Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Vertsrespons på infeksjon ved direkte analyse av leukocytt-enkeltcelletype genuttrykk/transkripsjonsforekomst, direkte LS-TA. En prospektiv studie vil evaluere ytelsen til direkte LS-TA hos triage feberpasienter til viktige kategorier av infeksjoner: viral, bakteriell eller aktiv tuberkulose.

27. februar 2025 oppdatert av: Nelson Tang, Chinese University of Hong Kong

Perifert ekspresjonsprofil for enkelt celletype av interferon-stimulerte og andre biomarkørgener for triage av feberpasienter

Febre sykdom er en vanlig tilstand, og det er avgjørende å ha en tidlig triage av pasienter i henhold til forskjellige etiologier for å muliggjøre passende behandling. For øyeblikket er de fleste screening/diagnostiske tester rettet mot påvisning av patogener, mens bare noen få analyser tar sikte på å forstå vertsresponsen, og de er mest basert på en måling av serumproteiner (f.eks. CRP eller procalcitonin).

Nylig har blodtranskriptom blitt undersøkt for å skille bakterielle og virusinfeksjoner. Imidlertid representerer genuttrykk i blod en sammensatt score av genuttrykk av alle komponentcelletyper som er til stede i prøven. Her foreslår vi å utvikle en rask test som kan bestemme genuttrykk av en spesifisert enkeltcelletype i perifert blod (f.eks. LS-TA), da det direkte kan bestemme genuttrykket av en spesifisert enkeltcelletype blant forskjellige andre leukocyttpopulasjoner direkte i en perifer blodprøve. Slike resultater indikerer arten av vertsrespons i henhold til 3 eller flere akser (type I eller type II-interferon signaleringsrespons eller pro-inflammatorisk cytokinsignalering), og det kan brukes til å indikere typen underliggende infeksjon (viral, bakteriell eller aktiv tuberkulose).

Studieoversikt

Status

Har ikke rekruttert ennå

Forhold

Intervensjon / Behandling

Detaljert beskrivelse

Direkte LS-TA er en forholdsbasert biomarkør (RBB) for blodgenekspresjonsanalyse som kan utføres i vanlig tilgjengelig utstyr (f.eks. QPCR eller digitale PCR -maskiner). Ved å bruke forholdet mellom TA for tidligere definert numeratorgen og denominator-genet, kan dette RBB kvantifisere genuttrykk av den spesifiserte konstitusjonelle enkeltcelletypen (f.eks. monocytter og granulocytter) inne i en celleblandingsprøve av fullblod. Direkte LS-TA var en metode som var pioner av PI [Tang 2017, https://patents.google.com/patent/us9589099b2/]. Og det er utviklet for kvantifisering av tidlig B -cellespons etter vaksinasjon [DOI: 10.3390/Genes12070971]. Nylig brukes metoden for å utvikle biomarkører for vertsrespons etter infeksjon for å differensiere typen patogener (for eksempel viral, bakteriell eller aktiv tuberkulose). Teller og nevnergener er blitt identifisert ved bruk av offentlige genuttrykksdatasett for monocytter og granulocytter. Diagnostisk ytelse var bra ved å bruke disse offentlige dataene. Derfor vil disse RBB -ene bli brukt i den prospektive studien for å evaluere og sammenligne deres diagnostiske (triage) ytelse av feberpasienter i forskjellige patogenetiologier.

Sammenlignet med andre metoder for å oppnå genekspresjonsdata av enkeltceller, har direkte LS-TA mange fordeler den konvensjonelle (gullstandard) tilnærmingen er å kvantifisere genuttrykk i en prøve av renset enkeltcelletype fra perifert blod, men det er veldig arbeidsintensiv prosedyre. Nyere enkeltcelle RNA-sekvensering kan også gi genuttrykksdata for hver enkelt celle i en prøve, men det er tregt og veldig kostbart. Direkte LS-TA gir den unike teknikken for å kvantifisere genuttrykk av enkeltcelletype i blodprøver uten behov for å isolere den målrettede celletypen. Det har blitt brukt til å differensiere typen vertsrespons hos feberpasienter til 3 hovedakser (type I eller type II interferon signaleringsrespons eller pro-inflammatorisk cytokinsignalering) som tilsvarer arten av underliggende infeksjons etiologier (virusinfeksjon, aktiv tuberkulose og bakteriell infeksjon).

Se Preprint DOI: 10.1101/2025.01.27.634977. og patenter i B -celler: https://patents.google.com/patent/wo2022089426a1/ Monocytter: https://patents.google.com/patent/wo2023109365a1/ Granulocytter: https://patents.google.com/patent/gb202400180d0/

Studietype

Observasjonsmessig

Registrering (Antatt)

200

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiekontakt

Studiesteder

  • Hong Kong
      • Hong Kong, Hong Kong
        • Dept of Chemical Pathology, Chinese University of Hong Kong
        • Ta kontakt med:

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

  • Voksen
  • Eldre voksen

Tar imot friske frivillige

Nei

Prøvetakingsmetode

Ikke-sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

Pasienter med feber på grunn av infeksjoner som senere er klinisk diagnostisert som virusinfeksjon, bakteriell infeksjon eller aktiv tuberkulose.

Beskrivelse

Inkluderingskriterier:

  • Voksne pasienter med feber med akutt begynnelse som er definert av en hevet kroppstemperatur.
  • Pasienten bør forstå kinesisk ord for å gi informert samtykke.

Eksklusjonskriterier:

  • Pasienter med en historie med immunsvikt eller immunkompromittert tilstand. Pasienter fikk steriod eller annen immunterapi.

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

Kohorter og intervensjoner

Gruppe / Kohort
Intervensjon / Behandling
Bakteriell infeksjonsgruppe
En prospektiv prøve av voksne pasienter som senere bekreftet å ha feber på grunn av bakteriell infeksjon ved positive kulturresultater.
Annen: Ingen inngrep
Pasienter vil få klinisk behandling uten spesiell intervensjon i denne observasjonsstudien. Det er ingen forskjell i behandlingsbehandling av pasienter. Det innebærer bare en ekstra blodprøvetaking tidlig etter innleggelse.
Virusinfeksjonsgruppe
En prospektiv prøve av voksne pasienter som senere bekreftet å ha feber på grunn av virusinfeksjon ved positive patogendiagnostiske resultater.
Annen: Ingen inngrep
Pasienter vil få klinisk behandling uten spesiell intervensjon i denne observasjonsstudien. Det er ingen forskjell i behandlingsbehandling av pasienter. Det innebærer bare en ekstra blodprøvetaking tidlig etter innleggelse.
Aktiv tuberkulosegruppe
En prospektiv prøve av voksne pasienter som senere bekreftet å ha feber på grunn av aktiv tuberkulose ved klinisk diagnose og/eller positive patogenresultater.
Annen: Ingen inngrep
Pasienter vil få klinisk behandling uten spesiell intervensjon i denne observasjonsstudien. Det er ingen forskjell i behandlingsbehandling av pasienter. Det innebærer bare en ekstra blodprøvetaking tidlig etter innleggelse.

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Viral vertsrespons direkte LS-TA i monocytter (type I interferonrespons)
Tidsramme: først samlet prøve i løpet av den første uken etter innleggelse

Direkte LS-TA er en slags RBB som lett kan kvantifiseres ved qPCR eller DPCR av et par gener, RBB-teller-genet og RBB-nevnergenet. Biomarkøren er forholdet mellom de to genene. Enkelt celletype: monocytt. RBB Numerator -gen: IFI27 eller IFI44L. RBB nevnergen: PSAP, CTSS eller CPVL.

De forskjellige RBB (f.eks. IFI27/PSAP og IFI44L/PSAP -forhold) vil bli sammenlignet med tanke på deres følsomhet/spesifisitet av diagnostisk ytelse i prøvene fra infeksjonsgrupper. AUC for ROC -analyse vil bli utført der det er aktuelt.
først samlet prøve i løpet av den første uken etter innleggelse
Viral vertsrespons direkte LS-TA i granulocytter (type I interferonrespons)
Tidsramme: først samlet prøve i løpet av den første uken etter innleggelse

Direkte LS-TA er en slags RBB som lett kan kvantifiseres ved qPCR eller DPCR av et par gener, RBB-teller-genet og RBB-nevnergenet. Biomarkøren er forholdet mellom de to genene. Enkelt celletype: granulocytt. RBB Numerator -gen: RSAD2 eller IFIT1.

RBB nevnergen: SAT1 eller SRGN. De forskjellige RBB vil bli sammenlignet med tanke på deres følsomhet/spesifisitet av diagnostisk ytelse i infeksjonsgruppene. AUC for ROC -analyse vil bli utført der det er aktuelt.
først samlet prøve i løpet av den første uken etter innleggelse
Bakteriell infeksjon vertsrespons direkte LS-TA i monocytter (pro-inflammatorisk respons)
Tidsramme: først samlet prøve i løpet av den første uken etter innleggelse
Direkte LS-TA er en slags RBB som lett kan kvantifiseres ved qPCR eller digital PCR (DPCR) av et par gener, RBB-teller-genet og RBB-nevnergenet. Biomarkøren er forholdet mellom de to genene. Enkelt celletype: monocytt. RBB Numerator -gen: VNN1 eller NLRC4. RBB nevnergen: PSAP, CTSS eller CPVL. De forskjellige RBB -ene vil bli sammenlignet med tanke på deres følsomhet/spesifisitet av diagnostisk ytelse i infeksjonsgruppene. AUC for ROC -analyse vil bli utført der det er aktuelt.
først samlet prøve i løpet av den første uken etter innleggelse
Bakteriell infeksjon vertsrespons direkte LS-TA i granulocytter (pro-inflammatorisk respons)
Tidsramme: først samlet prøve i løpet av den første uken etter innleggelse

Direkte LS-TA er en slags RBB som lett kan kvantifiseres ved qPCR eller DPCR av et par gener, RBB-teller-genet og RBB-nevnergenet. Biomarkøren er forholdet mellom de to genene. Enkelt celletype: granulocytt. RBB Numerator -gen: ALPL, ANXA3 eller ARG1.

RBB nevnergen: SAT1 eller SRGN. De forskjellige RBB vil bli sammenlignet med tanke på deres følsomhet/spesifisitet av diagnostisk ytelse i infeksjonsgruppene. AUC for ROC -analyse vil bli utført der det er aktuelt.
først samlet prøve i løpet av den første uken etter innleggelse
Aktiv TB vertsrespons Direkte LS-TA i monocytter (Type II interferonrespons)
Tidsramme: først samlet prøve i løpet av den første uken etter innleggelse

Direkte LS-TA er en slags RBB som lett kan kvantifiseres ved qPCR eller DPCR av et par gener, RBB-teller-genet og RBB-nevnergenet. Biomarkøren er forholdet mellom de to genene. Enkelt celletype: monocytt.

RBB Numerator -gen: WARS1, ATF3 eller CALHM6. RBB nevnergen: PSAP, CTSS eller CPVL. De forskjellige RBB vil bli sammenlignet med tanke på deres følsomhet/spesifisitet av diagnostisk ytelse i infeksjonsgrupper. AUC for ROC -analyse vil bli utført der det er aktuelt.
først samlet prøve i løpet av den første uken etter innleggelse
Aktiv TB vertsrespons Direkte LS-TA i granulocytter (Type II interferonrespons)
Tidsramme: først samlet prøve i løpet av den første uken etter innleggelse

Direkte LS-TA er en slags RBB som lett kan kvantifiseres ved qPCR eller DPCR av et par gener, RBB-teller-genet og RBB-nevnergenet. Biomarkøren er forholdet mellom de to genene. Enkelt celletype: granulocytt. RBB Numerator -gen: ANKRD22, BATF2, CD274, FCGR1A eller ETV7.

RBB nevnergen: SAT1 eller SRGN. De forskjellige RBB vil bli sammenlignet med tanke på deres følsomhet/spesifisitet av diagnostisk ytelse i infeksjonsgrupper. AUC for ROC -analyse vil bli utført der det er aktuelt.
først samlet prøve i løpet av den første uken etter innleggelse

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Direkte LS-TA-resultatfordeling og median av disse direkte LS-TA RBB i infeksjonsgrupper
Tidsramme: først samlet prøve i løpet av den første uken etter innleggelse
Den statistiske fordelingen av biomarkøren og statistisk sammenligning med kontrollområdet eller sammenligning med kontrollgruppemedian. Resultatene vil bli rapportert som p-verdier for de statistiske testene.
først samlet prøve i løpet av den første uken etter innleggelse
Metodeevaluering for å sammenligne ytelsen til kvantitativ PCR og digital PCR
Tidsramme: først samlet prøve i løpet av den første uken etter innleggelse

Evaluer analysen og presisjonen av begge TA -kvantifiseringsmetoder: kvantitativ PCR og digital PCR.

Kvantitative PCR-resultater vil bli rapportert som Delta-Delta CT-verdier. Digitale PCR -resultater vil bli rapportert som forhold på 2 tellinger. Og deretter konvertert til flere av middel/median i kontrollkontrollen (MOM) for sammenligning med Delta-Delta CT-verdier.
først samlet prøve i løpet av den første uken etter innleggelse

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Sponsor

Chinese University of Hong Kong

Publikasjoner og nyttige lenker

Den som er ansvarlig for å legge inn informasjon om studien leverer frivillig disse publikasjonene. Disse kan handle om alt relatert til studiet.

Generelle publikasjoner

Hjelpsomme linker

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Antatt)

1. februar 2025

Primær fullføring (Antatt)

1. september 2028

Studiet fullført (Antatt)

1. desember 2028

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

18. februar 2025

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

20. februar 2025

Først lagt ut (Faktiske)

25. mars 2025

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)

25. mars 2025

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

27. februar 2025

Sist bekreftet

1. februar 2025

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Nøkkelord

Ytterligere relevante MeSH-vilkår

Andre studie-ID-numre

  • Direct LS-TA prospective study

Plan for individuelle deltakerdata (IPD)

Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?

UBESLUTTE

IPD-planbeskrivelse

Beskrivende statistikk over resultater vil bli gitt på en rimelig forespørsel.

Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter

Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt

Nei

Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt

Nei

produkt produsert i og eksportert fra USA

Nei

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Abonnere