骨肉腫患者の血液サンプルの研究
2016年5月17日 更新者：Children's Oncology Group
骨肉腫の遺伝的危険因子の遡及的研究
この研究試験では、骨肉腫患者の血液サンプルを研究します。
骨肉腫患者の血液サンプルで見つかった遺伝子を研究することは、医師がこの病気に関連するバイオマーカーを特定するのに役立つ可能性があります。
調査の概要
詳細な説明
第一目的：
I. 全国小児腫瘍グループ（COG）の OS 生物学研究（P9851 および後継研究 AOST06B1）の症例を使用して、骨肉腫（OS）における大規模な候補遺伝子関連研究を実施します。
第二の目的:
I. OS のゲノムワイド関連研究 (GWAS) を実施します。 II. OS に関連するゲノム領域を詳細にマップして、推定上の機能遺伝子座を特定します。
Ⅲ．生殖細胞系 OS デオキシリボ核酸 (DNA) サンプルの全エクソーム シーケンスを実行します。
IV. OS に関連する有望な遺伝子変異の機能的影響を調査します。
概要：
血液サンプルは、一般的な一塩基多型およびハプロタイプの多型分析を受け、遺伝的変異、遺伝子間相互作用、および集団構造を検査します。
研究の種類
観察的
入学 (実際)
1000
連絡先と場所
このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。
研究場所
-
-
California
-
Arcadia、California、アメリカ、91006-3776
- Children's Oncology Group
-
-
参加基準
研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
いいえ
受講資格のある性別
全て
サンプリング方法
確率サンプル
調査対象母集団
COG施設で診察を受けたすべての骨肉腫患者が対象となる
説明
包含基準:
- 臨床試験 COG-P9851 および COG-AOST06B1 から採取された血液サンプル
研究計画
このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
|---|---|
|
補助相関（骨肉腫の遺伝的リスク）
血液サンプルは、一般的な一塩基多型およびハプロタイプの多型分析を受け、遺伝的変異、遺伝子間相互作用、および集団構造を検査します。
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相関研究
|
この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
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すべての SNP に関するハーディ・ワインバーグ均衡
時間枠：ベースライン
|
すべての SNP についてカイ二乗検定によって決定されます。
|
ベースライン
|
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OSに関連するSNP
時間枠：ベースライン
|
ロジスティック回帰を使用して、共優性、優性、および劣性遺伝モデルの下で各 SNP と OS の間の関連性のオッズ比と 95% 信頼区間を推定します。
性別、腫瘍サブタイプ、転帰の違いを調べるために層別分析が行われます。
|
ベースライン
|
|
遺伝子間の相互作用
時間枠：ベースライン
|
乗法モデルを使用して評価されます。
ハプロタイプは、ベイジアン アルゴリズムと期待値最大化アルゴリズムの両方を使用して構築されます。
ケースとコントロール間の差異は、ハプロタイプ事後確率を重みとして使用して回帰係数を反復的に更新する HaploStats で評価されます。
|
ベースライン
|
|
生存の結果
時間枠：ベースライン
|
カプランマイヤー生存曲線は、遺伝子型に関連した転帰を決定するために使用されます。
|
ベースライン
|
|
全エクソーム変異遺伝子座
時間枠：ベースライン
|
各全エクソーム変異体遺伝子座のアノテーションとフィルタリングは、カスタム ソフトウェア パイプラインを使用して実行されます。
2 つ以上の OS ケースのバリアントが検証され、その後、追加の OS ケース (国際協力者から GWAS 用に以前に受け取ったサンプル) で複製されます。
変異体は、既知の生物学的に妥当な経路および遺伝子における存在についても評価されます。
|
ベースライン
|
協力者と研究者
ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。
捜査官
- 主任研究者：Sharon Savage, MD、Children's Oncology Group
研究記録日
これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。
主要日程の研究
研究開始
2009年1月1日
一次修了 (実際)
2016年5月1日
試験登録日
最初に提出
2009年8月6日
QC基準を満たした最初の提出物
2009年8月6日
最初の投稿 (見積もり)
2009年8月7日
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (見積もり)
2016年5月19日
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
2016年5月17日
最終確認日
2016年5月1日
詳しくは
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。
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