Studio di campioni di sangue da pazienti con osteosarcoma
17 maggio 2016 aggiornato da: Children's Oncology Group
Studio retrospettivo dei fattori di rischio genetici per l'osteosarcoma
Questo studio di ricerca studia i campioni di sangue di pazienti con osteosarcoma.
Lo studio dei geni trovati nei campioni di sangue di pazienti con osteosarcoma può aiutare i medici a identificare i biomarcatori correlati alla malattia.
Panoramica dello studio
Stato
Completato
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
OBIETTIVO PRIMARIO:
I. Condurre uno studio di associazione genica candidato su larga scala nell'osteosarcoma (OS) utilizzando casi dello studio di biologia OS del National Children's Oncology Group (COG) (P9851 e studio successivo AOST06B1).
OBIETTIVI SECONDARI:
I. Condurre uno studio di associazione su tutto il genoma (GWAS) dell'OS. II. Regioni genomiche finemente associate all'OS per identificare i loci funzionali putativi.
III. Eseguire il sequenziamento dell'intero esoma dei campioni di acido desossiribonucleico (DNA) OS germinale.
IV. Indagare sulle implicazioni funzionali delle promettenti varianti genetiche associate all'OS.
CONTORNO:
I campioni di sangue vengono sottoposti all'analisi del polimorfismo dei comuni polimorfismi e aplotipi a singolo nucleotide per esaminare la variazione genetica, le interazioni gene-gene e la struttura della popolazione.
Tipo di studio
Osservativo
Iscrizione (Effettivo)
1000
Contatti e Sedi
Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.
Luoghi di studio
-
-
California
-
Arcadia, California, Stati Uniti, 91006-3776
- Children's Oncology Group
-
-
Criteri di partecipazione
I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
- Bambino
- Adulto
- Adulto più anziano
Accetta volontari sani
No
Sessi ammissibili allo studio
Tutto
Metodo di campionamento
Campione di probabilità
Popolazione di studio
Tutti i pazienti con osteosarcoma visitati presso le istituzioni COG sono idonei
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Campioni di sangue raccolti dagli studi clinici COG-P9851 e COG-AOST06B1
Piano di studio
Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
|---|---|
|
Ancillare-correlativo (rischio genetico di osteosarcoma)
I campioni di sangue vengono sottoposti all'analisi del polimorfismo dei comuni polimorfismi e aplotipi a singolo nucleotide per esaminare la variazione genetica, le interazioni gene-gene e la struttura della popolazione.
|
Studi correlati
|
Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
|
Equilibrio di Hardy-Weinberg su tutti gli SNP
Lasso di tempo: Linea di base
|
Determinato su tutti gli SNP mediante test chi-quadrato.
|
Linea di base
|
|
SNP associati a OS
Lasso di tempo: Linea di base
|
La regressione logistica sarà utilizzata per stimare gli odds ratio e gli intervalli di confidenza al 95% per l'associazione tra ciascun SNP e OS in modelli genetici codominanti, dominanti e recessivi.
Saranno condotte analisi stratificate per esaminare il sesso, il sottotipo di tumore e le differenze di esito.
|
Linea di base
|
|
Interazioni gene-gene
Lasso di tempo: Linea di base
|
Valutato utilizzando un modello moltiplicativo.
Gli aplotipi saranno costruiti utilizzando algoritmi bayesiani e di massimizzazione delle aspettative.
Le differenze tra casi e controlli saranno valutate con HaploStats che utilizza le probabilità posteriori dell'aplotipo come pesi per aggiornare i coefficienti di regressione in modo iterativo.
|
Linea di base
|
|
Esiti di sopravvivenza
Lasso di tempo: Linea di base
|
Le curve di sopravvivenza di Kaplan-Meier saranno utilizzate per determinare l'esito relativo al genotipo.
|
Linea di base
|
|
Loci della variante dell'intero esoma
Lasso di tempo: Linea di base
|
L'annotazione e il filtraggio di ciascun locus variante dell'intero esoma verranno eseguiti utilizzando una pipeline software personalizzata.
Le varianti in >= 2 casi di OS saranno convalidate e successivamente replicate in ulteriori casi di OS (campioni precedentemente ricevuti per il GWAS da collaboratori internazionali).
Le varianti saranno anche valutate per la presenza in percorsi e geni noti biologicamente plausibili.
|
Linea di base
|
Collaboratori e investigatori
Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.
Sponsor
Collaboratori
Investigatori
- Investigatore principale: Sharon Savage, MD, Children's Oncology Group
Studiare le date dei record
Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.
Studia le date principali
Inizio studio
1 gennaio 2009
Completamento primario (Effettivo)
1 maggio 2016
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
6 agosto 2009
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
6 agosto 2009
Primo Inserito (Stima)
7 agosto 2009
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Stima)
19 maggio 2016
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
17 maggio 2016
Ultimo verificato
1 maggio 2016
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
- AOST08B1 (Altro identificatore: CTEP)
- U10CA098543 (Sovvenzione/contratto NIH degli Stati Uniti)
- NCI-2011-02192 (Identificatore di registro: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
- COG-AOST08B1 (Altro identificatore: Children's Oncology Group)
Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .