Reakce hostitele na infekci přímou analýzou leukocytové exprese genu s jedním buňkami/transkripčními hodnotami, přímý LS-TA. Prospektivní studie vyhodnotí výkon přímého LS-TA u třídění febrilních pacientů do hlavních kategorií infekcí: virové, bakteriální nebo aktivní tuberkulóza.

Bakteriální infekce

Prospektivní vzorek dospělých pacientů, kteří později potvrdili, že mají horečku kvůli bakteriální infekci pomocí výsledků pozitivní kultury.

Jiný: Žádný zásah

Pacienti budou dostávat klinickou léčbu bez zvláštního zásahu v této observační studii. Neexistuje žádný rozdíl v době léčby pacientů. Zahrnuje to pouze jeden další vzorkování krve brzy po přijetí.

Skupina virové infekce

Prospektivní vzorek dospělých pacientů, kteří později potvrdili, že mají horečku kvůli virové infekci pozitivními diagnostickými výsledky patogenu.

Jiný: Žádný zásah

Pacienti budou dostávat klinickou léčbu bez zvláštního zásahu v této observační studii. Neexistuje žádný rozdíl v době léčby pacientů. Zahrnuje to pouze jeden další vzorkování krve brzy po přijetí.

Aktivní skupina tuberkulózy

Prospektivní vzorek dospělých pacientů, kteří později potvrdili, že mají horečku v důsledku aktivní tuberkulózy pomocí klinické diagnózy a/nebo pozitivních výsledků patogenu.

Jiný: Žádný zásah

Pacienti budou dostávat klinickou léčbu bez zvláštního zásahu v této observační studii. Neexistuje žádný rozdíl v době léčby pacientů. Zahrnuje to pouze jeden další vzorkování krve brzy po přijetí.

Reakce virového hostitele přímá LS-TA v monocytech (odezva interferonu typu I)

Direct LS-TA je druh RBB, který lze snadno kvantifikovat pomocí qPCR nebo DPCR páru genů, genem čitatele RBB a genem jmenovatele RBB. Biomarker je poměr 2 genů. Typ jednotlivých buněk: monocyt. RBB GENE NUMERÁTOR: IFI27 nebo IFI44L. Gen jmenovatel RBB: PSAP, CTSS nebo CPVL.

Různé RBB (např. Poměry IFI27/PSAP a IFI44L/PSAP) budou porovnány z hlediska jejich citlivosti/specificity diagnostické výkonnosti ve vzorcích ze skupin infekce. V případě potřeby bude provedena AUC analýzy ROC.

Reakce virového hostitele Přímá LS-TA v granulocytech (odezva interferonu typu I)

Direct LS-TA je druh RBB, který lze snadno kvantifikovat pomocí qPCR nebo DPCR páru genů, genem čitatele RBB a genem jmenovatele RBB. Biomarker je poměr 2 genů. Typ jediného buňky: granulocyt. Gen numerátoru RBB: RSAD2 nebo IFIT1.

Gen jmenovatel RBB: SAT1 nebo SRGN. Různé RBB budou porovnány z hlediska jejich citlivosti/specificity diagnostické výkonnosti ve skupinách infekce. V případě potřeby bude provedena AUC analýzy ROC.

Bakteriální infekce hostitelská odpověď přímá LS-TA v monocytech (prozánětlivá odpověď)

Direct LS-TA je druh RBB, který lze snadno kvantifikovat pomocí qPCR nebo digitálního PCR (DPCR) páru genů, genem čitatele RBB a genem RBB jmenovatel. Biomarker je poměr 2 genů. Typ jednotlivých buněk: monocyt. Gen čitarátoru RBB: VNN1 nebo NLRC4. Gen jmenovatel RBB: PSAP, CTSS nebo CPVL. Různé RBB budou porovnány z hlediska jejich citlivosti/specificity diagnostické výkonnosti ve skupinách infekce. V případě potřeby bude provedena AUC analýzy ROC.

Bakteriální infekce hostitelská odpověď přímá LS-TA v granulocytech (prozánětlivá odpověď)

Direct LS-TA je druh RBB, který lze snadno kvantifikovat pomocí qPCR nebo DPCR páru genů, genem čitatele RBB a genem jmenovatele RBB. Biomarker je poměr 2 genů. Typ jediného buňky: granulocyt. RBB GENE NUMERÁTOR: ALPL, ANXA3 nebo ARG1.

Gen jmenovatel RBB: SAT1 nebo SRGN. Různé RBB budou porovnány z hlediska jejich citlivosti/specificity diagnostické výkonnosti ve skupinách infekce. V případě potřeby bude provedena AUC analýzy ROC.

Aktivní TB Hostitelská odezva přímá LS-TA v monocytech (odezva interferonu typu II)

Direct LS-TA je druh RBB, který lze snadno kvantifikovat pomocí qPCR nebo DPCR páru genů, genem čitatele RBB a genem jmenovatele RBB. Biomarker je poměr 2 genů. Typ jednotlivých buněk: monocyt.

RBB GENE NUMERÁTOR: WARS1, ATF3 nebo CALHM6. Gen jmenovatel RBB: PSAP, CTSS nebo CPVL. Různé RBB budou porovnány z hlediska jejich citlivosti/specificity diagnostické výkonnosti ve skupinách infekcí. V případě potřeby bude provedena AUC analýzy ROC.

Aktivní odezva hostitele TB přímá LS-TA v granulocytech (interferonová odezva typu II)

Direct LS-TA je druh RBB, který lze snadno kvantifikovat pomocí qPCR nebo DPCR páru genů, genem čitatele RBB a genem jmenovatele RBB. Biomarker je poměr 2 genů. Typ jediného buňky: granulocyt. Gen numerátoru RBB: AnkRD22, BATF2, CD274, FCGR1A nebo ETV7.

Gen jmenovatel RBB: SAT1 nebo SRGN. Různé RBB budou porovnány z hlediska jejich citlivosti/specificity diagnostické výkonnosti ve skupinách infekcí. V případě potřeby bude provedena AUC analýzy ROC.

Přímé distribuce výsledků LS-TA a medián těchto přímých LS-TA RBB ve skupinách infekce

Statistické rozdělení biomarkeru a statistického srovnání s kontrolním rozsahem nebo porovnáním s mediánem kontrolní skupiny. Výsledky budou hlášeny jako p-hodnoty statistických testů.

Vyhodnocení metody pro porovnání výkonu kvantitativní PCR a digitální PCR

Vyhodnoťte výkon testu a přesnost metod kvantifikace TA: kvantitativní PCR a digitální PCR.

Kvantitativní výsledky PCR budou hlášeny jako hodnoty Delta-Delta CT. Výsledky digitální PCR budou hlášeny jako poměry 2 počtů. A poté přeměněni na násobku průměrného/mediánu v kontrole kontroly (MOM) pro srovnání s hodnotami CT delta-delta.