Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Værtsrespons på infektion ved direkte analyse af leukocyt-enkeltcelletype genekspression/transkriptionsforekomst, direkte LS-TA. En prospektiv undersøgelse vil evaluere ydeevnen af ​​direkte LS-TA hos triage febrile-patienter i hovedkategorier af infektioner: viral, bakteriel eller aktiv tuberkulose.

27. februar 2025 opdateret af: Nelson Tang, Chinese University of Hong Kong

Perifert blod-enkeltcelletype ekspressionsprofil af interferon-stimulerede og andre biomarkørgener til triage af febrile patienter

Febrile sygdom er en almindelig tilstand, og det er vigtigt at have en tidlig triage af patienter i henhold til forskellige aetiologier for at muliggøre passende behandling. I øjeblikket er de fleste screening/diagnostiske tests målrettet mod påvisning af patogener, mens kun et par assays sigter mod at forstå værtsresponsen, og de er for det meste baseret på en måling af serumproteiner (f.eks. CRP eller procalcitonin).

For nylig er blodtranskriptom blevet undersøgt for at differentiere bakterielle og virale infektioner. Genekspression i blod repræsenterer imidlertid en sammensat score af genekspression af alle de komponentcelletyper, der er til stede i prøven. Her foreslår vi at udvikle en hurtig test, der kan bestemme genudtryk af en specificeret enkeltcelletype i perifert blod (f.eks. Monocytter eller granulocytter) som en værtsrespons Biomarkør for at differentiere tre hovedkategorier af infektioner, der er bakteriel, viral og tuberculose, assayet kaldes direkte leukocyte enkeltcelletype-transkription (TA) antagelse (Direculos LS-TA) som det direkte kan bestemme genekspressionen af ​​en specificeret enkeltcelletype blandt forskellige andre leukocytpopulationer direkte i en perifer blodprøve. Sådanne resultater betegner arten af ​​værtsrespons i henhold til 3 eller flere akser (type I eller type II-interferon-signalrespons eller pro-inflammatorisk cytokinsignalering), og det kan bruges til at indikere typen af ​​underliggende infektion (viral, bakteriel eller aktiv tuberkulose).

Studieoversigt

Status

Ikke rekrutterer endnu

Betingelser

Intervention / Behandling

Detaljeret beskrivelse

Direct LS-TA er et forholdsbaseret biomarkør (RBB) for blodgenekspressionsanalyse, som kan udføres i almindeligt tilgængeligt udstyr (f.eks. QPCR eller digitale PCR -maskiner). Ved anvendelse af forholdet mellem TA af foruddefineret tællergen og nævnergenet kan dette RBB kvantificere genekspression af den specificerede forfatningsmæssige enkeltcelletype (f.eks. Monocytter og granulocytter) inde i en celle blandingsprøve af helblod. Direct LS-TA var en metode, der var banebrydende af PI [Tang 2017, https://patents.google.com/patent/us9589099b2/]. Og det er udviklet til kvantificering af tidlig B -celle -respons efter vaccination [doi: 10.3390/gener12070971]. For nylig bruges metoden til at udvikle værtsrespons -biomarkører efter infektion for at differentiere typen af ​​patogener (såsom viral, bakteriel eller aktiv tuberkulose). Tæller- og nævnergener er blevet identificeret ved anvendelse af offentlige genekspressionsdatasæt til monocytter og granulocytter. Diagnostisk ydelse var god ved hjælp af disse offentlige data. Derfor vil disse RBB'er blive anvendt i den prospektive undersøgelse for at evaluere og sammenligne deres diagnostiske (triage) ydeevne af febrile patienter i forskellige patogenetiologier.

Sammenlignet med andre metoder til opnåelse af enkeltcelletype genekspressionsdata har Direct LS-TA mange fordele, den konventionelle (guldstandard) tilgang er at kvantificere genekspression i en prøve af oprenset enkeltcelletype fra perifert blod, men det er meget arbejdskrævende procedure. Nylig enkeltcelle-RNA-sekventering kan også tilvejebringe genekspressionsdata for hver enkelt celle i en prøve, men det er langsomt og meget dyrt. Direkte LS-TA tilvejebringer den unikke teknik til at kvantificere enkeltcelletype genekspression i blodprøver uden behov for at isolere den målrettede celletype. Det er blevet brugt til at differentiere typen af ​​værtsrespons hos feberpatienter i 3 hovedakser (type I eller type II-interferon-signalrespons eller pro-inflammatorisk cytokin-signalering), der svarer til arten af ​​underliggende infektions-aetiologier (virusinfektion, aktiv tuberkulose og bakteriel infektion).

Se Preprint DOI: 10.1101/2025.01.27.634977. og patenter i B -celler: https://patents.google.com/patent/wo2022089426a1/ Monocytter: https://patents.google.com/patent/wo2023109365a1/ Granulocytter: https://patents.google.com/patent/gb202400180d0/

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Anslået)

200

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiekontakt

Studiesteder

  • Hong Kong
      • Hong Kong, Hong Kong
        • Dept of Chemical Pathology, Chinese University of Hong Kong
        • Kontakt:

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

  • Voksen
  • Ældre voksen

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Prøveudtagningsmetode

Ikke-sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Patienter med feber på grund af infektioner, der senere er klinisk diagnosticeret som virusinfektion, bakterieinfektion eller aktiv tuberkulose.

Beskrivelse

Inkluderingskriterier:

  • Voksne patienter med feber af akut indtræden, som er defineret af en hævet kropstemperatur.
  • Patienten skal forstå det kinesiske ord for at give informeret samtykke.

Ekskluderingskriterier:

  • Patienter med en historie med enhver immundefekt eller immunkompromitteret tilstand. Patienter modtog steriod eller anden immunterapi.

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

Kohorter og interventioner

Gruppe / kohorte
Intervention / Behandling
Bakteriel infektionsgruppe
En potentiel prøve af voksne patienter, der senere bekræftede at have feber på grund af bakterieinfektion med positive kulturresultater.
Andet: Ingen intervention
Patienter vil modtage klinisk behandling uden særlig indgriben i denne observationsundersøgelse. Der er ingen forskel i behandlingsperioden for patienter. Det involverer kun en yderligere blodprøveudtagning tidligt efter optagelse.
Viral infektionsgruppe
En potentiel prøve af voksne patienter, der senere bekræftede at have feber på grund af virusinfektion med positive patogendiagnostiske resultater.
Andet: Ingen intervention
Patienter vil modtage klinisk behandling uden særlig indgriben i denne observationsundersøgelse. Der er ingen forskel i behandlingsperioden for patienter. Det involverer kun en yderligere blodprøveudtagning tidligt efter optagelse.
Aktiv tuberkulosegruppe
En potentiel prøve af voksne patienter, der senere bekræftede at have feber på grund af aktiv tuberkulose ved klinisk diagnose og/eller positive patogenresultater.
Andet: Ingen intervention
Patienter vil modtage klinisk behandling uden særlig indgriben i denne observationsundersøgelse. Der er ingen forskel i behandlingsperioden for patienter. Det involverer kun en yderligere blodprøveudtagning tidligt efter optagelse.

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Viral værtsrespons direkte LS-TA i monocytter (type I interferon-respons)
Tidsramme: Første indsamlede prøve inden for den første uge efter optagelse

Direkte LS-TA er en slags RBB, der let kan kvantificeres ved qPCR eller DPCR af et par gener, RBB-tællergenet og RBB-nævnergenet. Biomarkøren er forholdet mellem de 2 gener. Enkelt celletype: monocyt. RBB -tællergen: IFI27 eller IFI44L. RBB -nævnergen: PSAP, CTSS eller CPVL.

De forskellige RBB (f.eks. IFI27/PSAP og IFI44L/PSAP -forhold) vil blive sammenlignet med hensyn til deres følsomhed/specificitet af diagnostisk ydeevne i prøverne fra infektionsgrupper. AUC for ROC -analyse udføres, hvor det er relevant.
Første indsamlede prøve inden for den første uge efter optagelse
Viral værtsrespons direkte LS-TA i granulocytter (type I interferon-respons)
Tidsramme: Første indsamlede prøve inden for den første uge efter optagelse

Direkte LS-TA er en slags RBB, der let kan kvantificeres ved qPCR eller DPCR af et par gener, RBB-tællergenet og RBB-nævnergenet. Biomarkøren er forholdet mellem de 2 gener. Enkelt celletype: Granulocyt. RBB -tællergen: RSAD2 eller IFIT1.

RBB -nævnergen: SAT1 eller SRGN. De forskellige RBB sammenlignes med hensyn til deres følsomhed/specificitet af diagnostisk ydeevne i infektionsgrupperne. AUC for ROC -analyse udføres, hvor det er relevant.
Første indsamlede prøve inden for den første uge efter optagelse
Bakteriel infektions værtsreaktion direkte LS-TA i monocytter (pro-inflammatorisk respons)
Tidsramme: Første indsamlede prøve inden for den første uge efter optagelse
Direkte LS-TA er en slags RBB, der let kan kvantificeres ved qPCR eller digital PCR (DPCR) af et par gener, RBB-tællergenet og RBB-nævnergenet. Biomarkøren er forholdet mellem de 2 gener. Enkelt celletype: monocyt. RBB -tællergen: VNN1 eller NLRC4. RBB -nævnergen: PSAP, CTSS eller CPVL. De forskellige RBB'er sammenlignes med hensyn til deres følsomhed/specificitet af diagnostisk ydeevne i infektionsgrupperne. AUC for ROC -analyse udføres, hvor det er relevant.
Første indsamlede prøve inden for den første uge efter optagelse
Bakteriel infektions værtsreaktion direkte LS-TA i granulocytter (pro-inflammatorisk respons)
Tidsramme: Første indsamlede prøve inden for den første uge efter optagelse

Direkte LS-TA er en slags RBB, der let kan kvantificeres ved qPCR eller DPCR af et par gener, RBB-tællergenet og RBB-nævnergenet. Biomarkøren er forholdet mellem de 2 gener. Enkelt celletype: Granulocyt. RBB -tællergen: ALPL, ANXA3 eller Arg1.

RBB -nævnergen: SAT1 eller SRGN. De forskellige RBB sammenlignes med hensyn til deres følsomhed/specificitet af diagnostisk ydeevne i infektionsgrupperne. AUC for ROC -analyse udføres, hvor det er relevant.
Første indsamlede prøve inden for den første uge efter optagelse
Aktiv TB-værtsreaktion Direkte LS-TA i monocytter (Type II Interferon Response)
Tidsramme: Første indsamlede prøve inden for den første uge efter optagelse

Direkte LS-TA er en slags RBB, der let kan kvantificeres ved qPCR eller DPCR af et par gener, RBB-tællergenet og RBB-nævnergenet. Biomarkøren er forholdet mellem de 2 gener. Enkelt celletype: monocyt.

RBB -tællergen: WARS1, ATF3 eller CALHM6. RBB -nævnergen: PSAP, CTSS eller CPVL. De forskellige RBB sammenlignes med hensyn til deres følsomhed/specificitet af diagnostisk ydeevne i infektionsgrupper. AUC for ROC -analyse udføres, hvor det er relevant.
Første indsamlede prøve inden for den første uge efter optagelse
Aktiv TB-værtsreaktion Direkte LS-TA i granulocytter (type II interferon-respons)
Tidsramme: Første indsamlede prøve inden for den første uge efter optagelse

Direkte LS-TA er en slags RBB, der let kan kvantificeres ved qPCR eller DPCR af et par gener, RBB-tællergenet og RBB-nævnergenet. Biomarkøren er forholdet mellem de 2 gener. Enkelt celletype: Granulocyt. RBB -tællergen: ANKRD22, BATF2, CD274, FCGR1A eller ETV7.

RBB -nævnergen: SAT1 eller SRGN. De forskellige RBB sammenlignes med hensyn til deres følsomhed/specificitet af diagnostisk ydeevne i infektionsgrupper. AUC for ROC -analyse udføres, hvor det er relevant.
Første indsamlede prøve inden for den første uge efter optagelse

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Direkte LS-TA-resultater distribution og median af disse direkte LS-TA RBB i infektionsgrupper
Tidsramme: Første indsamlede prøve inden for den første uge efter optagelse
Den statistiske fordeling af biomarkøren og den statistiske sammenligning med kontrolområdet eller sammenligningen med kontrolgruppens median. Resultaterne rapporteres som P-værdier af de statistiske test.
Første indsamlede prøve inden for den første uge efter optagelse
Metodevaluering for at sammenligne ydelsen af ​​kvantitativ PCR og digital PCR
Tidsramme: Første indsamlede prøve inden for den første uge efter optagelse

Evaluer analysens ydelse og præcision af både TA -kvantificeringsmetoder: kvantitativ PCR og digital PCR.

Kvantitative PCR-resultater vil blive rapporteret som delta-delta CT-værdier. Digitale PCR -resultater rapporteres som forhold mellem 2 tællinger. Og konverterede derefter til multipel af gennemsnit/median i kontrolkontrol (MOM) til sammenligning med delta-delta CT-værdier.
Første indsamlede prøve inden for den første uge efter optagelse

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Sponsor

Chinese University of Hong Kong

Publikationer og nyttige links

Den person, der er ansvarlig for at indtaste oplysninger om undersøgelsen, leverer frivilligt disse publikationer. Disse kan handle om alt relateret til undersøgelsen.

Generelle publikationer

Hjælpsomme links

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Anslået)

1. februar 2025

Primær færdiggørelse (Anslået)

1. september 2028

Studieafslutning (Anslået)

1. december 2028

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

18. februar 2025

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

20. februar 2025

Først opslået (Faktiske)

25. marts 2025

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

25. marts 2025

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

27. februar 2025

Sidst verificeret

1. februar 2025

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Nøgleord

Yderligere relevante MeSH-vilkår

Andre undersøgelses-id-numre

  • Direct LS-TA prospective study

Plan for individuelle deltagerdata (IPD)

Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?

UBESLUTET

IPD-planbeskrivelse

Beskrivende statistikker over resultater vil blive givet på en rimelig anmodning.

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

produkt fremstillet i og eksporteret fra U.S.A.

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Infektion

Kliniske forsøg med Ingen intervention

Søg i lignende forsøg

Sponsorer og samarbejdspartnere

Medicinske tilstande

Narkotikainterventioner

CROs by country

CROs in Greece

Betingelser

Sjældne sygdomme

Narkotikainterventioner

Kosttilskud

Sponsor / samarbejdspartnere

Placeringer

Abonner