차세대 바이오 데이터 기반 게놈 연구 및 코호트 연구를 통해 생성된 유용한 마커의 검증 (miRNA_Chip)
차세대 바이오데이터 기반 게놈 연구 및 코호트 연구로 생성된 유용한 마커의 검증을 통한 다중 바이오마커 개발
연구 개요
상세 설명
- 목적 췌장암 및 담즙의 조기진단 및 치료를 위한 지식기반 통합분석 시스템 개발 및 바이오마커 개발을 위한 유전체 데이터와 임상 데이터의 통합 분석 방법 및 바이오 컨트롤 네트워크 분석 기술을 개발하고자 한다. 덕트 암, 그리고 마지막으로 맞춤형 질병 관리 시스템. 또한 췌장암/담관암 환자의 유전체 데이터와 임상 데이터를 통합 분석하여 찾아낸 췌장암/담관암 특이적 바이오마커인 miRNA를 혈액에 적용하여 연구용 진단 칩의 유효성을 확인하는 것이다. 췌장암/담관암 환자.
- 효과적인 평가 방법
암종별 진단칩을 통한 알고리즘의 판별 및 보정은 모두 10-fold cross-validation(100회 반복)으로 검사한다. 10-fold cross-validation은 데이터를 같은 크기의 데이터 10개로 무작위로 나누어 그 중 9개는 훈련용 모델을 만들고 나머지 1개는 테스트에 적용하는 과정을 100번에 대해 무작위로 독립적으로 반복한다. 타임스.
10-fold cross-validated AUC를 계산하여 암종별 진단 칩의 판별력을 알아보고, 95% 신뢰구간은 비모수적 방법으로 제시하였다.
각 암 유형의 진단 칩의 보정을 볼 수 있도록 10-fold cross-validated 보정 플롯을 제시합니다. Calibration Plot은 예측확률을 순서대로 나열한 후 일정간격으로 나눈 후 각 집단의 예측확률과 실제 암환자의 비율을 비교하여 예측정도를 시각적으로 나타낸다.
그런 다음 동일한 피험자에 대해 기존 암 진단 도구인 CA 19-9의 AUC를 계산하여 95% 신뢰구간을 제시하였다. 암종별 진단 칩과 CA 19-9의 AUC를 비교하기 위해 10-fold cross-validated AUC의 non-parametric method로 p-value를 계산하였다.
연구 유형
등록 (실제)
연락처 및 위치
연구 장소
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Seoul, 대한민국
- Severance Hospital, Yonsei University
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
연구 대상 성별
샘플링 방법
연구 인구
다중 바이오마커 개발 및 진단칩 생산에 사용되는 혈액 샘플의 대상 피험자 수 및 산정 기준은 아래와 같다.
연구 대상자 수: 232명(췌장암 88명, 담도암 101명, 위암 9명, 대장암 5명, 정상군 29명)
설명
포함 기준:
- 조직학적 또는 세포학적으로 진단된 췌장암 또는 담관암 환자
- 환자 연령: 20~80세
- 자발적으로 임상시험에 참여하기로 결정하고 준수에 대한 사전동의서에 서명한 환자
- 한민족
제외 기준:
- 췌장암 및/또는 담도암에 대한 화학 요법 또는 방사선 요법의 이전 병력이 있는 환자
- 임상시험 전 5년 이내에 다른 장기의 암으로 치료 또는 수술을 받은 자
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
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췌장암
췌장암 88
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담관암
담관암 101
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위암
위암 9
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대장 암
결장암 5
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일반 그룹
일반 그룹 29
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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AUC(곡선 아래 면적)
기간: 1주일 이내
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AUC(area under curve)는 암종별 진단칩을 통한 알고리즘을 얼마나 잘 판별하는지 판별하는 지표로 계산된다. Calibration 평가를 위해 Calibration Plot을 제시하여 암종별 진단칩을 통해 알고리즘을 얼마나 잘 교정하는지 확인하고, 암종별 CA 19-9와 진단칩의 AUC 차이를 비교 평가한다. |
1주일 이내
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2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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각 바이오마커의 컷오프, 정확도
기간: 1주일 이내
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진단 칩의 변별력을 극대화하기 위한 각 바이오마커 발현의 cut-off를 계산하여 분석 민감도에 대한 지표로 제시하였다. 진단 칩의 특성을 고려한 정확도를 계산하여 제시합니다. |
1주일 이내
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공동 작업자 및 조사자
스폰서
수사관
- 수석 연구원: Si Young Song, M.D. PhD, Severance Hospital, Yonsei University
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작
기본 완료 (실제)
연구 완료 (실제)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (추정)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
추가 정보
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