ou sinalização pró-inflamatória de citocinas) e pode ser usada para indicar o tipo de infecção subjacente (tuberculose viral, bacteriana ou ativa).

Visão geral do estudo

Descrição detalhada

O LS-TA direto é um biomarcador baseado em razão (RBB) para análise de expressão de genes sanguíneos que pode ser realizada em equipamentos comumente disponíveis (por exemplo, qPCR ou máquinas de PCR digital). Usando a razão de TA de gene numerador definido anterior e gene denominador, este RBB pode quantificar a expressão gênica do tipo de célula única constitucional especificada (por exemplo monócitos e granulócitos) dentro de uma amostra de mistura celular de sangue total. O LS-TA direto foi pioneiro no Pi [Tang 2017, https://patents.google.com/patent/us9589099b2/]. E foi desenvolvido para quantificação da resposta precoce das células B após a vacinação [doi: 10.3390/genes12070971]. Recentemente, o método é usado para desenvolver biomarcadores de resposta do hospedeiro após a infecção para diferenciar o tipo de patógenos (como tuberculose viral, bacteriana ou ativa). Os genes numeradores e denominadores foram identificados usando conjuntos de dados de expressão de genes públicos para monócitos e granulócitos. O desempenho diagnóstico foi bom usando esses dados públicos. Portanto, esses RBBs serão aplicados no estudo prospectivo para avaliar e comparar seu desempenho diagnóstico (triagem) de pacientes febris em diferentes etiologias de patógenos.

Comparando com outros métodos para obter dados de expressão do gene do tipo de célula única, o LS-TA direto tem muitas vantagens que a abordagem convencional (padrão-ouro) é quantificar a expressão gênica em uma amostra de tipo de célula única purificada do sangue periférico, mas é um procedimento intensivo muito trabalhista. O sequenciamento recente de RNA de célula única também pode fornecer dados de expressão gênica para cada célula individual em uma amostra, mas é lenta e muito cara. O LS-TA direto fornece a técnica exclusiva para quantificar a expressão do gene do tipo celular único em amostras de sangue sem a necessidade de isolar o tipo de célula alvo. Foi usado para diferenciar o tipo de resposta do hospedeiro em pacientes com febre em 3 eixos principais (resposta de sinalização de interferon tipo I ou tipo II ou sinalização pró-inflamatória de citocinas), que correspondem à natureza das etiologias de infecção subjacente (infecção viral, tuberculose ativa e infecção bacteriana).

Ver pré -impressão doi: 10.1101/2025.01.27.634977. e patentes nas células B: https://patents.google.com/patent/wo2022089426a1/ Monócitos: https://patents.google.com/patent/wo2023109365a1/ Granulócitos: https://patents.google.com/patent/gb202400180d0/

Tipo de estudo

Observacional

Inscrição (Estimado)

200

Contactos e Locais

Esta seção fornece os detalhes de contato para aqueles que conduzem o estudo e informações sobre onde este estudo está sendo realizado.

Contato de estudo

Locais de estudo

      • Hong Kong, Hong Kong
        • Dept of Chemical Pathology, Chinese University of Hong Kong
        • Contato:

Critérios de participação

Os pesquisadores procuram pessoas que se encaixem em uma determinada descrição, chamada de critérios de elegibilidade. Alguns exemplos desses critérios são a condição geral de saúde de uma pessoa ou tratamentos anteriores.

Critérios de elegibilidade

Idades elegíveis para estudo

  • Adulto
  • Adulto mais velho

Aceita Voluntários Saudáveis

Não

Método de amostragem

Amostra Não Probabilística

População do estudo

Pacientes com febre devido a infecções que são posteriormente diagnosticadas clinicamente como infecção viral, infecção bacteriana ou tuberculose ativa.

Descrição

Critérios de inclusão:

  • Pacientes adultos com febre de início agudo, que é definido por uma temperatura corporal elevada.
  • O paciente deve entender a palavra chinesa para dar consentimento informado.

Critérios de exclusão:

  • Pacientes com histórico de qualquer imunodeficiência ou condição imunocomprometida. Os pacientes receberam esteriod ou outra imunoterapia.

Plano de estudo

Esta seção fornece detalhes do plano de estudo, incluindo como o estudo é projetado e o que o estudo está medindo.

Como o estudo é projetado?

Detalhes do projeto

Coortes e Intervenções

Grupo / Coorte
Intervenção / Tratamento
Grupo de infecção bacteriana
Uma amostra prospectiva de pacientes adultos que mais tarde confirmaram ter febre devido à infecção bacteriana por resultados positivos da cultura.
Os pacientes receberão tratamento clínico sem intervenção especial neste estudo observacional. Não há diferença no termo de tratamento dos pacientes. Envolve apenas uma amostra de sangue adicional cedo após a admissão.
Grupo de infecção viral
Uma amostra prospectiva de pacientes adultos que mais tarde confirmaram ter febre devido à infecção viral por resultados positivos de diagnóstico de patógenos.
Os pacientes receberão tratamento clínico sem intervenção especial neste estudo observacional. Não há diferença no termo de tratamento dos pacientes. Envolve apenas uma amostra de sangue adicional cedo após a admissão.
Grupo de tuberculose ativa
Uma amostra prospectiva de pacientes adultos que mais tarde confirmaram ter febre devido à tuberculose ativa por diagnóstico clínico e/ou resultados positivos de patógenos.
Os pacientes receberão tratamento clínico sem intervenção especial neste estudo observacional. Não há diferença no termo de tratamento dos pacientes. Envolve apenas uma amostra de sangue adicional cedo após a admissão.

O que o estudo está medindo?

Medidas de resultados primários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Resposta do host viral LS-TA direto em monócitos (resposta do interferon tipo I)
Prazo: Primeira amostra coletada na primeira semana após a admissão

O LS-TA direto é um tipo de RBB que pode ser facilmente quantificado por qPCR ou DPCR de um par de genes, o gene do numerador RBB e o gene denominador RBB. O biomarcador é a proporção dos 2 genes. Tipo de célula única: monócito. Gene do numerador RBB: ifi27 ou ifi44l. Gene denominador RBB: PSAP, CTSS ou CPVL.

Os vários RBB (p. As taxas IFI27/PSAP e IFI44L/PSAP) serão comparadas em termos de sensibilidade/especificidade do desempenho diagnóstico nas amostras de grupos de infecção. A AUC da análise ROC será realizada quando apropriado.

Primeira amostra coletada na primeira semana após a admissão
Resposta do hospedeiro viral LS direto-ta em granulócitos (resposta do interferon tipo I)
Prazo: Primeira amostra coletada na primeira semana após a admissão

O LS-TA direto é um tipo de RBB que pode ser facilmente quantificado por qPCR ou DPCR de um par de genes, o gene do numerador RBB e o gene denominador RBB. O biomarcador é a proporção dos 2 genes. Tipo de célula única: granulócito. Gene do numerador RBB: rsad2 ou ifit1.

Gene denominador RBB: SAT1 ou SRGN. Os vários RBB serão comparados em termos de sensibilidade/especificidade do desempenho diagnóstico nos grupos de infecção. A AUC da análise ROC será realizada quando apropriado.

Primeira amostra coletada na primeira semana após a admissão
Resposta do hospedeiro de infecção bacteriana LS-TA direta em monócitos (resposta pró-inflamatória)
Prazo: Primeira amostra coletada na primeira semana após a admissão
O LS-TA direto é um tipo de RBB que pode ser facilmente quantificado por qPCR ou PCR digital (DPCR) de um par de genes, o gene do numerador RBB e o gene do denominador RBB. O biomarcador é a proporção dos 2 genes. Tipo de célula única: monócito. Gene do numerador RBB: VNN1 ou NLRC4. Gene denominador RBB: PSAP, CTSS ou CPVL. Os vários RBBs serão comparados em termos de sensibilidade/especificidade do desempenho diagnóstico nos grupos de infecção. A AUC da análise ROC será realizada quando apropriado.
Primeira amostra coletada na primeira semana após a admissão
Resposta do hospedeiro de infecção bacteriana LS direta LS em granulócitos (resposta pró-inflamatória)
Prazo: Primeira amostra coletada na primeira semana após a admissão

O LS-TA direto é um tipo de RBB que pode ser facilmente quantificado por qPCR ou DPCR de um par de genes, o gene do numerador RBB e o gene denominador RBB. O biomarcador é a proporção dos 2 genes. Tipo de célula única: granulócito. RBB Numerator Gene: ALPL, ANXA3 ou ARG1.

Gene denominador RBB: SAT1 ou SRGN. Os vários RBB serão comparados em termos de sensibilidade/especificidade do desempenho diagnóstico nos grupos de infecção. A AUC da análise ROC será realizada quando apropriado.

Primeira amostra coletada na primeira semana após a admissão
Resposta ativa do host TB LS-TA DIRETO em monócitos (resposta do interferon tipo II)
Prazo: Primeira amostra coletada na primeira semana após a admissão

O LS-TA direto é um tipo de RBB que pode ser facilmente quantificado por qPCR ou DPCR de um par de genes, o gene do numerador RBB e o gene denominador RBB. O biomarcador é a proporção dos 2 genes. Tipo de célula única: monócito.

RBB Numerator Gene: Wars1, ATF3 ou Calhm6. Gene denominador RBB: PSAP, CTSS ou CPVL. Os vários RBB serão comparados em termos de sensibilidade/especificidade do desempenho diagnóstico em grupos de infecção. A AUC da análise ROC será realizada quando apropriado.

Primeira amostra coletada na primeira semana após a admissão
Resposta ativa do host TB LS-TA DIRETO em granulócitos (resposta do interferon tipo II)
Prazo: Primeira amostra coletada na primeira semana após a admissão

O LS-TA direto é um tipo de RBB que pode ser facilmente quantificado por qPCR ou DPCR de um par de genes, o gene do numerador RBB e o gene denominador RBB. O biomarcador é a proporção dos 2 genes. Tipo de célula única: granulócito. Gene numerador RBB: ANKRD22, BATF2, CD274, FCGR1A ou ETV7.

Gene denominador RBB: SAT1 ou SRGN. Os vários RBB serão comparados em termos de sensibilidade/especificidade do desempenho diagnóstico em grupos de infecção. A AUC da análise ROC será realizada quando apropriado.

Primeira amostra coletada na primeira semana após a admissão

Medidas de resultados secundários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Direct LS-TA Resultados Distribuição e mediana desses LS-TA RBB diretos em grupos de infecção
Prazo: Primeira amostra coletada na primeira semana após a admissão
A distribuição estatística do biomarcador e comparação estatística com a faixa de controle ou comparação com a mediana do grupo de controle. Os resultados serão relatados como valores de P dos testes estatísticos.
Primeira amostra coletada na primeira semana após a admissão
Avaliação do método para comparar o desempenho da PCR quantitativa e PCR digital
Prazo: Primeira amostra coletada na primeira semana após a admissão

Avalie o desempenho do ensaio e a precisão dos dois métodos de quantificação de TA: PCR quantitativa e PCR digital.

Os resultados quantitativos de PCR serão relatados como valores de TC delta-delta. Os resultados da PCR digital serão relatados como proporções de 2 contagens. E depois convertido em múltiplos de média/mediana no controle de controle (MOM) para comparação com os valores de TC delta-delta.

Primeira amostra coletada na primeira semana após a admissão

Colaboradores e Investigadores

É aqui que você encontrará pessoas e organizações envolvidas com este estudo.

Publicações e links úteis

A pessoa responsável por inserir informações sobre o estudo fornece voluntariamente essas publicações. Estes podem ser sobre qualquer coisa relacionada ao estudo.

Datas de registro do estudo

Essas datas acompanham o progresso do registro do estudo e os envios de resumo dos resultados para ClinicalTrials.gov. Os registros do estudo e os resultados relatados são revisados ​​pela National Library of Medicine (NLM) para garantir que atendam aos padrões específicos de controle de qualidade antes de serem publicados no site público.

Datas Principais do Estudo

Início do estudo (Estimado)

1 de fevereiro de 2025

Conclusão Primária (Estimado)

1 de setembro de 2028

Conclusão do estudo (Estimado)

1 de dezembro de 2028

Datas de inscrição no estudo

Enviado pela primeira vez

18 de fevereiro de 2025

Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ

20 de fevereiro de 2025

Primeira postagem (Real)

25 de março de 2025

Atualizações de registro de estudo

Última Atualização Postada (Real)

25 de março de 2025

Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade

27 de fevereiro de 2025

Última verificação

1 de fevereiro de 2025

Mais Informações

Termos relacionados a este estudo

Plano para dados de participantes individuais (IPD)

Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?

INDECISO

Descrição do plano IPD

Estatísticas descritivas dos resultados serão fornecidas em uma solicitação razoável.

Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo

Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA

Não

produto fabricado e exportado dos EUA

Não

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