Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Undersøgelse af blodprøver fra patienter med osteosarkom

17. maj 2016 opdateret af: Children's Oncology Group

Retrospektiv undersøgelse af genetiske risikofaktorer for osteosarkom

Dette forskningsforsøg studerer blodprøver fra patienter med osteosarkom. At studere generne fundet i blodprøver fra patienter med osteosarkom kan hjælpe læger med at identificere biomarkører relateret til sygdommen.

Studieoversigt

Detaljeret beskrivelse

PRIMÆR MÅL:

I. Udfør en storstilet kandidatgenforeningsundersøgelse i osteosarkom (OS) ved hjælp af cases fra den nationale Children's Oncology Group (COG) OS biologiundersøgelse (P9851 og efterfølgende undersøgelse AOST06B1).

SEKUNDÆRE MÅL:

I. Udfør en genom-wide association study (GWAS) af OS. II. Finkort genomiske regioner forbundet med OS for at identificere formodede funktionelle loci.

III. Udfør hel-eksom-sekventering af germline OS deoxyribonukleinsyre (DNA) prøver.

IV. Undersøg de funktionelle implikationer af lovende genetiske varianter forbundet med OS.

OMRIDS:

Blodprøver gennemgår polymorfianalyse af almindelige enkeltnukleotidpolymorfier og haplotyper for at undersøge genetisk variation, gen-gen-interaktioner og befolkningsstrukturen.

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Faktiske)

1000

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiesteder

    • California
      • Arcadia, California, Forenede Stater, 91006-3776
        • Children's Oncology Group

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

  • Barn
  • Voksen
  • Ældre voksen

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Køn, der er berettiget til at studere

Alle

Prøveudtagningsmetode

Sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Alle osteosarkompatienter set på COG-institutioner er kvalificerede

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • Blodprøver indsamlet fra kliniske forsøg COG-P9851 og COG-AOST06B1

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

Kohorter og interventioner

Gruppe / kohorte
Intervention / Behandling
Hjælpekorrelativ (genetisk risiko for osteosarkom)
Blodprøver gennemgår polymorfianalyse af almindelige enkeltnukleotidpolymorfier og haplotyper for at undersøge genetisk variation, gen-gen-interaktioner og befolkningsstrukturen.
Korrelative undersøgelser

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Hardy-Weinberg ligevægt på alle SNP'er
Tidsramme: Baseline
Bestemt på alle SNP'er ved chi-kvadrattest.
Baseline
SNP'er forbundet med OS
Tidsramme: Baseline
Logistisk regression vil blive brugt til at estimere oddsforhold og 95 % konfidensintervaller for sammenhængen mellem hver SNP og OS under co-dominante, dominante og recessive genetiske modeller. Stratificerede analyser vil blive udført for at undersøge køn, tumorsubtype og udfaldsforskelle.
Baseline
Gen-gen interaktioner
Tidsramme: Baseline
Vurderet ved hjælp af en multiplikativ model. Haplotyper vil blive konstrueret ved hjælp af både Bayesianske og forventningsmaksimerende algoritmer. Forskelle mellem tilfælde og kontroller vil blive evalueret med HaploStats, som bruger haplotype posteriore sandsynligheder som vægte for at opdatere regressionskoefficienterne på en iterativ måde.
Baseline
Overlevelsesresultater
Tidsramme: Baseline
Kaplan-Meier overlevelseskurver vil blive brugt til at bestemme resultatet i forhold til genotype.
Baseline
Hel-exom variant loci
Tidsramme: Baseline
Annotering og filtrering af hvert hel-exome variant locus vil blive udført ved hjælp af en brugerdefineret software pipeline. Varianter i >= 2 OS-tilfælde vil blive valideret og derefter replikeret i yderligere OS-tilfælde (prøver, der tidligere er modtaget for GWAS fra internationale samarbejdspartnere). Varianter vil også blive evalueret for tilstedeværelse i kendte biologisk plausible veje og gener.
Baseline

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Samarbejdspartnere

Efterforskere

  • Ledende efterforsker: Sharon Savage, MD, Children's Oncology Group

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart

1. januar 2009

Primær færdiggørelse (Faktiske)

1. maj 2016

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

6. august 2009

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

6. august 2009

Først opslået (Skøn)

7. august 2009

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Skøn)

19. maj 2016

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

17. maj 2016

Sidst verificeret

1. maj 2016

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Andre undersøgelses-id-numre

  • AOST08B1 (Anden identifikator: CTEP)
  • U10CA098543 (U.S. NIH-bevilling/kontrakt)
  • NCI-2011-02192 (Registry Identifier: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
  • COG-AOST08B1 (Anden identifikator: Children's Oncology Group)

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Tilbagevendende osteosarkom

Kliniske forsøg med laboratoriebiomarkøranalyse

3
Abonner