Convalida di marcatori utili generati dalla ricerca sul genoma basata sui dati biologici di nuova generazione e dallo studio di coorte (miRNA_Chip)

1. Obiettivi Lo studio sarà condotto per sviluppare i metodi analitici integrati di dati genomici e dati clinici e l'analisi della rete di biocontrollo, attraverso la quale è possibile sviluppare un sistema di analisi integrato basato sulla conoscenza e quindi biomarcatore per la diagnosi precoce e il trattamento del cancro del pancreas e della bile cancro del dotto e, infine, il sistema di gestione della malattia personalizzato. Inoltre, è per confermare l'efficacia del chip diagnostico a scopo di ricerca applicando il biomarcatore specifico del cancro pancreatico/del dotto biliare, miRNA, trovato attraverso l'analisi integrata dei dati genomici e dei dati clinici di pazienti con cancro del dotto pancreatico/biliare al sangue di pazienti con carcinoma del dotto pancreatico/biliare.
2. Metodo di valutazione efficace

La discriminazione e la calibrazione dell'algoritmo attraverso il chip diagnostico di ciascun tipo di cancro saranno tutte esaminate utilizzando una convalida incrociata di 10 volte (100 ripetizioni). Nella convalida incrociata di 10 volte, i dati vengono divisi casualmente in 10 dati della stessa dimensione, tra i quali 9 vengono utilizzati per creare un modello per l'addestramento e il restante 1 viene applicato per il test, e questo processo viene ripetuto in modo casuale e indipendente per 100 volte.

L'AUC con convalida incrociata di 10 volte viene calcolata per vedere la discriminazione del chip diagnostico di ciascun tipo di cancro e l'intervallo di confidenza del 95% è presentato con un metodo non parametrico.

Viene presentato il grafico di calibrazione con convalida incrociata 10 volte per vedere la calibrazione del chip diagnostico di ciascun tipo di cancro. Il grafico di calibrazione dimostra visivamente il grado di previsione confrontando la probabilità di previsione di ciascun gruppo e il rapporto dei malati di cancro effettivi dopo aver elencato la probabilità di previsione nell'ordine e averla divisa per intervalli regolari.

Quindi, per gli stessi soggetti, viene calcolata l'AUC del CA 19-9, lo strumento diagnostico del cancro esistente, e viene presentato l'intervallo di confidenza al 95%. Per confrontare il chip diagnostico di ciascun tipo di cancro e l'AUC di CA 19-9, il valore p viene calcolato con un metodo non parametrico dell'AUC convalidato in modo incrociato 10 volte.