Étude d'échantillons de sang de patients atteints d'ostéosarcome
17 mai 2016 mis à jour par: Children's Oncology Group
Étude rétrospective des facteurs de risque génétiques de l'ostéosarcome
Cet essai de recherche étudie des échantillons de sang de patients atteints d'ostéosarcome.
L'étude des gènes trouvés dans des échantillons de sang de patients atteints d'ostéosarcome peut aider les médecins à identifier les biomarqueurs liés à la maladie.
Aperçu de l'étude
Statut
Complété
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
OBJECTIF PRINCIPAL:
I. Mener une étude d'association de gènes candidats à grande échelle dans l'ostéosarcome (OS) en utilisant des cas de l'étude nationale de biologie OS du Children's Oncology Group (COG) (P9851 et étude ultérieure AOST06B1).
OBJECTIFS SECONDAIRES :
I. Mener une étude d'association à l'échelle du génome (GWAS) de l'OS. II. Fine-map régions génomiques associées à l'OS pour identifier les loci fonctionnels putatifs.
III. Effectuer le séquençage de l'exome entier d'échantillons d'acide désoxyribonucléique (ADN) OS de lignée germinale.
IV. Étudier les implications fonctionnelles des variantes génétiques prometteuses associées à la SG.
CONTOUR:
Des échantillons de sang subissent une analyse de polymorphisme des polymorphismes et des haplotypes mononucléotidiques communs pour examiner la variation génétique, les interactions gène-gène et la structure de la population.
Type d'étude
Observationnel
Inscription (Réel)
1000
Contacts et emplacements
Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.
Lieux d'étude
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California
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Arcadia, California, États-Unis, 91006-3776
- Children's Oncology Group
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Critères de participation
Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
- Enfant
- Adulte
- Adulte plus âgé
Accepte les volontaires sains
Non
Sexes éligibles pour l'étude
Tout
Méthode d'échantillonnage
Échantillon de probabilité
Population étudiée
Tous les patients atteints d'ostéosarcome vus dans les établissements du COG sont éligibles
La description
Critère d'intégration:
- Échantillons de sang prélevés lors des essais cliniques COG-P9851 et COG-AOST06B1
Plan d'étude
Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
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Ancillaire-corrélatif (risque génétique d'ostéosarcome)
Des échantillons de sang subissent une analyse de polymorphisme des polymorphismes et des haplotypes mononucléotidiques communs pour examiner la variation génétique, les interactions gène-gène et la structure de la population.
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Études corrélatives
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Équilibre de Hardy-Weinberg sur tous les SNP
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Déterminé sur tous les SNP par des tests du chi carré.
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SNP associés au système d'exploitation
Délai: Ligne de base
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La régression logistique sera utilisée pour estimer les rapports de cotes et les intervalles de confiance à 95 % pour l'association entre chaque SNP et OS sous des modèles génétiques co-dominants, dominants et récessifs.
Des analyses stratifiées seront effectuées pour examiner le sexe, le sous-type de tumeur et les différences de résultats.
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Interactions gène-gène
Délai: Ligne de base
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Évalué à l'aide d'un modèle multiplicatif.
Les haplotypes seront construits à l'aide d'algorithmes bayésiens et d'algorithmes de maximisation des attentes.
Les différences entre les cas et les témoins seront évaluées avec HaploStats qui utilise les probabilités postérieures d'haplotype comme poids pour mettre à jour les coefficients de régression de manière itérative.
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Résultats de survie
Délai: Ligne de base
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Les courbes de survie de Kaplan-Meier seront utilisées pour déterminer les résultats par rapport au génotype.
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Locus variants de l'exome entier
Délai: Ligne de base
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L'annotation et le filtrage de chaque locus variant d'exome entier seront effectués à l'aide d'un pipeline logiciel personnalisé.
Les variantes dans >= 2 cas d'OS seront validées, puis répliquées dans d'autres cas d'OS (échantillons précédemment reçus pour le GWAS de collaborateurs internationaux).
Les variantes seront également évaluées pour leur présence dans des voies et des gènes biologiquement plausibles connus.
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Ligne de base
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Collaborateurs et enquêteurs
C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.
Parrainer
Collaborateurs
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Sharon Savage, MD, Children's Oncology Group
Dates d'enregistrement des études
Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.
Dates principales de l'étude
Début de l'étude
1 janvier 2009
Achèvement primaire (Réel)
1 mai 2016
Dates d'inscription aux études
Première soumission
6 août 2009
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
6 août 2009
Première publication (Estimation)
7 août 2009
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Estimation)
19 mai 2016
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
17 mai 2016
Dernière vérification
1 mai 2016
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- AOST08B1 (Autre identifiant: CTEP)
- U10CA098543 (Subvention/contrat des NIH des États-Unis)
- NCI-2011-02192 (Identificateur de registre: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
- COG-AOST08B1 (Autre identifiant: Children's Oncology Group)
Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .