Validação de marcadores úteis gerados por pesquisa de genoma baseada em dados biológicos de próxima geração e estudo de coorte (miRNA_Chip)

1. Objetivos O estudo será realizado para desenvolver os métodos analíticos integrados de dados genômicos e dados clínicos e a análise de rede de biocontrole, através do qual o sistema de análise integrada baseado em conhecimento pode ser desenvolvido e, em seguida, biomarcador para diagnóstico precoce e tratamento de câncer de pâncreas e bile câncer de duto e, finalmente, o sistema personalizado de gerenciamento de doenças. Além disso, é para confirmar a eficácia do chip de diagnóstico para fins de pesquisa, aplicando o biomarcador específico do câncer pancreático/do ducto biliar, miRNA, encontrado por meio da análise integrada de dados genômicos e dados clínicos de pacientes com câncer pancreático/do ducto biliar ao sangue de pacientes com câncer pancreático/do ducto biliar.
2. Método de avaliação eficaz

A discriminação e a calibração do algoritmo por meio do chip de diagnóstico de cada tipo de câncer serão examinadas usando validação cruzada de 10 vezes (100 repetições). Na validação cruzada de 10 vezes, os dados são divididos aleatoriamente em 10 dados de mesmo tamanho, dos quais 9 são usados ​​na confecção de um modelo para treinamento e o 1 restante é aplicado para teste, e esse processo é repetido de forma aleatória e independente por 100 vezes.

A AUC de validação cruzada de 10 vezes é calculada para ver a discriminação do chip de diagnóstico de cada tipo de câncer, e o intervalo de confiança de 95% é apresentado por método não paramétrico.

O gráfico de calibração com validação cruzada de 10 vezes é apresentado para ver a calibração do chip de diagnóstico de cada tipo de câncer. O gráfico de calibração demonstra visualmente o grau de previsão comparando a probabilidade de previsão de cada grupo e a proporção de pacientes com câncer reais após listar a probabilidade de previsão na ordem e dividi-la em intervalos regulares.

Em seguida, para os mesmos indivíduos, a AUC do CA 19-9, a ferramenta de diagnóstico de câncer existente, é calculada e o intervalo de confiança de 95% é apresentado. Para comparar o chip de diagnóstico de cada tipo de câncer e a AUC de CA 19-9, o valor p é calculado pelo método não paramétrico de AUC de validação cruzada de 10 vezes.