Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

Värdsvar på infektion genom direkt analys av leukocyt-encell-typgenuttryck/transkriptionsmängden, direkt LS-TA. En prospektiv studie kommer att utvärdera prestandan för direkt LS-TA hos triage feberpatienter till huvudkategorier av infektioner: viral, bakteriell eller aktiv tuberkulos.

27 februari 2025 uppdaterad av: Nelson Tang, Chinese University of Hong Kong

Perifera blod Enkel cell-typuttrycksprofil för interferonstimulerade och andra biomarkörgener för triage av feberpatienter

Feberles sjukdom är ett vanligt tillstånd och det är avgörande att ha en tidig triage av patienter enligt olika etiologier för att möjliggöra lämplig behandling. För närvarande riktar de flesta screening/diagnostiska tester detektion av patogener, medan endast ett fåtal analyser syftar till att förstå värdsvaret, och de är mestadels baserade på en mätning av serumproteiner (t.ex. CRP eller procalcitonin).

Nyligen har blodtranskriptom undersökts för att differentiera bakterie- och virusinfektioner. Genuttryck i blod representerar emellertid en sammansatt poäng av genuttryck av alla komponentcelltyper som finns i provet. Här föreslår vi att utveckla ett snabbt test som kan bestämma genuttryck av en viss enstaka celltyp i perifert blod (t.ex. monocyter eller granulocyter) som en värdsvar Biomarkör för att differentiera tre huvudkategorier av infektioner som är bakterie-, viral och tuberculose Analysen kallas Direct Leukocyte-cell-Typepe-tyga som är Bakteriell, viral och tuberculos Assayen kallas Direct Leukocyte kan direkt bestämma genuttrycket för en specifik enkel celltyp bland olika andra leukocytpopulationer direkt i ett perifert blodprov. Sådana resultat betyder arten av värdsvaret enligt 3 eller fler axlar (typ I eller typ II interferon-signalrespons eller pro-inflammatorisk cytokinsignalering) och det kan användas för att indikera typen av underliggande infektion (viral, bakteriell eller aktiv tuberkulos).

Studieöversikt

Status

Har inte rekryterat ännu

Betingelser

Intervention / Behandling

Detaljerad beskrivning

Direct LS-TA är ett förhållande-baserat biomarkör (RBB) för analys av blodgenuttryck som kan utföras i vanligt tillgänglig utrustning (t.ex. qPCR eller digitala PCR -maskiner). Med hjälp av förhållandet mellan TA för tidigare definierad tellergen och nämnargen kan denna RBB kvantifiera genuttryck för den angivna konstitutionella enstaka celltypen (t.ex. Monocyter och granulocyter) inuti ett cellblandningsprov av helblod. Direct LS-Ta var en metod som var banbrytande av PI [Tang 2017, https://patents.google.com/patent/us9589099b2/]. Och det har utvecklats för kvantifiering av tidigt B -cellrespons efter vaccination [DOI: 10.3390/gener12070971]. Nyligen används metoden för att utveckla värdens svarbiomarkörer efter infektion för att differentiera typen av patogener (såsom viral, bakteriell eller aktiv tuberkulos). Gener och nämnargener har identifierats genom att använda offentliga genuttrycksdatasätt för monocyter och granulocyter. Diagnostisk prestanda var bra med hjälp av dessa offentliga uppgifter. Därför kommer dessa RBB: er att tillämpas i den prospektiva studien för att utvärdera och jämföra deras diagnostiska (triage) prestanda för feberpatienter till olika patogentiologier.

Jämfört med andra metoder för att erhålla genuttrycksdata med en cell-typ har direkt LS-TA många fördelar som den konventionella (guldstandard) metoden är att kvantifiera genuttryck i ett prov av renad enkelcelltyp från perifert blod men det är mycket arbetsintensivt förfarande. Nyligen encellig RNA-sekvensering kan också tillhandahålla genuttrycksdata för varje enskild cell i ett prov, men det är långsamt och mycket kostsamt. Direct LS-TA tillhandahåller den unika tekniken för att kvantifiera genuttryck av enstyp i blodprover utan att behöva isolera den riktade celltypen. Det har använts för att differentiera typen av värdrespons hos feberpatienter i 3 huvudaxlar (typ I eller typ II-interferon-signalrespons eller pro-inflammatorisk cytokinsignalering) som motsvarar naturen av underliggande infektionsaetiologier (viral infektion, aktiv tuberkulos och bakteriell infektion).

Se PrePrint DOI: 10.1101/2025.01.27.634977. och patent i B -celler: https://patents.google.com/patent/wo2022089426a1/ Monocyter: https://patents.google.com/patent/wo2023109365a1/ Granulocyter: https://patents.google.com/patent/gb202400180d0/

Studietyp

Observationell

Inskrivning (Beräknad)

200

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studiekontakt

Studieorter

  • Hong Kong
      • Hong Kong, Hong Kong
        • Dept of Chemical Pathology, Chinese University of Hong Kong
        • Kontakt:

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

  • Vuxen
  • Äldre vuxen

Tar emot friska volontärer

Nej

Testmetod

Icke-sannolikhetsprov

Studera befolkning

Patienter med feber på grund av infektioner som senare kliniskt diagnostiseras som virusinfektion, bakteriell infektion eller aktiv tuberkulos.

Beskrivning

Inkluderingskriterier:

  • Vuxna patienter med feber med akut början som definieras av en upphöjd kroppstemperatur.
  • Patienten bör förstå kinesiskt ord för att ge informerat samtycke.

Uteslutningskriterier:

  • Patienter med en historia av immunbrist eller immunkomprometterat tillstånd. Patienter fick steriod eller annan immunterapi.

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

Kohorter och interventioner

Grupp / Kohort
Intervention / Behandling
Bakterieinfektionsgrupp
Ett prospektivt urval av vuxna patienter som senare bekräftade att ha feber på grund av bakteriell infektion genom positiva odlingsresultat.
Övrig: Ingen intervention
Patienter kommer att få klinisk behandling utan speciell intervention i denna observationsstudie. Det finns ingen skillnad i behandlingen av patienter. Det innebär bara ytterligare ett blodprovtagning tidigt efter införandet.
Virusinfektionsgrupp
Ett prospektivt prov av vuxna patienter som senare bekräftade att ha feber på grund av virusinfektion genom positiva patogendiagnostiska resultat.
Övrig: Ingen intervention
Patienter kommer att få klinisk behandling utan speciell intervention i denna observationsstudie. Det finns ingen skillnad i behandlingen av patienter. Det innebär bara ytterligare ett blodprovtagning tidigt efter införandet.
Aktiv tuberkulosgrupp
Ett prospektivt prov av vuxna patienter som senare bekräftade att ha feber på grund av aktiv tuberkulos genom klinisk diagnos och/eller positiva patogenresultat.
Övrig: Ingen intervention
Patienter kommer att få klinisk behandling utan speciell intervention i denna observationsstudie. Det finns ingen skillnad i behandlingen av patienter. Det innebär bara ytterligare ett blodprovtagning tidigt efter införandet.

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Viral Host Response Direct LS-Ta i monocyter (Typ I Interferon Response)
Tidsram: Först insamlat prov inom den första veckan efter antagningen

Direct LS-TA är en slags RBB som lätt kan kvantifieras med qPCR eller DPCR för ett par gener, RBB-numeratorgenen och RBB-nämnargenen. Biomarkören är förhållandet mellan de två generna. Enkel celltyp: monocyt. RBB -numeratorgen: IFI27 eller IFI44L. RBB -nämnargen: PSAP, CTS eller CPVL.

De olika RBB (t.ex. IFI27/PSAP och IFI44L/PSAP -förhållanden) kommer att jämföras i termer av deras känslighet/specificitet för diagnostisk prestanda i proverna från infektionsgrupper. AUC från ROC -analys kommer att utföras där det är lämpligt.
Först insamlat prov inom den första veckan efter antagningen
Viral Host Response Direct LS-Ta i granulocyter (Typ I Interferon Response)
Tidsram: Först insamlat prov inom den första veckan efter antagningen

Direct LS-TA är en typ av RBB som lätt kan kvantifieras med qPCR eller DPCR för ett par gener, RBB-numeratorgenen och RBB-nämnargenen. Biomarkören är förhållandet mellan de två generna. Enkel celltyp: granulocyt. RBB -numeratorgen: RSAD2 eller IFIT1.

RBB -nämnargen: SAT1 eller SRGN. De olika RBB kommer att jämföras i termer av deras känslighet/specificitet för diagnostisk prestanda i infektionsgrupperna. AUC från ROC -analys kommer att utföras där det är lämpligt.
Först insamlat prov inom den första veckan efter antagningen
Bakteriell infektion Host Response Direct LS-Ta i monocyter (pro-inflammatoriskt svar)
Tidsram: Först insamlat prov inom den första veckan efter antagningen
Direct LS-TA är en typ av RBB som lätt kan kvantifieras med qPCR eller digital PCR (DPCR) av ett par gener, RBB-numeratorgenen och RBB-nämnargenen. Biomarkören är förhållandet mellan de två generna. Enkel celltyp: monocyt. RBB -numeratorgen: VNN1 eller NLRC4. RBB -nämnargen: PSAP, CTS eller CPVL. De olika RBB: erna kommer att jämföras i termer av deras känslighet/specificitet för diagnostisk prestanda i infektionsgrupperna. AUC från ROC -analys kommer att utföras där det är lämpligt.
Först insamlat prov inom den första veckan efter antagningen
Bakteriell infektion Host Response Direct LS-Ta i granulocyter (pro-inflammatoriskt svar)
Tidsram: Först insamlat prov inom den första veckan efter antagningen

Direct LS-TA är en typ av RBB som lätt kan kvantifieras med qPCR eller DPCR för ett par gener, RBB-numeratorgenen och RBB-nämnargenen. Biomarkören är förhållandet mellan de två generna. Enkel celltyp: granulocyt. RBB -numeratorgen: Alpl, Anxa3 eller Arg1.

RBB -nämnargen: SAT1 eller SRGN. De olika RBB kommer att jämföras i termer av deras känslighet/specificitet för diagnostisk prestanda i infektionsgrupperna. AUC från ROC -analys kommer att utföras där det är lämpligt.
Först insamlat prov inom den första veckan efter antagningen
Active TB Host Response Direct LS-Ta i monocyter (typ II interferonrespons)
Tidsram: Först insamlat prov inom den första veckan efter antagningen

Direct LS-TA är en typ av RBB som lätt kan kvantifieras med qPCR eller DPCR för ett par gener, RBB-numeratorgenen och RBB-nämnargenen. Biomarkören är förhållandet mellan de två generna. Enkel celltyp: monocyt.

RBB -numeratorgen: Wars1, ATF3 eller CALHM6. RBB -nämnargen: PSAP, CTS eller CPVL. De olika RBB kommer att jämföras i termer av deras känslighet/specificitet för diagnostisk prestanda i infektionsgrupper. AUC från ROC -analys kommer att utföras där det är lämpligt.
Först insamlat prov inom den första veckan efter antagningen
Active TB Host Response Direct LS-Ta i granulocyter (typ II interferonrespons)
Tidsram: Först insamlat prov inom den första veckan efter antagningen

Direct LS-TA är en slags RBB som lätt kan kvantifieras med qPCR eller DPCR för ett par gener, RBB-numeratorgenen och RBB-nämnargenen. Biomarkören är förhållandet mellan de två generna. Enkel celltyp: granulocyt. RBB -numeratorgen: ANKRD22, BATF2, CD274, FCGR1A eller ETV7.

RBB -nämnargen: SAT1 eller SRGN. De olika RBB kommer att jämföras i termer av deras känslighet/specificitet för diagnostisk prestanda i infektionsgrupper. AUC från ROC -analys kommer att utföras där det är lämpligt.
Först insamlat prov inom den första veckan efter antagningen

Sekundära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Direkt LS-TA-resultatfördelning och median av dessa direkta LS-TA RBB i infektionsgrupper
Tidsram: Först insamlat prov inom den första veckan efter antagningen
Den statistiska fördelningen av biomarkören och statistisk jämförelse med kontrollområdet eller jämförelse med kontrollgruppsmedian. Resultaten kommer att rapporteras som p-värden för de statistiska testerna.
Först insamlat prov inom den första veckan efter antagningen
Metodutvärdering för att jämföra prestanda för kvantitativ PCR och digital PCR
Tidsram: Först insamlat prov inom den första veckan efter antagningen

Utvärdera analysprestanda och precision för båda TA -kvantifieringsmetoderna: kvantitativ PCR och digital PCR.

Kvantitativa PCR-resultat kommer att rapporteras som delta-delta-CT-värden. Digitala PCR -resultat kommer att rapporteras som förhållanden på två räkningar. Och konverteras sedan till flera medelvärde/median i kontrollkontrollen (MOM) för jämförelse med delta-delta-CT-värden.
Först insamlat prov inom den första veckan efter antagningen

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Sponsor

Chinese University of Hong Kong

Publikationer och användbara länkar

Den som ansvarar för att lägga in information om studien tillhandahåller frivilligt dessa publikationer. Dessa kan handla om allt som har med studien att göra.

Allmänna publikationer

Användbara länkar

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Beräknad)

1 februari 2025

Primärt slutförande (Beräknad)

1 september 2028

Avslutad studie (Beräknad)

1 december 2028

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

18 februari 2025

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

20 februari 2025

Första postat (Faktisk)

25 mars 2025

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)

25 mars 2025

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

27 februari 2025

Senast verifierad

1 februari 2025

Mer information

Termer relaterade till denna studie

Nyckelord

Ytterligare relevanta MeSH-villkor

Andra studie-ID-nummer

  • Direct LS-TA prospective study

Plan för individuella deltagardata (IPD)

Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?

OBESLUTSAM

IPD-planbeskrivning

Beskrivande statistik över resultat kommer att tillhandahållas på en rimlig begäran.

Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument

Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt

Nej

Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt

Nej

produkt tillverkad i och exporterad från U.S.A.

Nej

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Prenumerera