Validering av användbara markörer genererade av nästa generations biodatabaserad genomforskning och kohortstudie (miRNA_Chip)

1. Mål Studien kommer att utföras för att utveckla de integrerade analytiska metoderna för genomisk data och klinisk data och biokontrollnätverksanalysen, genom vilken kunskapsbaserat integrerat analyssystem kan utvecklas och sedan biomarkör för tidig diagnos och behandling av pankreascancer och galla kanalcancer, och slutligen det anpassade sjukdomshanteringssystemet. Det är också för att bekräfta effektiviteten av diagnostiskt chip för forskningsändamål genom att applicera bukspottkörtel-/gallgångscancerspecifik biomarkör, miRNA, som hittats genom integrerad analys av genomdata och kliniska data från patienter med cancer i bukspottkörteln/gallgången till blodet av patienter med cancer i bukspottkörteln/gallgången.
2. Effektiv utvärderingsmetod

Diskrimineringen och kalibreringen för algoritm genom det diagnostiska chipet för varje cancertyp kommer alla att undersökas med 10-faldig korsvalidering (100 repetitioner). I den 10-faldiga korsvalideringen delas data slumpmässigt upp i 10 data av samma storlek, bland vilka 9 används för att göra en modell för träning och den återstående 1 används för test, och denna process upprepas slumpmässigt och oberoende i 100 gånger.

Den 10-faldiga korsvaliderade AUC beräknas för att se särskiljningen av diagnostiska chip för varje cancertyp, och 95 % konfidensintervall presenteras med en icke-parametrisk metod.

Den 10-faldiga korsvaliderade kalibreringsplotten presenteras för att se kalibreringen av det diagnostiska chipet för varje cancertyp. Kalibreringsdiagrammet visar visuellt graden av förutsägelse genom att jämföra förutsägelsesannolikheten för varje grupp och förhållandet mellan faktiska cancerpatienter efter att ha listat förutsägelsesannolikheten i ordningen och delat den med regelbundna intervall.

Sedan, för samma ämnen, beräknas AUC för CA 19-9, det befintliga cancerdiagnostiska verktyget, och 95 % konfidensintervall presenteras. För att jämföra det diagnostiska chipet för varje cancertyp och AUC för CA 19-9, beräknas p-värdet med en icke-parametrisk metod av 10-faldigt korsvaliderad AUC.