Cette page a été traduite automatiquement et l'exactitude de la traduction n'est pas garantie. Veuillez vous référer au version anglaise pour un texte source.

Réponse de l'hôte à l'infection par analyse directe de l'abondance de gène de type leucocyte de type cellule unique / transcript, LS-TA direct. Une étude prospective évaluera les performances du LS-TA direct chez les patients fébriles de triage dans les grandes catégories d'infections: tuberculose virale, bactérienne ou active.

27 février 2025 mis à jour par: Nelson Tang, Chinese University of Hong Kong

Profil d'expression de type à cellules unicellulaires du sang périphérique des gènes de biomarqueurs stimulés par l'interféron pour le triage de patients fébriles

La maladie fébrile est une condition courante et il est crucial d'avoir un triage précoce de patients selon diverses étiologies pour permettre un traitement approprié. Actuellement, la plupart des tests de dépistage / diagnostic ciblent la détection des agents pathogènes, tandis que seuls quelques tests visent à comprendre la réponse de l'hôte, et ils sont principalement basés sur une mesure des protéines sériques (par ex. CRP ou procalcitonine).

Récemment, le transcriptome sanguin a été exploré pour différencier les infections bactériennes et virales. Cependant, l'expression des gènes dans le sang représente un score composite d'expression génique de tous les types de cellules composants présents dans l'échantillon. Ici, nous proposons de développer un test rapide qui peut déterminer les expressions de gènes d'un type de cellule unique spécifié dans du sang périphérique (par exemple, des monocytes ou des granulocytes) en tant que biomarqueur de réponse hôte pour différencier trois principales catégories d'infections qui sont bactériennes, virales et tuberculoss. Peut déterminer directement l'expression du gène d'un type de cellule unique spécifié parmi diverses autres populations de leucocytes directement dans un échantillon de sang périphérique. Ces résultats signifient la nature de la réponse de l'hôte selon 3 axes ou plus (réponse de signalisation d'interféron de type I ou de type II ou signalisation de cytokines pro-inflammatoires) et il peut être utilisé pour indiquer le type d'infection sous-jacente (tuberculose virale, bactérienne ou active).

Aperçu de l'étude

Statut

Pas encore de recrutement

Les conditions

Intervention / Traitement

Description détaillée

Le LS-TA direct est un biomarqueur basé sur un rapport (RBB) pour l'analyse de l'expression des gènes sanguins qui peut être effectué dans des équipements couramment disponibles (par exemple QPCR ou machines PCR numériques). En utilisant le rapport de TA du gène numérique et du gène du dénominateur défini préalables, ce RBB peut quantifier l'expression du gène du type de cellule unique constitutionnel spécifié (par exemple (par ex. Monocytes et granulocytes) à l'intérieur d'un échantillon de mélange de cellules de sang total. Direct LS-Ta était une méthode lancée par le PI [Tang 2017, https://patents.google.com/patent/us9589099b2/]. Et il a été développé pour la quantification de la réponse précoce des cellules B après la vaccination [doi: 10.3390 / gènes12070971]. Récemment, la méthode est utilisée pour développer des biomarqueurs de réponse hôte après infection pour différencier le type d'agents pathogènes (comme la tuberculose virale, bactérienne ou active). Les gènes de numérateur et de dénominateur ont été identifiés en utilisant des ensembles de données d'expression de gènes publics pour les monocytes et les granulocytes. Les performances diagnostiques étaient bonnes en utilisant ces données publiques. Par conséquent, ces RBB seront appliqués dans l'étude prospective pour évaluer et comparer leurs performances diagnostiques (triage) de patients fébriles dans différentes étiologies pathogènes.

En comparant d'autres méthodes pour obtenir des données d'expression génique de type cellule unique, la LS-TA directe présente de nombreux avantages L'approche conventionnelle (étalon-or) consiste à quantifier l'expression des gènes dans un échantillon de type de cellule unique purifié du sang périphérique, mais il s'agit d'une procédure très intensive en main-d'œuvre. Le séquençage récent sur l'ARN unique peut également fournir des données d'expression génique pour chaque cellule individuelle dans un échantillon, mais elle est lente et très coûteuse. Le LS-TA direct fournit la technique unique pour quantifier l'expression des gènes de type cellule unique dans des échantillons de sang sans avoir besoin d'isoler le type de cellule ciblé. Il a été utilisé pour différencier le type de réponse de l'hôte chez les patients atteints de fièvre en 3 axes principaux (réponse de signalisation de type I ou de type II d'interféron ou signalisation de cytokines pro-inflammatoires) qui correspondent à la nature des étiologies d'infection sous-jacentes (infection virale, tuberculose active et infection bactérienne).

Voir préimprimée DOI: 10.1101 / 2025.01.27.634977. et brevets dans les cellules B: https://patents.google.com/patent/wo2022089426a1/ Monocytes: https://patents.google.com/patent/wo2023109365a1/ Granulocytes: https://patents.google.com/patent/gb202400180d0/

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Estimé)

200

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Coordonnées de l'étude

Lieux d'étude

  • Hong Kong
      • Hong Kong, Hong Kong
        • Dept of Chemical Pathology, Chinese University of Hong Kong
        • Contact:

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

  • Adulte
  • Adulte plus âgé

Accepte les volontaires sains

Non

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Les patients atteints de fièvre due à des infections qui sont ensuite diagnostiqués cliniquement comme une infection virale, une infection bactérienne ou une tuberculose active.

La description

Critères d'inclusion:

  • Les patients adultes atteints de fièvre d'apparition aiguë qui sont définis par une température corporelle surélevée.
  • Le patient doit comprendre le mot chinois pour donner un consentement éclairé.

Critères d'exclusion:

  • Patients ayant des antécédents de toute immunodéficience ou condition immunodéprimée. Les patients ont reçu de la stériode ou une autre immunothérapie.

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Intervention / Traitement
Groupe d'infection bactérienne
Un échantillon prospectif de patients adultes qui ont confirmé plus tard de la fièvre due à une infection bactérienne par des résultats de culture positive.
Autre: Aucune intervention
Les patients recevront un traitement clinique sans intervention spéciale dans cette étude d'observation. Il n'y a pas de différence dans le terme de traitement des patients. Cela n'implique qu'un échantillonnage de sang supplémentaire tôt après l'admission.
Groupe d'infection virale
Un échantillon prospectif de patients adultes qui ont confirmé plus tard de la fièvre due à une infection virale par des résultats diagnostiques de pathogènes positifs.
Autre: Aucune intervention
Les patients recevront un traitement clinique sans intervention spéciale dans cette étude d'observation. Il n'y a pas de différence dans le terme de traitement des patients. Cela n'implique qu'un échantillonnage de sang supplémentaire tôt après l'admission.
Groupe de tuberculose active
Un échantillon prospectif de patients adultes qui ont confirmé plus tard de la fièvre en raison de la tuberculose active par diagnostic clinique et / ou des résultats positifs des agents pathogènes.
Autre: Aucune intervention
Les patients recevront un traitement clinique sans intervention spéciale dans cette étude d'observation. Il n'y a pas de différence dans le terme de traitement des patients. Cela n'implique qu'un échantillonnage de sang supplémentaire tôt après l'admission.

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Réponse de l'hôte viral Direct LS-Ta dans les monocytes (réponse d'interféron de type I)
Délai: premier échantillon collecté dans la première semaine après l'admission

Le LS-TA direct est une sorte de RBB qui peut être facilement quantifié par qPCR ou DPCR d'une paire de gènes, le gène du numérateur RBB et le gène du dénominateur RBB. Le biomarqueur est le rapport des 2 gènes. Type de cellule unique: monocyte. RBB Numerator Gene: IFI27 ou IFI44L. RBB Denominator Gene: PSAP, CTSS ou CPVL.

Les divers RBB (par exemple. Les rapports IFI27 / PSAP et IFI44L / PSAP) seront comparés en termes de sensibilité / spécificité des performances diagnostiques dans les échantillons des groupes d'infection. L'ANUC de l'analyse ROC sera effectuée le cas échéant.
premier échantillon collecté dans la première semaine après l'admission
Réponse de l'hôte viral Direct LS-Ta dans les granulocytes (réponse d'interféron de type I)
Délai: premier échantillon collecté dans la première semaine après l'admission

Le LS-TA direct est une sorte de RBB qui peut être facilement quantifié par qPCR ou DPCR d'une paire de gènes, le gène du numérateur RBB et le gène du dénominateur RBB. Le biomarqueur est le rapport des 2 gènes. Type de cellule unique: granulocyte. RBB Numerator Gene: RSAD2 ou IFIT1.

RBB Gene de dénominateur: SAT1 ou SRGN. Les divers RBB seront comparés en termes de sensibilité / spécificité des performances diagnostiques dans les groupes d'infection. L'ANUC de l'analyse ROC sera effectuée le cas échéant.
premier échantillon collecté dans la première semaine après l'admission
Infection bactérienne Réponse de l'hôte LS-TA directement dans les monocytes (réponse pro-inflammatoire)
Délai: premier échantillon collecté dans la première semaine après l'admission
Le LS-TA direct est une sorte de RBB qui peut être facilement quantifié par qPCR ou PCR numérique (DPCR) d'une paire de gènes, le gène du numérateur RBB et le gène du dénominateur RBB. Le biomarqueur est le rapport des 2 gènes. Type de cellule unique: monocyte. Génique du numérateur RBB: VNN1 ou NLRC4. RBB Denominator Gene: PSAP, CTSS ou CPVL. Les divers RBB seront comparés en termes de sensibilité / spécificité des performances diagnostiques dans les groupes d'infection. L'ANUC de l'analyse ROC sera effectuée le cas échéant.
premier échantillon collecté dans la première semaine après l'admission
Infection bactérienne Réponse de l'hôte LS-TA directement dans les granulocytes (réponse pro-inflammatoire)
Délai: premier échantillon collecté dans la première semaine après l'admission

Le LS-TA direct est une sorte de RBB qui peut être facilement quantifié par qPCR ou DPCR d'une paire de gènes, le gène du numérateur RBB et le gène du dénominateur RBB. Le biomarqueur est le rapport des 2 gènes. Type de cellule unique: granulocyte. RBB Numerator Gene: Alpl, ANXA3 ou Arg1.

RBB Gene de dénominateur: SAT1 ou SRGN. Les divers RBB seront comparés en termes de sensibilité / spécificité des performances diagnostiques dans les groupes d'infection. L'ANUC de l'analyse ROC sera effectuée le cas échéant.
premier échantillon collecté dans la première semaine après l'admission
Réponse de l'hôte TB actif Direct LS-TA dans les monocytes (réponse de l'interféron de type II)
Délai: premier échantillon collecté dans la première semaine après l'admission

Le LS-TA direct est une sorte de RBB qui peut être facilement quantifié par qPCR ou DPCR d'une paire de gènes, le gène du numérateur RBB et le gène du dénominateur RBB. Le biomarqueur est le rapport des 2 gènes. Type de cellule unique: monocyte.

RBB Numerator Gene: WARS1, ATF3 ou CALHM6. RBB Denominator Gene: PSAP, CTSS ou CPVL. Les différents RBB seront comparés en termes de sensibilité / spécificité des performances diagnostiques dans les groupes d'infection. L'ANUC de l'analyse ROC sera effectuée le cas échéant.
premier échantillon collecté dans la première semaine après l'admission
Réponse de l'hôte TB actif LS-TA directement dans les granulocytes (réponse d'interféron de type II)
Délai: premier échantillon collecté dans la première semaine après l'admission

Le LS-TA direct est une sorte de RBB qui peut être facilement quantifié par qPCR ou DPCR d'une paire de gènes, le gène du numérateur RBB et le gène du dénominateur RBB. Le biomarqueur est le rapport des 2 gènes. Type de cellule unique: granulocyte. RBB Numerator Gene: ANKRD22, BATF2, CD274, FCGR1A ou ETV7.

RBB Gene de dénominateur: SAT1 ou SRGN. Les différents RBB seront comparés en termes de sensibilité / spécificité des performances diagnostiques dans les groupes d'infection. L'ANUC de l'analyse ROC sera effectuée le cas échéant.
premier échantillon collecté dans la première semaine après l'admission

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Distribution directe des résultats LS-TA et médiane de ces RBB LS-TA directs dans les groupes d'infection
Délai: premier échantillon collecté dans la première semaine après l'admission
La distribution statistique du biomarqueur et la comparaison statistique avec la plage de contrôle ou la comparaison avec la médiane du groupe témoin. Les résultats seront signalés comme des valeurs p des tests statistiques.
premier échantillon collecté dans la première semaine après l'admission
Évaluation de la méthode pour comparer les performances de la PCR quantitative et de la PCR numérique
Délai: premier échantillon collecté dans la première semaine après l'admission

Évaluer les performances du test et la précision des deux méthodes de quantification TA: PCR quantitative et PCR numérique.

Les résultats quantitatifs de la PCR seront rapportés sous forme de valeurs CT delta-delta. Les résultats de la PCR numérique seront rapportés comme des rapports de 2 comptes. Puis converti en multiple de moyenne / médiane dans le contrôle de contrôle (MOM) pour comparaison avec les valeurs CT delta-delta.
premier échantillon collecté dans la première semaine après l'admission

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Chinese University of Hong Kong

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Publications générales

Liens utiles

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Estimé)

1 février 2025

Achèvement primaire (Estimé)

1 septembre 2028

Achèvement de l'étude (Estimé)

1 décembre 2028

Dates d'inscription aux études

Première soumission

18 février 2025

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

20 février 2025

Première publication (Réel)

25 mars 2025

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

25 mars 2025

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

27 février 2025

Dernière vérification

1 février 2025

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Mots clés

Termes MeSH pertinents supplémentaires

Autres numéros d'identification d'étude

  • Direct LS-TA prospective study

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

INDÉCIS

Description du régime IPD

Des statistiques descriptives des résultats seront fournies sur une demande raisonnable.

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

produit fabriqué et exporté des États-Unis.

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

S'abonner