골육종 환자의 혈액 샘플 연구
2016년 5월 17일 업데이트: Children's Oncology Group
골육종의 유전적 위험인자에 대한 후향적 연구
이 연구 시험은 골육종 환자의 혈액 샘플을 연구합니다.
골육종 환자의 혈액 샘플에서 발견된 유전자를 연구하면 의사가 질병과 관련된 바이오마커를 식별하는 데 도움이 될 수 있습니다.
연구 개요
상세 설명
기본 목표:
I. 국립 아동 종양학 그룹(COG) OS 생물학 연구(P9851 및 후속 연구 AOST06B1)의 사례를 사용하여 골육종(OS)에서 대규모 후보 유전자 연관 연구를 수행합니다.
2차 목표:
I. OS의 GWAS(genome-wide association study)를 수행한다. II. 추정 기능 유전자좌를 식별하기 위해 OS와 관련된 게놈 영역을 미세 매핑합니다.
III. 생식선 OS 데옥시리보핵산(DNA) 샘플의 전체 엑솜 시퀀싱을 수행합니다.
IV. OS와 관련된 유망한 유전 변이의 기능적 의미를 조사합니다.
개요:
혈액 샘플은 일반적인 단일 뉴클레오티드 다형성 및 일배체형의 다형성 분석을 거쳐 유전적 변이, 유전자-유전자 상호 작용 및 인구 구조를 조사합니다.
연구 유형
관찰
등록 (실제)
1000
연락처 및 위치
이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.
연구 장소
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California
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Arcadia, California, 미국, 91006-3776
- Children's Oncology Group
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참여기준
연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.
자격 기준
공부할 수 있는 나이
- 어린이
- 성인
- 고령자
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
아니
연구 대상 성별
모두
샘플링 방법
확률 샘플
연구 인구
COG 기관에서 본 모든 골육종 환자는 자격이 있습니다.
설명
포함 기준:
- 임상 시험 COG-P9851 및 COG-AOST06B1에서 수집한 혈액 샘플
공부 계획
이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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보조 상관 관계(골육종 유전 위험)
혈액 샘플은 일반적인 단일 뉴클레오티드 다형성 및 일배체형의 다형성 분석을 거쳐 유전적 변이, 유전자-유전자 상호 작용 및 인구 구조를 조사합니다.
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상관 연구
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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모든 SNP에 대한 Hardy-Weinberg 평형
기간: 기준선
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카이 제곱 검정에 의해 모든 SNP에서 결정됩니다.
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기준선
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OS와 관련된 SNP
기간: 기준선
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로지스틱 회귀는 공동 우성, 우성 및 열성 유전 모델 하에서 각 SNP와 OS 사이의 연관성에 대한 오즈비 및 95% 신뢰 구간을 추정하는 데 사용될 것입니다.
성별, 종양 하위 유형 및 결과 차이를 조사하기 위해 층화 분석을 수행할 것입니다.
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기준선
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유전자-유전자 상호 작용
기간: 기준선
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곱셈 모델을 사용하여 평가합니다.
일배체형은 베이지안 알고리즘과 기대 최대화 알고리즘을 모두 사용하여 구성됩니다.
사례와 대조군 간의 차이는 일배체형 사후 확률을 가중치로 사용하여 반복적인 방식으로 회귀 계수를 업데이트하는 HaploStats로 평가됩니다.
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기준선
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생존 결과
기간: 기준선
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Kaplan-Meier 생존 곡선을 사용하여 유전자형과 관련된 결과를 결정합니다.
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기준선
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전체 엑솜 변형 유전자좌
기간: 기준선
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각 전체 엑솜 변형 유전자좌의 주석 및 필터링은 맞춤형 소프트웨어 파이프라인을 사용하여 수행됩니다.
OS 케이스가 2개 이상인 변형이 검증된 후 추가 OS 케이스에 복제됩니다(이전에 국제 협력업체로부터 GWAS용으로 받은 샘플).
변이체는 또한 알려진 생물학적으로 타당한 경로 및 유전자에 존재하는지에 대해 평가될 것입니다.
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기준선
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공동 작업자 및 조사자
여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.
수사관
- 수석 연구원: Sharon Savage, MD, Children's Oncology Group
연구 기록 날짜
이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.
연구 주요 날짜
연구 시작
2009년 1월 1일
기본 완료 (실제)
2016년 5월 1일
연구 등록 날짜
최초 제출
2009년 8월 6일
QC 기준을 충족하는 최초 제출
2009년 8월 6일
처음 게시됨 (추정)
2009년 8월 7일
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (추정)
2016년 5월 19일
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
2016년 5월 17일
마지막으로 확인됨
2016년 5월 1일
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
추가 관련 MeSH 약관
기타 연구 ID 번호
- AOST08B1 (기타 식별자: CTEP)
- U10CA098543 (미국 NIH 보조금/계약)
- NCI-2011-02192 (레지스트리 식별자: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
- COG-AOST08B1 (기타 식별자: Children's Oncology Group)
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