乳児疝痛に対する授乳中の母親によるフェンネル種子浸出液摂取の効果 (BabyGut)

本プロジェクトは、母体によるフェンネル浸出液の摂取と、それに伴う母乳および乳児腸内の微生物変化の影響を調査します。 民間療法の一部として母親から有益な効果が報告されていますが、これは制御試験では研究されていません。

本試験は、フェンネル化合物が母乳を介して乳児の疝痛緩和効果を発揮するメカニズムを解明することを目的としています。 研究者は、経口投与されたフェンネル種子浸出液が監視された症状または微生物パラメータに影響を与えるかどうか、および疝痛のある乳児とない乳児の間で糞便内細菌叢の組成が異なるかどうかを判断します。 母親には、フェンネル種子（Foeniculum vulgare var. dulce）（20 g/L、1 L/日）の浸出液を1週間飲用するよう依頼します。 母乳および糞便サンプルは、治療開始時（0日目）と治療終了時（7日目）にマイクロバイオーム分析のために収集されます。

サンプルは、細菌群集の16S rRNA遺伝子増幅によるイルミナシーケンシング用に調整されます。 生リードは、イルミナMiSeqシステムからfastq形式で抽出され、DADA2を使用したQIIME2パッケージで処理され、アンプリコン配列バリアント（ASV）とそれらのサンプル間での相対的な存在量が推定されます。 分類は、Silvaデータベースの事前学習済みナイーブベイズ分類器を使用したq2 feature-classifierでASVに割り当てられます。 種の同定については、Basic Local Alignment Search Tool（BLAST）アルゴリズムを使用してGenBank DNAデータベースで配列をさらに分析します。

アルファ多様性は、分類群数、個体数 - アンプリコン配列バリアント（ASV）、優占度（1-シンプソン指数）、マーガレフの豊富さ指数、均等度、およびChao1を使用して決定されます。 アルファ多様性の結果は、ウィルコクソンの符号順位検定を使用して介入前後で比較されます。 ベータ多様性は、ASVのブレイ・カーティス距離行列とPERMANOVAに基づく主座標分析（PCoA）を使用して測定されます。 ウィルコクソンの符号順位検定は、介入前（0日目）と介入後（7日目）の属および種レベルでの正規化されたASVを比較するために使用されます。