- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk forsøg NCT00954473
Undersøgelse af blodprøver fra patienter med osteosarkom
Retrospektiv undersøgelse af genetiske risikofaktorer for osteosarkom
Studieoversigt
Status
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
PRIMÆR MÅL:
I. Udfør en storstilet kandidatgenforeningsundersøgelse i osteosarkom (OS) ved hjælp af cases fra den nationale Children's Oncology Group (COG) OS biologiundersøgelse (P9851 og efterfølgende undersøgelse AOST06B1).
SEKUNDÆRE MÅL:
I. Udfør en genom-wide association study (GWAS) af OS. II. Finkort genomiske regioner forbundet med OS for at identificere formodede funktionelle loci.
III. Udfør hel-eksom-sekventering af germline OS deoxyribonukleinsyre (DNA) prøver.
IV. Undersøg de funktionelle implikationer af lovende genetiske varianter forbundet med OS.
OMRIDS:
Blodprøver gennemgår polymorfianalyse af almindelige enkeltnukleotidpolymorfier og haplotyper for at undersøge genetisk variation, gen-gen-interaktioner og befolkningsstrukturen.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Faktiske)
Kontakter og lokationer
Studiesteder
-
-
California
-
Arcadia, California, Forenede Stater, 91006-3776
- Children's Oncology Group
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Barn
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Køn, der er berettiget til at studere
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Blodprøver indsamlet fra kliniske forsøg COG-P9851 og COG-AOST06B1
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
---|---|
Hjælpekorrelativ (genetisk risiko for osteosarkom)
Blodprøver gennemgår polymorfianalyse af almindelige enkeltnukleotidpolymorfier og haplotyper for at undersøge genetisk variation, gen-gen-interaktioner og befolkningsstrukturen.
|
Korrelative undersøgelser
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
Hardy-Weinberg ligevægt på alle SNP'er
Tidsramme: Baseline
|
Bestemt på alle SNP'er ved chi-kvadrattest.
|
Baseline
|
SNP'er forbundet med OS
Tidsramme: Baseline
|
Logistisk regression vil blive brugt til at estimere oddsforhold og 95 % konfidensintervaller for sammenhængen mellem hver SNP og OS under co-dominante, dominante og recessive genetiske modeller.
Stratificerede analyser vil blive udført for at undersøge køn, tumorsubtype og udfaldsforskelle.
|
Baseline
|
Gen-gen interaktioner
Tidsramme: Baseline
|
Vurderet ved hjælp af en multiplikativ model.
Haplotyper vil blive konstrueret ved hjælp af både Bayesianske og forventningsmaksimerende algoritmer.
Forskelle mellem tilfælde og kontroller vil blive evalueret med HaploStats, som bruger haplotype posteriore sandsynligheder som vægte for at opdatere regressionskoefficienterne på en iterativ måde.
|
Baseline
|
Overlevelsesresultater
Tidsramme: Baseline
|
Kaplan-Meier overlevelseskurver vil blive brugt til at bestemme resultatet i forhold til genotype.
|
Baseline
|
Hel-exom variant loci
Tidsramme: Baseline
|
Annotering og filtrering af hvert hel-exome variant locus vil blive udført ved hjælp af en brugerdefineret software pipeline.
Varianter i >= 2 OS-tilfælde vil blive valideret og derefter replikeret i yderligere OS-tilfælde (prøver, der tidligere er modtaget for GWAS fra internationale samarbejdspartnere).
Varianter vil også blive evalueret for tilstedeværelse i kendte biologisk plausible veje og gener.
|
Baseline
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Samarbejdspartnere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Sharon Savage, MD, Children's Oncology Group
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart
Primær færdiggørelse (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Skøn)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Skøn)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- AOST08B1 (Anden identifikator: CTEP)
- U10CA098543 (U.S. NIH-bevilling/kontrakt)
- NCI-2011-02192 (Registry Identifier: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
- COG-AOST08B1 (Anden identifikator: Children's Oncology Group)
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med Tilbagevendende osteosarkom
-
Children's Oncology GroupNational Cancer Institute (NCI)AfsluttetTilbagevendende osteosarkom | Ildfast osteosarkom | Stage IV osteosarkom AJCC v7 | Stage IVA Osteosarcoma AJCC v7 | Stage IVB Osteosarcoma AJCC v7 | Metastatisk osteosarkomForenede Stater, Canada, Puerto Rico
-
National Cancer Institute (NCI)Aktiv, ikke rekrutterendeTilbagevendende Ewing-sarkom | Tilbagevendende osteosarkom | Stage III osteosarkom AJCC v7 | Stage IV osteosarkom AJCC v7 | Stage IVA Osteosarcoma AJCC v7 | Stage IVB Osteosarcoma AJCC v7 | Metastatisk osteosarkom | Metastatisk Ewing-sarkom | Uoperabelt Ewing-sarkom | Uoperabelt osteosarkomFrankrig
-
National Cancer Institute (NCI)Aktiv, ikke rekrutterendeOndartet gliom | Rhabdoid tumor | Avanceret malignt fast neoplasma | Ildfast malignt fast neoplasma | Tilbagevendende Ependymom | Tilbagevendende Ewing-sarkom | Tilbagevendende hepatoblastom | Tilbagevendende Langerhans Cell Histiocytose | Tilbagevendende ondartet kimcelletumor | Tilbagevendende malignt fast... og andre forholdForenede Stater, Puerto Rico
-
National Cancer Institute (NCI)RekrutteringOndartet gliom | Rhabdoid tumor | Avanceret malignt fast neoplasma | Ildfast malignt fast neoplasma | Tilbagevendende Ependymom | Tilbagevendende Ewing-sarkom | Tilbagevendende hepatoblastom | Tilbagevendende Langerhans Cell Histiocytose | Tilbagevendende ondartet kimcelletumor | Tilbagevendende malignt fast... og andre forholdForenede Stater, Puerto Rico, Australien, Canada
Kliniske forsøg med laboratoriebiomarkøranalyse
-
Liao Jian AnRekrutteringHoved- og halskræftTaiwan
-
Fondation LenvalTrukket tilbage
-
Progenity, Inc.AfsluttetDowns syndrom | Aneuploidi | DiGeorges syndrom | Turners syndrom | Klinefelters syndrom | Kromosom sletning | Edwards syndrom | Patau syndromForenede Stater
-
IRCCS Eugenio MedeaRekrutteringAutismespektrumforstyrrelse | Tidlig indsatsItalien
-
Oregon Health and Science University4DMedicalTilmelding efter invitationLungesygdomme | KOL | Luftvejssygdom | DyspnøForenede Stater
-
IRCCS Eugenio MedeaRekrutteringCerebral Parese | Erhvervet hjerneskadeItalien
-
Modarres HospitalAfsluttetKomplikationer | Billedstyret biopsi | Nyre GlomerulusIran, Islamisk Republik
-
Healthy.io Ltd.Afsluttet
-
Medwave Estudios LimitadaAsociación Chilena de SeguridadUkendtErhvervsmæssig eksponering | Muskuloskeletal sygdomChile
-
Duke UniversityTrukket tilbageAntikoagulation og trombose Point of Care Test (AT-POCT)Forenede Stater