Untersuchung von Blutproben von Patienten mit Osteosarkom
17. Mai 2016 aktualisiert von: Children's Oncology Group
Retrospektive Untersuchung genetischer Risikofaktoren für Osteosarkom
In dieser Forschungsstudie werden Blutproben von Patienten mit Osteosarkom untersucht.
Die Untersuchung der Gene in Blutproben von Patienten mit Osteosarkom kann Ärzten dabei helfen, mit der Krankheit verbundene Biomarker zu identifizieren.
Studienübersicht
Status
Abgeschlossen
Intervention / Behandlung
Detaillierte Beschreibung
HAUPTZIEL:
I. Durchführung einer groß angelegten Kandidaten-Gen-Assoziationsstudie bei Osteosarkomen (OS) unter Verwendung von Fällen aus der OS-Biologiestudie der National Children's Oncology Group (COG) (P9851 und Nachfolgestudie AOST06B1).
SEKUNDÄRE ZIELE:
I. Führen Sie eine genomweite Assoziationsstudie (GWAS) des OS durch. II. Feinkartierung genomischer Regionen, die mit OS assoziiert sind, um mutmaßliche funktionelle Loci zu identifizieren.
III. Führen Sie eine Sequenzierung des gesamten Exoms von Keimbahn-OS-Desoxyribonukleinsäure (DNA)-Proben durch.
IV. Untersuchen Sie die funktionellen Auswirkungen vielversprechender genetischer Varianten im Zusammenhang mit OS.
UMRISS:
Blutproben werden einer Polymorphismusanalyse häufiger Einzelnukleotid-Polymorphismen und Haplotypen unterzogen, um genetische Variation, Gen-Gen-Interaktionen und die Populationsstruktur zu untersuchen.
Studientyp
Beobachtungs
Einschreibung (Tatsächlich)
1000
Kontakte und Standorte
Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.
Studienorte
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California
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Arcadia, California, Vereinigte Staaten, 91006-3776
- Children's Oncology Group
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Teilnahmekriterien
Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
- Kind
- Erwachsene
- Älterer Erwachsener
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Nein
Studienberechtigte Geschlechter
Alle
Probenahmeverfahren
Wahrscheinlichkeitsstichprobe
Studienpopulation
Teilnahmeberechtigt sind alle Osteosarkompatienten, die in COG-Einrichtungen behandelt werden
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Blutproben aus den klinischen Studien COG-P9851 und COG-AOST06B1
Studienplan
Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Kohorten und Interventionen
Gruppe / Kohorte |
Intervention / Behandlung |
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Nebenkorrelat (genetisches Osteosarkomrisiko)
Blutproben werden einer Polymorphismusanalyse häufiger Einzelnukleotid-Polymorphismen und Haplotypen unterzogen, um genetische Variation, Gen-Gen-Interaktionen und die Populationsstruktur zu untersuchen.
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Korrelative Studien
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Hardy-Weinberg-Gleichgewicht auf allen SNPs
Zeitfenster: Grundlinie
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Bestimmt für alle SNPs durch Chi-Quadrat-Tests.
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Grundlinie
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Mit dem Betriebssystem verbundene SNPs
Zeitfenster: Grundlinie
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Die logistische Regression wird verwendet, um Quotenverhältnisse und 95 %-Konfidenzintervalle für die Assoziation zwischen jedem SNP und OS unter kodominanten, dominanten und rezessiven genetischen Modellen abzuschätzen.
Es werden geschichtete Analysen durchgeführt, um Geschlecht, Tumorsubtyp und Ergebnisunterschiede zu untersuchen.
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Grundlinie
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Gen-Gen-Interaktionen
Zeitfenster: Grundlinie
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Bewertet mit einem multiplikativen Modell.
Haplotypen werden sowohl mit Bayes'schen als auch mit Erwartungsmaximierungsalgorithmen konstruiert.
Unterschiede zwischen Fällen und Kontrollen werden mit HaploStats ausgewertet, das Haplotyp-Posteriori-Wahrscheinlichkeiten als Gewichte verwendet, um die Regressionskoeffizienten iterativ zu aktualisieren.
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Grundlinie
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Überlebensergebnisse
Zeitfenster: Grundlinie
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Kaplan-Meier-Überlebenskurven werden verwendet, um das Ergebnis relativ zum Genotyp zu bestimmen.
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Grundlinie
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Varianten-Loci des gesamten Exoms
Zeitfenster: Grundlinie
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Die Annotation und Filterung jedes Locus der gesamten Exomvariante wird mithilfe einer benutzerdefinierten Software-Pipeline durchgeführt.
Varianten in >= 2 OS-Fällen werden validiert und anschließend in weiteren OS-Fällen repliziert (Proben, die zuvor für das GWAS von internationalen Mitarbeitern erhalten wurden).
Varianten werden auch auf ihr Vorhandensein in bekannten biologisch plausiblen Signalwegen und Genen untersucht.
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Grundlinie
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Mitarbeiter und Ermittler
Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.
Sponsor
Mitarbeiter
Ermittler
- Hauptermittler: Sharon Savage, MD, Children's Oncology Group
Studienaufzeichnungsdaten
Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.
Haupttermine studieren
Studienbeginn
1. Januar 2009
Primärer Abschluss (Tatsächlich)
1. Mai 2016
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
6. August 2009
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
6. August 2009
Zuerst gepostet (Schätzen)
7. August 2009
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Schätzen)
19. Mai 2016
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
17. Mai 2016
Zuletzt verifiziert
1. Mai 2016
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
- AOST08B1 (Andere Kennung: CTEP)
- U10CA098543 (US NIH Stipendium/Vertrag)
- NCI-2011-02192 (Registrierungskennung: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
- COG-AOST08B1 (Andere Kennung: Children's Oncology Group)
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