Studie van bloedmonsters van patiënten met osteosarcoom
17 mei 2016 bijgewerkt door: Children's Oncology Group
Retrospectieve studie van genetische risicofactoren voor osteosarcoom
Deze onderzoeksproef bestudeert bloedmonsters van patiënten met osteosarcoom.
Het bestuderen van de genen die worden aangetroffen in bloedmonsters van patiënten met osteosarcoom, kan artsen helpen bij het identificeren van biomarkers die verband houden met de ziekte.
Studie Overzicht
Toestand
Voltooid
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
HOOFDDOEL:
I. Voer een grootschalig kandidaat-genassociatieonderzoek uit bij osteosarcoom (OS) met behulp van casussen van de nationale OS-biologiestudie van de Children's Oncology Group (COG) (P9851 en vervolgonderzoek AOST06B1).
SECUNDAIRE DOELSTELLINGEN:
I. Voer een genoombrede associatiestudie (GWAS) van OS uit. II. Fine-map genomische regio's geassocieerd met OS om vermeende functionele loci te identificeren.
III. Voer volledige exome-sequencing uit van kiembaan-OS-desoxyribonucleïnezuur (DNA)-monsters.
IV. Onderzoek de functionele implicaties van veelbelovende genetische varianten geassocieerd met OS.
OVERZICHT:
Bloedmonsters ondergaan polymorfisme-analyse van veelvoorkomende single-nucleotide polymorfismen en haplotypes om genetische variatie, gen-gen-interacties en de populatiestructuur te onderzoeken.
Studietype
Observationeel
Inschrijving (Werkelijk)
1000
Contacten en locaties
In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.
Studie Locaties
-
-
California
-
Arcadia, California, Verenigde Staten, 91006-3776
- Children's Oncology Group
-
-
Deelname Criteria
Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
- Kind
- Volwassen
- Oudere volwassene
Accepteert gezonde vrijwilligers
Nee
Geslachten die in aanmerking komen voor studie
Allemaal
Bemonsteringsmethode
Kanssteekproef
Studie Bevolking
Alle osteosarcoompatiënten die bij COG-instellingen worden gezien, komen in aanmerking
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Bloedmonsters verzameld uit klinische onderzoeken COG-P9851 en COG-AOST06B1
Studie plan
Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Ancillair-correlatief (osteosarcoom genetisch risico)
Bloedmonsters ondergaan polymorfisme-analyse van veelvoorkomende single-nucleotide polymorfismen en haplotypes om genetische variatie, gen-gen-interacties en de populatiestructuur te onderzoeken.
|
Correlatieve studies
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Hardy-Weinberg-evenwicht op alle SNP's
Tijdsspanne: Basislijn
|
Bepaald op alle SNP's door middel van chikwadraattesten.
|
Basislijn
|
|
SNP's geassocieerd met OS
Tijdsspanne: Basislijn
|
Logistische regressie zal worden gebruikt om odds ratio's en 95% betrouwbaarheidsintervallen te schatten voor de associatie tussen elke SNP en OS onder co-dominante, dominante en recessieve genetische modellen.
Gestratificeerde analyses zullen worden uitgevoerd om geslacht, tumorsubtype en uitkomstverschillen te onderzoeken.
|
Basislijn
|
|
Gen-gen interacties
Tijdsspanne: Basislijn
|
Beoordeeld met behulp van een multiplicatief model.
Haplotypes zullen worden geconstrueerd met behulp van zowel Bayesiaanse algoritmen als verwachtingsmaximaliserende algoritmen.
Verschillen tussen gevallen en controles zullen worden geëvalueerd met HaploStats, dat haplotype posterieure waarschijnlijkheden gebruikt als gewichten om de regressiecoëfficiënten op een iteratieve manier bij te werken.
|
Basislijn
|
|
Overlevingsresultaten
Tijdsspanne: Basislijn
|
Kaplan-Meier-overlevingscurven zullen worden gebruikt om de uitkomst ten opzichte van het genotype te bepalen.
|
Basislijn
|
|
Gehele exome variant loci
Tijdsspanne: Basislijn
|
Annotatie en filtering van elke locus met een volledige exome-variant zal worden uitgevoerd met behulp van een aangepaste softwarepijplijn.
Varianten in >= 2 OS-cases worden gevalideerd en vervolgens gerepliceerd in aanvullende OS-cases (voorbeelden die eerder voor de GWAS zijn ontvangen van internationale medewerkers).
Varianten zullen ook worden geëvalueerd op aanwezigheid in bekende biologisch plausibele routes en genen.
|
Basislijn
|
Medewerkers en onderzoekers
Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.
Sponsor
Medewerkers
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Sharon Savage, MD, Children's Oncology Group
Studie record data
Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.
Bestudeer belangrijke data
Studie start
1 januari 2009
Primaire voltooiing (Werkelijk)
1 mei 2016
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
6 augustus 2009
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
6 augustus 2009
Eerst geplaatst (Schatting)
7 augustus 2009
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Schatting)
19 mei 2016
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
17 mei 2016
Laatst geverifieerd
1 mei 2016
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- AOST08B1 (Andere identificatie: CTEP)
- U10CA098543 (Subsidie/contract van de Amerikaanse NIH)
- NCI-2011-02192 (Register-ID: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
- COG-AOST08B1 (Andere identificatie: Children's Oncology Group)
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .