Исследование образцов крови больных остеосаркомой
17 мая 2016 г. обновлено: Children's Oncology Group
Ретроспективное исследование генетических факторов риска остеосаркомы
В этом исследовательском испытании изучаются образцы крови пациентов с остеосаркомой.
Изучение генов, обнаруженных в образцах крови пациентов с остеосаркомой, может помочь врачам идентифицировать биомаркеры, связанные с заболеванием.
Обзор исследования
Статус
Завершенный
Вмешательство/лечение
Подробное описание
ОСНОВНАЯ ЦЕЛЬ:
I. Провести крупномасштабное исследование ассоциации генов-кандидатов при остеосаркоме (ОС) с использованием случаев из биологического исследования ОС Национальной группы детской онкологии (COG) (P9851 и последующее исследование AOST06B1).
ВТОРИЧНЫЕ ЦЕЛИ:
I. Провести полногеномное ассоциативное исследование (GWAS) OS. II. Нанесите на карту геномные области, связанные с ОС, для выявления предполагаемых функциональных локусов.
III. Проведите полноэкзомное секвенирование образцов дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК) OS зародышевой линии.
IV. Изучите функциональные последствия многообещающих генетических вариантов, связанных с ОС.
КОНТУР:
Образцы крови подвергаются анализу полиморфизма распространенных однонуклеотидных полиморфизмов и гаплотипов для изучения генетической изменчивости, межгенных взаимодействий и структуры популяции.
Тип исследования
Наблюдательный
Регистрация (Действительный)
1000
Контакты и местонахождение
В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.
Места учебы
-
-
California
-
Arcadia, California, Соединенные Штаты, 91006-3776
- Children's Oncology Group
-
-
Критерии участия
Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Ребенок
- Взрослый
- Пожилой взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Нет
Полы, имеющие право на обучение
Все
Метод выборки
Вероятностная выборка
Исследуемая популяция
Все пациенты с остеосаркомой, наблюдаемые в учреждениях COG, имеют право
Описание
Критерии включения:
- Образцы крови, полученные в ходе клинических испытаний COG-P9851 и COG-AOST06B1.
Учебный план
В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Вспомогательно-коррелятивные (генетический риск остеосаркомы)
Образцы крови подвергаются анализу полиморфизма распространенных однонуклеотидных полиморфизмов и гаплотипов для изучения генетической изменчивости, межгенных взаимодействий и структуры популяции.
|
Коррелятивные исследования
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Равновесие Харди-Вайнберга для всех SNP
Временное ограничение: Базовый уровень
|
Определяется по всем SNP с помощью критерия хи-квадрат.
|
Базовый уровень
|
|
SNP, связанные с ОС
Временное ограничение: Базовый уровень
|
Логистическая регрессия будет использоваться для оценки отношения шансов и 95% доверительных интервалов для связи между каждым SNP и OS в кодоминантных, доминантных и рецессивных генетических моделях.
Будет проведен стратифицированный анализ для изучения различий пола, подтипа опухоли и исходов.
|
Базовый уровень
|
|
Ген-генные взаимодействия
Временное ограничение: Базовый уровень
|
Оценивается с помощью мультипликативной модели.
Гаплотипы будут построены с использованием как байесовского алгоритма, так и алгоритма максимизации ожидания.
Различия между случаями и контролем будут оцениваться с помощью HaploStats, который использует апостериорные вероятности гаплотипов в качестве весов для итеративного обновления коэффициентов регрессии.
|
Базовый уровень
|
|
Результаты выживания
Временное ограничение: Базовый уровень
|
Кривые выживаемости Каплана-Мейера будут использоваться для определения результата относительно генотипа.
|
Базовый уровень
|
|
Полноэкзомные варианты локусов
Временное ограничение: Базовый уровень
|
Аннотирование и фильтрация каждого варианта локуса полного экзома будут выполняться с использованием специального программного конвейера.
Варианты в >= 2 случаях OS будут проверены, а затем впоследствии воспроизведены в дополнительных случаях OS (образцы, ранее полученные для GWAS от международных сотрудников).
Варианты также будут оцениваться на присутствие в известных биологически вероятных путях и генах.
|
Базовый уровень
|
Соавторы и исследователи
Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.
Спонсор
Соавторы
Следователи
- Главный следователь: Sharon Savage, MD, Children's Oncology Group
Даты записи исследования
Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.
Изучение основных дат
Начало исследования
1 января 2009 г.
Первичное завершение (Действительный)
1 мая 2016 г.
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
6 августа 2009 г.
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
6 августа 2009 г.
Первый опубликованный (Оценивать)
7 августа 2009 г.
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Оценивать)
19 мая 2016 г.
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
17 мая 2016 г.
Последняя проверка
1 мая 2016 г.
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- AOST08B1 (Другой идентификатор: CTEP)
- U10CA098543 (Грант/контракт NIH США)
- NCI-2011-02192 (Идентификатор реестра: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
- COG-AOST08B1 (Другой идентификатор: Children's Oncology Group)
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .
Клинические исследования лабораторный анализ биомаркеров
-
Sonde HealthMontefiore Medical CenterАктивный, не рекрутирующийАстмаСоединенные Штаты
-
Vanderbilt University Medical Center4DMedicalЗавершенный
-
University of MiamiАктивный, не рекрутирующий